(R)-5-O-Benzoyl-1,2-di-O-isopropylidene-alpha-D-xylofuranose

别名: (R) -5-O-苯甲酰基-1,2-二-O-异亚丙基-α-D-基呋喃鼻
目录号: V75629 纯度: ≥98%
(R)-5-O-苯甲酰基-1,2-二-O-异亚丙基-α-D-呋喃木糖是嘌呤核苷的类似物。
(R)-5-O-Benzoyl-1,2-di-O-isopropylidene-alpha-D-xylofuranose CAS号: 6612-91-5
产品类别: Nucleoside Antimetabolite/Analog
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
100mg
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产品描述
(R)-5-O-苯甲酰基-1,2-二-O-异亚丙基-α-D-木糖呋喃糖是嘌呤核苷类似物。嘌呤核苷类似物具有广谱抗癌作用,可靶向惰性淋巴瘤。其抗癌机制依赖于抑制DNA合成和诱导细胞凋亡。
(R)-5-O-苯甲酰基-1,2-二-O-异亚丙基-alpha-D-木糖呋喃糖是一种受保护的碳水化合物衍生物。它是一种合成砌块,用于化学合成各种核苷类似物和其他生物活性分子。它是一种研究级化合物,在药物化学中用于构建更复杂的化合物,而非作为治疗药物本身。异亚丙基和苯甲酰基作为糖羟基的保护基。
生物活性&实验参考方法
靶点
This compound is not a drug and does not have a specific pharmacological target. It is a synthetic intermediate. Its purpose is to be a precursor for the synthesis of nucleosides, which can then target enzymes like DNA polymerases or viral reverse transcriptases. The specific stereochemistry (R) and the alpha configuration define its use as a building block for specific analogs.
体外研究 (In Vitro)
由于该化合物并非药物,而是一种化学工具,因此体外活性测定并不适用。任何体外活性都与由该化合物合成的最终脱保护核苷产物相关。该化合物的价值在于其化学稳定性以及正交保护基团,这些特性使其能够选择性地修饰糖基,从而构建化合物库。
体内研究 (In Vivo)
体内活性不适用。该化合物不用于动物实验。它在化学实验室中进行处理,用于合成其他化合物,这些化合物随后可能进行动物实验。由该结构单元合成的最终脱保护核苷类似物才是用于评估体内疗效的药物。
酶活实验
不对该结构单元本身进行无细胞检测。相反,如果最终合成产物是核苷类似物,则可以进行DNA聚合酶活性测定。将DNA聚合酶、DNA模板和脱氧核苷三磷酸与最终类似物(转化为其三磷酸形式)一起孵育。通过凝胶电泳或闪烁计数来测量对DNA合成的影响。
细胞实验
作为一种化学中间体,该化合物不用于细胞实验,而是用于有机合成反应。典型的合成方案包括在酸性条件下脱除异丙叉基团或选择性地去除苯甲酰基,然后进行糖基化反应以连接核碱基。其纯度可通过薄层色谱(TLC)、高效液相色谱(HPLC)或核磁共振(NMR)进行确认。
动物实验
目前尚无针对该结构单元的动物实验。然而,由该结构单元合成的核苷类似物可用于动物模型。例如,如果合成出具有抗病毒活性的化合物,则可在病毒感染小鼠模型中进行测试。该化合物并非最终的治疗药物,而是一种前体,因此没有直接的体内实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物是用于有机合成的结构单元,而非药物;因此,其ADME性质未进行表征。其分子式为C18H22O6,分子量为334.36。通常以固体形式储存于-20℃,并需防潮。其物理性质(例如,在二氯甲烷中的溶解度)已确定,可用于化学反应。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于该化合物是合成中间体,文献中没有其毒理学数据。操作时需采取标准的实验室安全防护措施(佩戴手套、护目镜和实验服)。作为固体,该化合物通常被认为急性毒性较低。然而,它不宜食用,应被视为潜在的刺激物。
参考文献
[1]. Robak T, Robak P. Purine nucleoside analogs in the treatment of rarer chronic lymphoid leukemias. Curr Pharm Des. 2012;18(23):3373-88.
其他信息
该化合物是碳水化合物化学中的关键手性结构单元。异丙叉基团是保护1,2-二醇的丙酮缩醛基团,而苯甲酰基保护5-羟基。α和R构型对于构建具有特定立体化学结构的核苷至关重要。它可用于合成索非布韦(用于治疗丙型肝炎)或其他抗病毒药物的类似物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H18O6
分子量
294.30
精确质量
294.11
CAS号
6612-91-5
相关CAS号
5-O-Benzoyl-1,2-di-O-isopropylidene-alpha-D-xylofuranose;6022-96-4
PubChem CID
228800
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.253 g/cm3
沸点
432ºC at 760 mmHg
闪点
159.2ºC
LogP
1.08
tPSA
74.22
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
390
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1(OC2C(C(OC2O1)COC(=O)C3=CC=CC=C3)O)C
InChi Key
WKRBIHIDJVMVGS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H18O6/c1-15(2)20-12-11(16)10(19-14(12)21-15)8-18-13(17)9-6-4-3-5-7-9/h3-7,10-12,14,16H,8H2,1-2H3
化学名
(6-hydroxy-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl)methyl benzoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (339.79 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3979 mL 16.9895 mL 33.9789 mL
5 mM 0.6796 mL 3.3979 mL 6.7958 mL
10 mM 0.3398 mL 1.6989 mL 3.3979 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们