Suberic acid-d4 (Octanedioic acid-d4)

别名: 辛二酸-D4;辛二酸-D4氘代内标
目录号: V72774 纯度: ≥98%
辛二酸-d4 是辛二酸的氘化形式。
Suberic acid-d4 (Octanedioic acid-d4) CAS号: 19031-57-3
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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Other Forms of Suberic acid-d4 (Octanedioic acid-d4):

  • 辛二酸
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产品描述
辛二酸-d4是辛二酸的氘代形式。研究发现,辛二酸(辛烷二酸)与肉碱-甲酰-丙氨酸转位酶缺乏症(即丙二醇羧化酶缺乏症)有关。
辛二酸-d4(辛二酸-d4)是辛二酸(一种二羧酸)的稳定同位素标记形式。辛二酸是一种二羧酸,其特征在于一条八碳链的两端分别带有两个羧基(-COOH)官能团。在氘代形式(辛二酸-d4)中,四个氢原子被氘原子取代(具体位置为2,2,7,7),导致分子量偏移M+4,分子式变为C₈H10D4O4。未标记的辛二酸与肉碱-酰基肉碱转位酶缺乏症和丙二酰辅酶A脱羧酶缺乏症相关。辛二酸-d4可用作代谢组学和脂质组学中的内标,用于通过气相色谱-质谱联用(GC-MS)或液相色谱-质谱联用(LC-MS)对辛二酸和其他二羧酸进行精确定量分析。
生物活性&实验参考方法
靶点
Not applicable; Suberic acid-d4 is a stable isotope-labeled internal standard for analytical quantification, not a pharmacologically active drug targeting specific biological receptors. The unlabeled parent compound suberic acid (octanedioic acid) is a dicarboxylic acid that has been found to be associated with carnitine-acylcarnitine translocase deficiency and malonyl-CoA decarboxylase deficiency, but it is not a therapeutic target. Suberic acid-d4 is used solely as an internal standard in mass spectrometry and as a tracer in metabolic studies. It is not designed to interact with biological receptors but rather to enable precise quantification of metabolites in complex biological matrices.
体外研究 (In Vitro)
药物化合物中通常包含碳、氢和其他元素的稳定重同位素,主要用作药物研发过程中的定量示踪剂。由于氘代可能影响药物的药代动力学和代谢特性,因此值得关注[1]。
氘代辛二酸(辛二酸-d4)用作内标,在体外不直接发挥药理作用。未标记的辛二酸(辛二酸)是一种二羧酸,与某些代谢紊乱相关。在无细胞体系中,氘代辛二酸-d4用作标准品,用于校准气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)或液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)进行二羧酸分析。它与未标记的辛二酸共洗脱,但可通过质量偏移(M+4)进行区分,从而实现同位素稀释法的精确定量。它用于代谢组学和脂质组学研究中的生物标志物发现和代谢通路分析。它通常不用于无细胞酶活性测定。
体内研究 (In Vivo)
氘代辛二酸(Suberic acid-d4)并非设计用于体内治疗,而是作为代谢研究中的内标。它可以作为示踪剂用于动物体内,以研究二羧酸的代谢。由于它是氘代的(M+4),因此可以通过质谱法将其与内源性辛二酸区分开来,从而实现代谢研究中辛二酸通量的精确定量。这对于研究肉碱-酰基肉碱转位酶缺乏症和丙二酰辅酶A脱羧酶缺乏症等疾病尤为重要,因为在这些疾病中,辛二酸和其他二羧酸会积累。该化合物在代谢组学和脂质组学领域有着特殊的应用。
酶活实验
对于辛二酸的定量LC-MS/MS分析,首先配制浓度为1 mg/mL的氘代辛二酸(d4)水溶液或甲醇溶液作为储备液。在样品制备完成后,向生物样品(血浆、尿液、组织匀浆)中加入已知量(例如10-100 ng/mL)的氘代标准品。为了进行衍生化,使用衍生化试剂(例如3-硝基苯肼或丁胺)使羧酸反应,以提高电离效率。使用C18反相色谱柱,以0.1%甲酸水溶液和乙腈为流动相进行分离。采用负离子电喷雾电离(ESI-)或衍生化后的正离子电喷雾电离(ESI)进行检测,并使用多反应监测(MRM)模式。通过同位素稀释法,根据辛二酸与氘代辛二酸的峰面积比值与校准曲线进行比值定量。
细胞实验
对于基于细胞的代谢组学研究,在合适的培养基中培养细胞。在指定时间点收集细胞,用PBS洗涤,并用冷甲醇/水(80:20 v/v)提取细胞内代谢物。提取前加入已知浓度的辛二酸-d4作为内标(例如,50 ng/mL)。离心去除细胞碎片,用氮气吹干上清液,并按上述方法进行衍生化。使用所述方法进行LC-MS/MS分析。氘代内标可校正样品制备、提取效率、基质效应和离子抑制等方面的任何差异,从而实现对细胞样品中辛二酸和其他二羧酸的准确定量。这对于代谢通路分析和理解细胞功能至关重要。
动物实验
对于体内代谢组学研究,通过灌胃或注射的方式向动物(例如大鼠、小鼠)施用测试化合物。在指定时间点采集血液、尿液和组织样本。向每个样本中加入辛二酸-d4内标(例如,50-100 ng/mL)。用乙腈沉淀蛋白质或进行固相萃取(SPE)。按照上述方法对样本进行衍生化,并通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行分析。使用氘代标准品通过同位素稀释法定量辛二酸和其他二羧酸。该方法用于生物标志物发现、代谢通路分析以及研究药物对代谢的影响,尤其是在脂肪酸氧化障碍和代谢性疾病的背景下。
药代性质 (ADME/PK)
氘代辛二酸:分子式 C₈H₁₀D₄O₄(或 HOOCCD₂(CH₂)₄CD₂COOH)。分子量:178.22 g/mol(未标记的辛二酸为 174.19 g/mol)。外观:白色至类白色固体。溶解性:溶于 DMSO、甲醇和水。储存:粉末密封保存于 -20℃,避光防潮。溶液在 -80℃ 下可保存长达 6 个月;在 -20℃ 下可保存长达 1 个月。纯度:HPLC 测定 ≥98%;同位素富集度:98 原子% D。该化合物含有四个氘原子,是代谢组学和脂质组学中重要的内标物。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
氘代辛二酸在典型的分析工作浓度(ng/mL 至 μg/mL)下毒性较低。未标记的母体化合物辛二酸(辛二酸)是一种天然存在的二羧酸,存在于尿液中,通常认为在生理浓度下是安全的。氘代类似物具有相同的安全性。处理纯化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施:穿戴适当的个人防护装备(实验服、手套、护目镜),避免吸入粉末和接触皮肤/眼睛,操作后彻底洗手。本品不可用于人体治疗。请务必查阅安全数据表 (SDS) 以获取详细的安全信息。仅供研究使用。
参考文献

