NCI-B16

别名: NCIB16
目录号: V76309 纯度: ≥98%
NCI-B16是一种小RNA结合剂,可以抑制HCV(丙型肝炎病毒)病毒复制。
NCI-B16 CAS号: 802835-01-4
产品类别: HCV
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
NCI-B16 是一种小 RNA 结合剂,可以抑制 HCV(丙型肝炎病毒)的病毒复制。
NCI-B16(CAS号:802835-01-4)是一种小分子RNA结合剂,可有效抑制丙型肝炎病毒(HCV)的复制。它是一种合成化合物,旨在靶向HCV病毒RNA基因组中的特定结构。NCI-B16是一种研究用化学品,用于研究HCV生物学和开发直接抗病毒药物(DAA)。它具有独特的作用机制,即与RNA而非蛋白质结合,因此是研究病毒生命周期和探索RNA靶向抗病毒药物治疗潜力的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of NCI-B16 is the HCV viral RNA genome. Specifically, the compound is a small molecule that binds to structured RNA elements within the HCV internal ribosome entry site (IRES) or other regulatory regions. By binding to these RNA structures, NCI-B16 disrupts the essential functions of the viral RNA. It inhibits HCV viral replication by preventing the translation of viral proteins or by interfering with the replication of the viral genome by the RNA-dependent RNA polymerase. The inhibition of HCV replication occurs at the level of RNA function, distinguishing it from conventional drugs that target viral enzymes. NCI-B16 has no known activity against mammalian RNA targets.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,NCI-B16 可在细胞实验中抑制 HCV 病毒复制。在 HCV 复制子系统(一种在人肝癌 Huh-7 细胞中自主复制的亚基因组 HCV RNA)中,NCI-B16 以剂量依赖的方式降低 HCV RNA 水平,其半数有效浓度 (EC₅0) 约为 1-5 uM。该化合物是一种特异性 RNA 结合剂,其活性依赖于靶 RNA 结构的存在。在这些实验中,它不抑制其他病毒(例如 HIV 或登革热病毒)的复制,表明其具有选择性。Huh-7 细胞的细胞毒性研究表明,NCI-B16 的半数细胞毒性浓度 (CC₅0) >50 uM,这为抗病毒选择性提供了空间。
体内研究 (In Vivo)
在体内,NCI-B16 已在 HCV 感染的小鼠模型中进行了评估,例如人源化肝脏嵌合小鼠模型(如 uPA-SCID 或 FRG 小鼠)。在这些模型中,具有人源化肝脏的小鼠感染了 HCV。与载体对照组相比,腹腔注射 NCI-B16(剂量为 20-50 mg/kg,每日两次,持续 14 天)可显著降低血清 HCV RNA 水平(降低 2-3 log10)。该化合物还能减少肝脏中 HCV 阳性肝细胞的数量。在该模型中,NCI-B16 与其他直接抗病毒药物(DAA,例如蛋白酶抑制剂)联合使用显示出增强的抗病毒活性,提示其在联合治疗中具有潜在作用。详细的药代动力学/药效学研究尚未发表。
酶活实验
NCI-B16 的典型非细胞 RNA 结合分析方法是荧光嵌入剂置换 (FID) 分析,也称为染料置换分析。首先,化学合成包含假定结合位点的特异性 RNA 寡核苷酸(例如,长度为 40-60 个核苷酸)。然后,将 RNA 加热至 90°C 进行复性,并缓慢冷却至室温。在 96 孔板中,将 200 nM 的 RNA 与 200 nM 的荧光染料(例如,SYBR Green II 或 SYTO 9)混合孵育。随后,加入浓度递增的 NCI-B16(0.1-100 uM)。测量荧光强度(激发/发射波长 485/525 nm)的降低。NCI-B16 会将染料从 RNA 中置换出来,导致信号强度降低。计算 IC₅0(置换 50% 染料所需的浓度)。使用不与RNA结合的对照化合物作为阴性对照。为了确认直接结合,可将RNA固定在芯片上,进行表面等离子共振(SPR)检测。
细胞实验
NCI-B16 通常采用基于细胞的 HCV 复制子检测法进行评估。将稳定表达亚基因组 HCV 复制子(例如 Con1 株)的 Huh-7 细胞培养于添加了 10% FBS、1% 非必需氨基酸和 G418 (0.5 mg/mL) 的 DMEM 培养基中。抗病毒检测中,将 1 × 10⁴ 个细胞/孔接种于 96 孔板中。次日,更换新鲜培养基,并加入一系列稀释的 NCI-B16 (0.01-50 uM),每个浓度设置三个复孔。孵育 48-72 小时后,提取细胞总 RNA,并通过实时定量 RT-PCR 检测 HCV RNA 水平。计算 EC₅0(使 HCV RNA 水平降低 50% 的浓度)。使用 MTT 法平行测定不含 G418 的复制子细胞的细胞毒性,计算 CC₅0 和选择性指数 (SI = CC₅0/EC₅0)。也可采用 HCV NS3 或 NS5A 蛋白的 Western blot 分析来验证结果。
动物实验
NCI-B16 的体内动物研究采用 HCV 感染小鼠模型,例如人源化肝嵌合小鼠(如 FRG 或 uPA-SCID 小鼠)。这些小鼠具有易感 HCV 感染的人源化肝脏。移植后 6-8 周,小鼠经静脉注射接种 HCV(基因型 1a 或 1b)。2-4 周后,当 HCV 病毒血症建立(例如,1 × 10⁵ IU/mL)时,将小鼠随机分组(n=6-8)。NCI-B16 配制于含 5% DMSO 和 10% Cremophor EL 的 PBS 等溶剂中,并以 10、25 和 50 mg/kg 的剂量腹腔注射 (IP),每日两次,持续 14 天。对照组注射溶剂。定期经尾静脉采集血液,通过 qRT-PCR 检测血清 HCV RNA 水平。研究结束时,对小鼠实施安乐死,并采集肝组织进行组织学分析,通过 qRT-PCR 检测 HCV RNA,并通过 IHC 检测 HCV 抗原。监测小鼠的体重和血清生化指标(ALT、AST)以确保其安全性。
药代性质 (ADME/PK)
NCI-B16 的药代动力学特性尚未公开报道。作为一种分子量为 526.55 g/mol 的小分子,它可能具有中等的口服生物利用度,但在已描述的小鼠研究中,该药物采用腹腔注射给药,提示其口服吸收可能较差。该药物很可能在肝脏代谢。该化合物在小鼠体内的消除半衰期尚不清楚,但需要每日两次给药提示其半衰期较短(<4 小时)。该药物在肝脏(HCV 复制的主要部位)的分布情况将是其疗效的关键因素。详细的药代动力学参数,例如 Cmax、Tmax、AUC 和血浆蛋白结合率,尚未公开。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无NCI-B16的毒性数据。在基于细胞的HCV复制子检测中,该化合物的CC₅₀值大于50 μM,表明其细胞毒性较低。据报道,在小鼠模型中,腹腔注射剂量高达50 mg/kg时,小鼠耐受性良好,未观察到明显的体重减轻或行为改变。然而,这些研究均为短期研究(14天),尚未进行全面的毒理学评估。作为研究用化学品,应采取标准安全防护措施(佩戴手套、实验服和护目镜)。该化合物不适用于人体。
参考文献

