6-O-Methyldeoxyguanosine (O6-Methyl-2′-deoxyguanosine)

别名: 6-O-甲基脱氧鸟苷(O6-甲基-2′-脱氧鸟苷)
目录号: V75615 纯度: ≥98%
O6-甲基脱氧鸟苷; DNA加合物是嘌呤核苷的类似物。
6-O-Methyldeoxyguanosine (O6-Methyl-2′-deoxyguanosine) CAS号: 964-21-6
产品类别: Nucleoside Antimetabolite/Analog
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
O6-甲基脱氧鸟苷(O6-MDC)是一种DNA加合物,属于嘌呤核苷类似物。嘌呤核苷类似物具有广谱抗癌作用,尤其针对惰性淋巴瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。
6-O-甲基脱氧鸟苷(O6-甲基-2′-脱氧鸟苷)是一种天然存在和人工合成的修饰核苷。它是鸟嘌呤在O6位烷基化形成的DNA加合物。该化合物是一种强效诱变剂,可在DNA复制过程中导致G:C到A:T的转换突变。它是一种用于研究DNA损伤、修复机制(特别是O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)通路)以及癌症分子起源的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary molecular target of 6-O-Methyldeoxyguanosine is the DNA itself, where it acts as a damaged base. In a biological context, it is recognized by the DNA repair protein O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT). MGMT transfers the methyl group from the O6 position of guanine to a cysteine residue in its own active site, thereby repairing the lesion. Unrepaired, this adduct mispairs with thymine during DNA replication.
体外研究 (In Vitro)
在体外,6-O-甲基脱氧鸟苷是研究MGMT活性和DNA修复的标准底物。它用于定量细胞提取物中MGMT的活性,方法是测量氚标记的甲基从DNA加合物转移到MGMT蛋白的量。它也用于引物延伸实验,以证明DNA聚合酶如何绕过这种损伤,导致胸腺嘧啶而非胞嘧啶错误掺入DNA。
体内研究 (In Vivo)
在体内,6-O-甲基脱氧鸟苷是化疗药物(如替莫唑胺 (TMZ),一种胶质母细胞瘤的标准治疗药物)中DNA烷基化剂形成的主要细胞毒性/细胞抑制性损伤。肿瘤中该加合物的水平与TMZ的疗效直接相关,使其成为一种关键的生物标志物。MGMT表达低的肿瘤(无法修复该损伤)对治疗更为敏感。
酶活实验
一种用于检测MGMT活性的无细胞分析方法使用含有6-O-[3H]甲基脱氧鸟苷的DNA。将细胞提取物或纯化的MGMT与放射性标记的DNA孵育。加入蛋白质沉淀溶液终止反应。将蛋白质与DNA分离后,通过液体闪烁计数法测量转移到MGMT蛋白上的氚量。该方法可直接测量修复活性。
细胞实验
在细胞研究中,癌细胞(例如胶质母细胞瘤细胞系)用替莫唑胺等烷化剂处理。收集细胞并分离DNA。通过测量6-O-甲基脱氧鸟苷的水平来评估DNA损伤。或者,通过将细胞裂解液与含有6-O-[3H]甲基脱氧鸟苷的DNA底物孵育,并测量放射性标记物向MGMT蛋白的转移,来定量MGMT活性。
动物实验
在体内研究中,将携带皮下肿瘤异种移植瘤(例如胶质母细胞瘤)的小鼠用替莫唑胺或研究性烷化剂进行治疗。治疗后,切除肿瘤并分离DNA。可通过液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)或放射免疫分析法定量6-O-甲基脱氧鸟苷的水平,从而将加合物的形成与抗肿瘤活性关联起来。这对于烷化剂的药效学评估至关重要。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种修饰核苷,6-O-甲基脱氧鸟苷本身并非药物;因此,其ADME性质无关紧要。当其在体内形成DNA加合物时,其半衰期取决于MGMT的修复速率和细胞分裂速率。在MGMT缺失的情况下(例如,在MGMT甲基化的肿瘤中),该加合物持续存在,其积累会驱动烷化化疗的细胞毒性作用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
6-O-甲基脱氧鸟苷并非治疗药物,而是一种剧毒的DNA损伤。它在DNA中形成后,具有细胞毒性和致突变性。其毒性是烷化剂化疗药物疗效的基础。MGMT缺陷型肿瘤对这种毒性尤为敏感。其毒性并非源于化合物本身,而是源于它所形成的DNA损伤。了解其形成和修复机制对于克服化疗耐药性至关重要。
参考文献

[1]. Robak T, Robak P. Purine nucleoside analogs in the treatment of rarer chronic lymphoid leukemias. Curr Pharm Des. 2012;18(23):3373-88.

其他信息
O(6)-甲基-2'-脱氧鸟苷是一种嘌呤2'-脱氧核糖核苷,其核碱基为O(6)-甲基鸟嘌呤。它在功能上与鸟嘌呤相关。
6-O-甲基脱氧鸟苷是烷化剂(包括香烟烟雾和工业化学品中的烷化剂)引起的典型致突变DNA加合物。它是评估环境致突变物暴露的关键生物标志物。在癌症化疗中,DNA修复蛋白MGMT的活性是预测患者对替莫唑胺反应的重要指标。该加合物是用于治疗脑肿瘤的烷化剂药理学的核心。它被用作研究化合物,以研究化疗耐药机制。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H15N5O4
分子量
281.27
精确质量
281.112
CAS号
964-21-6
PubChem CID
73317
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.84 g/cm3
沸点
674.7ºC at 760 mmHg
闪点
361.9ºC
折射率
1.794
LogP
0.1
tPSA
128.54
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
349
定义原子立体中心数目
3
SMILES
COC1=NC(=NC2=C1N=CN2[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)CO)O)N
InChi Key
BCKDNMPYCIOBTA-RRKCRQDMSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H15N5O4/c1-19-10-8-9(14-11(12)15-10)16(4-13-8)7-2-5(18)6(3-17)20-7/h4-7,17-18H,2-3H2,1H3,(H2,12,14,15)/t5-,6+,7+/m0/s1
化学名
(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-methoxypurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5553 mL 17.7765 mL 35.5530 mL
5 mM 0.7111 mL 3.5553 mL 7.1106 mL
10 mM 0.3555 mL 1.7777 mL 3.5553 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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