SMD-3040 TFA

目录号: V76501 纯度: ≥98%
SMD-3040 TFA 是一种选择性 SMARCA2 降解剂。
SMD-3040 TFA 产品类别: Ligands for Target Protein for PROTAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
SMD-3040 TFA 是一种选择性 SMARCA2 降解剂。SMD-3040 TFA 包含 SMARCA2/4 配体、连接子和 VHL 配体,可用于 PROTAC 药物合成。SMD-3040 TFA 在肿瘤异种移植模型中显示出显著的肿瘤生长抑制作用。
SMD-3040 TFA 是一种高效且选择性的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)降解剂,靶向 SMARCA2 蛋白,SMARCA2 是 SWI/SNF 染色质重塑复合物的 ATPase 亚基。TFA 盐用于提高其溶解度和稳定性。SMD-3040 TFA 整合了 SMARCA2/4 配体、连接子和 VHL(Von Hippel-Lindau)E3 泛素连接酶配体,从而实现 SMARCA2 的泛素化和蛋白酶体降解。它是研究癌症合成致死性的前沿研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
SMARCA2 (BRM), an ATPase subunit of the SWI/SNF chromatin-remodeling complex. SMD-3040 TFA is a selective degrader of SMARCA2. It binds to SMARCA2 and simultaneously recruits a VHL E3 ubiquitin ligase, tagging the target protein with ubiquitin and leading to its destruction by the proteasome. It shows high selectivity for SMARCA2 over its paralog SMARCA4 (BRG1).
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,SMD-3040 TFA 是一种强效的 SMARCA2 降解剂,其半数最大降解浓度 (DC50) 为 12 nM,最大降解率 (Dmax) 为 91%。它能有效抑制癌细胞增殖,尤其是那些依赖 SMARCA2 生存的癌细胞,例如 SMARCA4 缺陷型癌细胞。这种降解作用导致显著的抗增殖效应和细胞死亡,表明二者之间存在合成致死关系。
体内研究 (In Vivo)
在体内,SMD-3040 TFA 在异种移植模型中表现出显著的肿瘤生长抑制作用。全身给药可显著抑制依赖于 SMARCA2 的肿瘤。这些体内疗效研究证实,SMARCA2 降解可作为某些癌症(尤其是 SMARCA4 缺失的癌症)的治疗策略,这使得 SMD-3040 成为临床前概念验证研究的宝贵工具。
酶活实验
一种非细胞基的TR-FRET(时间分辨荧光共振能量转移)检测方法可以确认三元复合物的形成。将VHL蛋白(His标签)和SMARCA2蛋白(Flag标签)与浓度递增的SMD-3040 TFA(0-10000 nM)孵育。加入铽标记的抗His抗体和荧光素标记的抗Flag抗体。测量TR-FRET信号,以表明该化合物能够连接E3泛素连接酶和靶蛋白。
细胞实验
将SMARCA4缺陷型非小细胞肺癌细胞(例如NCI-H1299)接种于96孔板中。24小时后,用浓度递增的SMD-3040 TFA(0-1000 nM)处理细胞24-72小时。使用CellTiter-Glo试剂盒评估细胞活力。为进行降解分析,用1-100 nM的化合物处理细胞6-24小时,裂解细胞,并用SMARCA2和SMARCA4抗体进行Western blotting分析。
动物实验
将SMARCA4缺陷型癌细胞(例如NCI-H1299)以5 × 10⁶个细胞/只的剂量皮下植入6-8周龄的雌性BALB/c裸鼠体内。待肿瘤体积达到约150 mm³后,将小鼠随机分组(n=8-10)。每天或隔天腹腔注射SMD-3040 TFA,剂量为1-30 mg/kg,持续14-21天。每2-3天测量一次肿瘤体积,并计算肿瘤生长抑制率(TGI)。
药代性质 (ADME/PK)
SMD-3040 TFA 是一种 PROTAC,分子量为 943.21(游离碱)。作为 TFA 盐,它在 DMSO 中具有良好的溶解性,通常配制成 DMSO/PEG300/Tween-80/生理盐水溶液用于体内给药。其药代动力学特性可能包括短至中等的半衰期(啮齿动物中为 2-6 小时)、中等的清除率和良好的组织分布。TFA 盐可提高其在体外和体内应用中的水溶性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SMD-3040 TFA 是一种研究性化合物,尚未获准用于人体。在临床前异种移植研究中,其在有效剂量(例如,10-30 mg/kg,腹腔注射)下通常耐受性良好,未报告明显的体重减轻或明显的毒性反应。作为一种蛋白质降解剂,其潜在的脱靶降解是一个值得关注的问题,但其对 SMARCA2 相对于 SMARCA4 的选择性很高,表明靶向血液毒性的风险较低。
参考文献

[1]. Yang L, et.al. Discovery of SMD-3040 as a Potent and Selective SMARCA2 PROTAC Degrader with Strong in vivo Antitumor Activity. J Med Chem. 2023 Jul 31.

其他信息
SMD-3040 TFA 是一种高效且选择性的 SMARCA2 PROTAC 降解剂,其半数致死浓度 (DC50) 为 12 nM。它是研究 SMARCA4 突变癌症(例如非小细胞肺癌)中合成致死相互作用的重要工具。该化合物尚未获得 FDA 批准,也未完成临床试验,仅供研究使用。游离碱的 CAS 编号为 3033109-92-8。请以粉末形式储存于 -20℃。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C54H67F3N10O7S
分子量
1057.23
相关CAS号
SMD-3040
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9459 mL 4.7293 mL 9.4587 mL
5 mM 0.1892 mL 0.9459 mL 1.8917 mL
10 mM 0.0946 mL 0.4729 mL 0.9459 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们