[1]. Impact of Deuterium Substitution on the Pharmacokinetics of Pharmaceuticals. Ann Pharmacother. 2019 Feb;53(2):211-216.

[2]. General (medium-chain) acyl-CoA dehydrogenase deficiency (non-ketotic dicarboxylic aciduria): quantitative urinary excretion pattern of 23 biologically significant organic acids in three cases. Clin Chim Acta. 1983 Aug 15;132(2):181-91.

其他信息
辛二酸-d4(辛二酸-d4)是辛二酸的氘代衍生物,其中四个氢原子被氘原子取代,导致标记分子和未标记分子之间存在质量差异,从而可以通过质谱法进行区分。它被用作同位素标记的内标,用于精确定量生物样品中的辛二酸和其他二羧酸。研究发现,未标记的辛二酸与肉碱-酰基肉碱转位酶缺乏症和丙二酰辅酶A脱羧酶缺乏症相关。该化合物在代谢组学和脂质组学中具有特殊的应用价值,可用于生物标志物发现、代谢通路分析、药物研发和细胞功能研究。它还可用作分析方法开发和验证的参考标准。仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C8H10D4O4
分子量
178.22
精确质量
178.114
CAS号
19031-57-3
相关CAS号
Suberic acid;505-48-6
PubChem CID
102602162
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
1.496
tPSA
74.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
12
分子复杂度/Complexity
135
定义原子立体中心数目
0
SMILES
[2H]C([2H])(CCCCC([2H])([2H])C(=O)O)C(=O)O
InChi Key
TYFQFVWCELRYAO-NZLXMSDQSA-N
InChi Code
InChI=1S/C8H14O4/c9-7(10)5-3-1-2-4-6-8(11)12/h1-6H2,(H,9,10)(H,11,12)/i5D2,6D2
化学名
2,2,7,7-tetradeuteriooctanedioic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 5.6110 mL 28.0552 mL 56.1104 mL
5 mM 1.1222 mL 5.6110 mL 11.2221 mL
10 mM 0.5611 mL 2.8055 mL 5.6110 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们