Cyclophellitol aziridine

目录号: V73789 纯度: ≥98%
Cyclophellitol aziridine 是一种环酚类似物,也是一种有效的 β-葡萄糖苷酶抑制剂。
Cyclophellitol aziridine CAS号: 136861-97-7
产品类别: Glutathione Peroxidase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
环酚醇氮丙啶是环酚类似物,也是一种强效的β-葡萄糖苷酶抑制剂。
环菲利醇氮丙啶是环菲利醇类似物,也是一种强效的不可逆beta-葡萄糖苷酶抑制剂。它作为一种活性探针(ABP)用于保留beta-葡萄糖苷酶,通过共价修饰其活性位点亲核基团发挥作用。它是研究糖苷酶生物学的重要工具,尤其适用于溶酶体贮积症(如戈谢病)的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
β-Glucosidase[1]
beta-Glucosidase (irreversible covalent inhibitor)
体外研究 (In Vitro)
环菲利醇氮丙啶是一种强效的β-葡萄糖苷酶抑制剂。它是一种基于机制的失活剂,其氮丙啶环开环后与保留β-葡萄糖苷酶的催化亲核试剂形成稳定的共价键。这种不可逆抑制作用使得在复杂的生物样品中对β-葡萄糖苷酶进行基于活性的分析成为可能。该化合物是环菲利醇的类似物,其中环菲利醇的环氧化物被氮丙啶取代,从而增强了其与活性位点亲核试剂的反应活性。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无环菲利醇氮丙啶作为治疗药物的具体体内数据报道。作为一种活性探针,它具有在溶酶体贮积症动物模型中对β-葡萄糖苷酶活性进行体内成像的潜力。与β-葡萄糖苷酶的共价结合使其能够标记并检测组织中的活性酶。体内研究将包括静脉或腹腔注射探针,随后收集组织并进行荧光成像或Western blot分析以检测标记的酶。
酶活实验
将重组人β-葡萄糖苷酶(例如GBA1、GBA2)或组织匀浆中的溶酶体β-葡萄糖苷酶与环己醇氮丙啶(0.1-1000 nM)在柠檬酸-磷酸盐缓冲液(pH 5.5-7.0)中于37℃孵育10-60分钟。不可逆抑制作用呈时间和浓度依赖性。使用荧光底物(例如4-甲基伞形酮-β-D-吡喃葡萄糖苷(4-MU-Glc))测定剩余酶活性。加入甘氨酸-NaOH缓冲液(pH 10.5)终止反应,并在激发波长365 nm、发射波长445 nm处测定荧光强度。根据反应进程曲线确定失活速率常数(kinact)和Ki值。如果探针被荧光标记,则可以通过 SDS-PAGE 和荧光扫描来确认共价结合。
细胞实验
对于基于活性的蛋白质组学分析 (ABPP),将细胞(例如,人成纤维细胞、HeLa 细胞或戈谢病患者细胞)培养于含 10% FBS 的 DMEM 培养基中。用浓度为 0.1-10 uM 的环己醇氮丙啶偶联荧光染料(例如 Cy5 或 BODIPY)处理细胞 1-4 小时。洗涤细胞,裂解细胞,并通过 SDS-PAGE 分离蛋白质。标记的 β-葡萄糖苷酶通过凝胶内荧光扫描进行可视化。或者,在进行 SDS-PAGE 之前,将细胞裂解液与探针预孵育。对于竞争性实验,先用浓度为 0.1-100 uM 的未标记环己醇氮丙啶预处理细胞 1 小时,然后进行探针标记。荧光强度的降低表明与 β-葡萄糖苷酶的特异性结合。细胞活力通过 MTT 或台盼蓝排除法进行评估。
动物实验
目前尚无已发表的环菲利醇氮丙啶的体内动物研究。对于基于活性的探针研究,将该化合物(用荧光染料或生物素标记)配制于生理盐水或PBS缓冲液中,并以0.1-10 mg/kg的剂量通过尾静脉注射或腹腔注射给药于小鼠。循环1-24小时后,处死小鼠,并收集组织(脑、肝、脾、肾、肺)。将组织匀浆后,通过凝胶内荧光扫描或使用链霉亲和素-HRP(如果已生物素化)的Western blot检测标记蛋白。对于竞争性研究,可在给予标记探针之前给予未标记的环菲利醇氮丙啶以评估特异性。也可进行全器官或组织切片的荧光成像。
药代性质 (ADME/PK)
环菲利醇氮丙啶的具体药代动力学数据尚不明确。由于其分子量小、亲水性强(分子量 175.18,LogP -2.3),预计其口服生物利用度低,且由于肾脏排泄迅速,血浆半衰期短。由于其分子较小,可能分布于包括脑在内的组织中。氮丙啶环具有反应活性,可能受到生物硫醇(如谷胱甘肽、半胱氨酸)的亲核攻击,从而导致快速代谢和清除。体内研究中,静脉或腹腔注射优于口服给药。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
环菲利醇氮丙啶目前尚无具体的毒性数据。氮丙啶环具有亲电性,可能与细胞亲核试剂(蛋白质、DNA)发生非特异性反应,从而导致细胞毒性或基因毒性。然而,作为一种基于机制的抑制剂,其设计目的是共价修饰β-葡萄糖苷酶的活性位点,因此其毒性特征可能已在体外和体内得到表征。在基于细胞的研究中,在探针浓度(0.1-10 μM)下未见细胞毒性报道。由于其具有活性亲电基团,因此在研究使用时,应采取标准防护措施(戴手套、穿实验服、在通风橱内操作)。
参考文献

[1]. Exploring functional cyclophellitol analogues as human retaining beta-glucosidase inhibitors. Org Biomol Chem. 2014 Oct 21;12(39):7786-91.

其他信息
环菲利醇氮丙啶(CAS:136861-97-7)是环菲利醇类似物,也是一种强效的不可逆β-葡萄糖苷酶抑制剂。它可作为活性探针(ABP)用于检测β-葡萄糖苷酶,包括溶酶体葡糖脑苷脂酶(GBA1)、非溶酶体葡糖脑苷脂酶(GBA2)以及其他1类和3类糖苷酶。该化合物是研究糖苷酶生物学、酶机制以及开发戈谢病诊断方法的重要研究工具。分子式:C7H13NO4,分子量:175.18。外观:浅棕色至棕色固体。溶解性:溶于DMSO和水。仅供研究使用。参考文献:Li KY等。探索功能性环菲利醇类似物作为人源保留型β-葡萄糖苷酶抑制剂。Org Biomol Chem. 2014;12(39):7786-91。尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C7H13NO4
分子量
175.182422399521
精确质量
175.084
CAS号
136861-97-7
PubChem CID
89599365
外观&性状
Light brown to brown solid-liquid Mixture
LogP
-2.3
tPSA
103
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
12
分子复杂度/Complexity
188
定义原子立体中心数目
6
SMILES
O[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@@H](CO)[C@@H]2[C@H]1N2)O)O
InChi Key
GPIFFOGPRPKRHS-DRYVTRLFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C7H13NO4/c9-1-2-3-4(8-3)6(11)7(12)5(2)10/h2-12H,1H2/t2-,3+,4+,5+,6-,7-/m0/s1
化学名
(1R,2S,3S,4R,5R,6R)-5-(hydroxymethyl)-7-azabicyclo[4.1.0]heptane-2,3,4-triol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 5.7084 mL 28.5421 mL 57.0841 mL
5 mM 1.1417 mL 5.7084 mL 11.4168 mL
10 mM 0.5708 mL 2.8542 mL 5.7084 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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