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KDM4C-IN-1

目录号: V75853 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
KDM4C-IN-1 (Compound 4d) 是一种有效的 KDM4C 抑制剂，IC50 为 8 nM。
KDM4C-IN-1 CAS号: 52348-60-4
产品类别: Histone Demethylase
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
50mg
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产品描述
KDM4C-IN-1（化合物 4d）是 KDM4C 的强效抑制剂，IC50 为 8 nM。KDM4C-IN-1 可抑制 HepG2 和 A549 细胞的生长，IC50 分别为 0.8 µM 和 1.1 µM。
KDM4C-IN-1（化合物 4d）是一种高效且选择性的小分子抑制剂，可抑制赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶 4C (KDM4C)，也称为 JMJD2C。它是一种表观遗传学研究工具，旨在靶向组蛋白 H3 第 9 位赖氨酸 (H3K9me3) 和第 36 位赖氨酸 (H3K36me3) 的去甲基化。该化合物已显示出显著的抗增殖活性，并被用于研究 KDM4C 在癌症进展和其他疾病中的作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
KDM4
The primary molecular target of KDM4C-IN-1 is the histone demethylase KDM4C (JMJD2C). It exhibits high potency with an IC50 of 8 nM against this enzyme. The compound is designed to inhibit the JmjC domain of KDM4C, which is the catalytic site responsible for the removal of methyl groups from lysine residues on histone tails, thereby modulating chromatin structure and gene expression.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明，KDM4C-IN-1 能有效抑制 KDM4C 的酶活性，IC50 值为 8 nM。这种抑制作用导致细胞增殖减少。它对多种人类癌细胞系均表现出生长抑制作用，包括 HepG2（肝细胞癌）和 A549（肺癌），其 IC50 值分别为 0.8 uM 和 1.1 uM。
体内研究 (In Vivo)
体内研究已证实KDM4C-IN-1具有减缓肿瘤生长的潜力。作为一种KDM4C抑制剂，它旨在通过调节表观遗传过程来抑制依赖于表观遗传调控异常的癌症的生长和进展。具体而言，它被认为可用于研究KDM4C表达异常的癌症，例如白血病。然而，所提供的摘要中并未包含详细的动物异种移植数据。
酶活实验
对于无细胞体系，将纯化的KDM4C酶和生物素标记的组蛋白H3肽（带有特定的甲基化标记，例如H3K9me3）在反应缓冲液中孵育。KDM4C对该肽进行去甲基化，生成甲醛和琥珀酸。可通过荧光检测法测定甲醛的生成量来定量该反应，或通过AlphaLISA或Western blot检测去甲基化产物。在加入底物之前，先将该化合物与酶预孵育。
细胞实验
在细胞实验中，将癌细胞（例如HepG2或A549）接种于多孔板中，并用不同浓度的KDM4C-IN-1（例如0.1 uM至10 uM）处理48至72小时。使用MTT等比色法或基于发光的CellTiter-Glo法检测细胞活力。IC50值由剂量反应曲线得出。还可以通过Western blot检测H3K9/K36甲基化水平的变化，以确认靶向活性。
动物实验
体内疗效通常在小鼠异种移植模型中进行研究。将肿瘤细胞（例如HepG2或A549）皮下植入免疫缺陷小鼠体内。待肿瘤达到合适体积后，将小鼠随机分组，分别接受KDM4C-IN-1或载体对照治疗。给药途径和频率（例如，灌胃或腹腔注射）取决于化合物的生物利用度。定期测量肿瘤体积和体重，以评估抗肿瘤活性和毒性。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献中未提供KDM4C-IN-1的详细ADME（吸收、分布、代谢和排泄）数据。对于体内实验，该化合物可配制成溶剂（例如，DMSO:Tween 80:生理盐水=10:5:85或DMSO:玉米油=10:90）用于腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)，或悬浮于0.5% CMC-Na溶液中用于口服给药，具体配制方法参见制剂指南。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
摘要中未列出KDM4C-IN-1的毒理学数据。该化合物的安全性是其临床前开发过程中正在进行的研究课题。体内研究的主要终点通常是肿瘤生长抑制，而体重变化则作为一般毒性的初步指标。KDM4C是癌症治疗的潜在靶点，但其抑制剂的具体毒性尚未完全明确。
参考文献

[1]. Rational design, synthesis and biological profiling of new KDM4C inhibitors. Bioorg Med Chem. 2020 Jan 1;28(1):115128.
其他信息
KDM4C（JMJD2C）是一种癌基因，在多种人类癌症中经常发生扩增和过表达，包括白血病、食管鳞状细胞癌和前列腺癌。KDM4C-IN-1 是一种用于验证 KDM4C 作为药物靶点的有效工具化合物。该化合物通过抑制 KDM4C，旨在提高 H3K9me3 和 H3K36me3 的水平，从而形成异染色质并抑制癌基因的表达。目前该化合物正处于临床前研究阶段，尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H13N5O3
分子量
299.28
精确质量
299.102
CAS号
52348-60-4
PubChem CID
823993
外观&性状
Orange to red solid powder
LogP
0.097
tPSA
91.9
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
602
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN1C2=NC(=O)N(C(=O)C2=NC(=N1)C3=CC=C(C=C3)OC)C
InChi Key
BVFGFWOGCVXIFG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H13N5O3/c1-18-13(20)10-12(16-14(18)21)19(2)17-11(15-10)8-4-6-9(22-3)7-5-8/h4-7H,1-3H3
化学名
3-(4-methoxyphenyl)-1,6-dimethylpyrimido[5,4-e][1,2,4]triazine-5,7-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ≥ 3 mg/mL (10.02 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3414 mL 16.7068 mL 33.4135 mL
5 mM 0.6683 mL 3.3414 mL 6.6827 mL
10 mM 0.3341 mL 1.6707 mL 3.3414 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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