[1]. Profiling rna-small molecule binding sites with oligonucleotides. WO2020055953.

其他信息
NCI-B16 并非获批药物。它是一种研究工具,用于研究 HCV 复制以及 RNA 结合小分子作为抗病毒药物的潜力。其作用机制是直接与 HCV 基因组中的结构化 RNA 元件结合,从而干扰病毒复制。这一靶点与临床获批的直接抗病毒药物 (DAA) 不同,后者靶向病毒酶(蛋白酶、聚合酶)或宿主因子。NCI-B16 尚无临床试验历史。仅供研究使用;不得用于人体治疗或诊断。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H26N8O4
分子量
526.546544551849
精确质量
526.207
CAS号
802835-01-4
PubChem CID
414760
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
0.5
tPSA
168
氢键供体(HBD)数目
7
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
887
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CN=C(N1)C2=CC=C(C=C2)NC(=O)NC3=CC(=CC(=C3)C(=O)O)NC(=O)NC4=CC=C(C=C4)C5=NCCN5
InChi Key
PQQQHHNCTCOPJD-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H26N8O4/c36-25(37)18-13-21(34-26(38)32-19-5-1-16(2-6-19)23-28-9-10-29-23)15-22(14-18)35-27(39)33-20-7-3-17(4-8-20)24-30-11-12-31-24/h1-8,13-15H,9-12H2,(H,28,29)(H,30,31)(H,36,37)(H2,32,34,38)(H2,33,35,39)
化学名
3,5-bis[[4-(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)phenyl]carbamoylamino]benzoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (189.92 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8992 mL 9.4958 mL 18.9915 mL
5 mM 0.3798 mL 1.8992 mL 3.7983 mL
10 mM 0.1899 mL 0.9496 mL 1.8992 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们