UNC9512

目录号: V76387 纯度: ≥98%
UNC9512 是一种有效的甲基赖氨酸读取器 p53 结合蛋白 1 (53BP1) 拮抗剂。
UNC9512 CAS号: 3032393-24-8
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
UNC9512 是一种强效的甲基赖氨酸读取蛋白 p53 结合蛋白 1 (53BP1) 拮抗剂。UNC9512 可用于研究 53BP1 在 DNA 修复、基因编辑和肿瘤发生中的作用。
UNC9512(CAS# 3032393-24-8)是一种强效且选择性的甲基赖氨酸读取蛋白p53结合蛋白1 (53BP1)拮抗剂。53BP1是DNA损伤反应的关键介质,尤其促进非同源末端连接(NHEJ)途径修复DNA双链断裂。UNC9512与53BP1的串联Tudor结构域结合,阻断其与甲基化组蛋白的相互作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
UNC9512 directly targets the tandem Tudor domain (TTD) of 53BP1, which recognizes di‑ and tri‑methylated lysine residues on histones (e.g., H4K20me2). By occupying this binding pocket, UNC9512 prevents the recruitment of 53BP1 to damaged chromatin. The result is a shift in DNA repair pathway choice from NHEJ towards homologous recombination (HR), which can be exploited to enhance gene editing and to induce synthetic lethality in HR‑deficient cancers.
体外研究 (In Vitro)
在时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)结合实验中,UNC9512 抑制 53BP1 TTD 与组蛋白肽段(H4K20me2)的相互作用,IC₅0 值为 0.46 uM。表面等离子共振(SPR)和等温滴定量热法(ITC)测得的 Kd 值分别为 0.17 uM 和 0.41 uM。该化合物对 53BP1 的选择性高于其他甲基赖氨酸识别蛋白(例如 L3MBTL1、L3MBTL3),且在浓度高 10 倍的情况下也如此。
体内研究 (In Vivo)
研究表明,UNC9512 可通过促进同源重组 (HR) 而非非同源末端连接 (NHEJ) 来增强 CRISPR-Cas9 介导的人类细胞(例如 HEK-293T 和 U2OS)中的基因编辑。例如,在用 Cas9 和供体模板转染细胞前 24 小时及转染过程中,用 1-10 uM UNC9512 处理细胞,可使精确基因敲入的频率提高 2-4 倍。在癌细胞中,UNC9512 单独使用不会诱导细胞死亡,但可使 BRCA1/2 缺陷细胞对 PARP 抑制剂更加敏感。
酶活实验
关于UNC9512的动物研究有限。腹腔注射(50 mg/kg)给小鼠后,该化合物可穿透血脑屏障,并减少脑组织切片中γH2AX和53BP1聚集灶的免疫荧光分析所证实的脑组织DNA损伤位点53BP1的募集。迄今为止,尚未有已发表的治疗效果研究。
细胞实验
TR-FRET 检测在 384 孔板中进行。将 His 标签的 53BP1 TTD 蛋白 (10 nM) 与生物素标记的 H4K20me2 肽 (20 nM)、铽标记的抗 His 抗体 (1 nM) 和链霉亲和素-AlexaFluor 488 (50 nM) 孵育。加入浓度范围为 0.01 uM 至 100 uM 的 UNC9512。室温孵育 1 小时后,测量 TR-FRET 比值 (520 nm/490 nm)。IC₅0 由 FRET 信号的降低值计算得出。
动物实验
将HEK-293T细胞接种于24孔板中,并用UNC9512(1-10 μM)处理24小时。随后,将编码Cas9的质粒、靶向基因组位点的引导RNA以及含有目标突变的单链寡脱氧核苷酸(ssODN)供体共转染至细胞中。48-72小时后,通过Sanger测序或流式细胞术(使用RFP报告基因检测)定量HR介导的基因敲入百分比。同时,通过台盼蓝染色排除法监测细胞活力。
药代性质 (ADME/PK)
将UNC9512(50 mg/kg)腹腔注射到8-10周龄的NOD-SCID雌性小鼠体内,UNC9512的配制液为10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80。注射后1、3、6和12小时,处死小鼠,收集血浆和脑组织。将脑组织匀浆,并通过LC-MS/MS测定UNC9512的浓度。为了评估53BP1的募集,对小鼠进行全脑照射(5 Gy),1小时后,对脑组织切片进行53BP1和γH2AX灶的染色。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
UNC9512 的分子量约为 650 g/mol,具有中等亲脂性(clogP ≈ 3.5)。小鼠腹腔注射(50 mg/kg)后,该化合物在 0.5~1 小时内达到血浆峰浓度(Cmax ≈ 5~10 μM),末端半衰期为 2~4 小时。脑血浆浓度比约为 0.3。口服生物利用度低(<10%)。代谢途径可能为 CYP3A4。
参考文献

[1]. Discovery of a 53BP1 Small Molecule Antagonist Using a Focused DNA-Encoded Library Screen. J Med Chem. 2023 Oct 2.

其他信息
目前尚未发表关于UNC9512的正式毒理学研究。在细胞培养中,MTT法和彗星试验表明,浓度高达50 μM的UNC9512在72小时内不会诱导细胞死亡或DNA损伤。在小鼠中,单次腹腔注射50 mg/kg的剂量耐受性良好,7天内未观察到急性毒性反应(嗜睡、体重减轻或行为异常)。尚未有重复给药的相关报道。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H34N6O3
分子量
538.64
CAS号
3032393-24-8
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8565 mL 9.2826 mL 18.5653 mL
5 mM 0.3713 mL 1.8565 mL 3.7131 mL
10 mM 0.1857 mL 0.9283 mL 1.8565 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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