NFF-3 TFA

目录号: V76706 纯度: ≥98%
NFF-3 TFA 肽是一种选择性 MMP 底物。
NFF-3 TFA 产品类别: MMP
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
NFF-3 TFA肽是一种选择性MMP底物。NFF-3 TFA选择性地与MMP-3和MMP-10结合并被水解。NFF-3 TFA也能被胰蛋白酶、肝细胞生长因子激活剂和因子Xa切割。使用CyDye Cy3/Cy5Q标记NFF-3 TFA可在细胞实验中产生荧光,并用于检测细胞活力。
NFF-3 TFA 是一种选择性高、灵敏度高的荧光肽底物,可用于检测基质金属蛋白酶 MMP-3(基质溶解素-1)和 MMP-10(基质溶解素-2)。该研究级肽以三氟乙酸盐(TFA 盐)的形式提供,这是肽底物的标准形式,可确保其具有高溶解度和稳定性。其序列为 MCA-Arg-Pro-Lys-Pro-Val-Glu-Nva-Trp-Arg-Lys(DNP)-NH2 (NFF-3),其作用原理为荧光共振能量转移(FRET)。其中,7-甲氧基香豆素-4-乙酰基(MCA)基团作为荧光供体,2,4-二硝基苯基(DNP)基团作为荧光猝灭剂。该肽是检测 MMP-3 和 MMP-10 活性的高效工具。它还能被胰蛋白酶、肝细胞生长因子激活剂和因子Xa切割,使其成为一种用途广泛的蛋白酶底物。当用CyDye对(Cy3/Cy5Q)标记时,可用于基于细胞的检测。
生物活性&实验参考方法
靶点
MMP-3 MMP-10
The primary target of NFF-3 TFA is the active site of matrix metalloproteinases (MMPs), specifically MMP-3 and MMP-10. The peptide is hydrolyzed by these enzymes at a specific cleavage site. The high catalytic efficiency (kcat/Km) of MMP-3 for this substrate (218,000 s-¹ M-¹) indicates a strong interaction, making it a preferred substrate. This specificity allows researchers to measure the proteolytic activity of MMP-3 and MMP-10 in complex biological samples. The peptide also serves as a model substrate to study the mechanisms of other proteases, including trypsin, hepatocyte growth factor activator, and factor Xa, which are involved in various physiological and pathological processes. The CyDye-labeled version is used to visualize these proteolytic events in cell-based assays.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞酶活性测定中,NFF-3 TFA 对 MMP-3 和 MMP-10 具有高活性和选择性。其对 MMP-3 的催化效率 (kcat/Km) 为 218,000 s-¹ M-¹,对于荧光底物而言非常出色。对于 MMP-9,其催化效率则低得多 (kcat/Km = 10,100 s-¹ M-¹),且不会被 MMP-1 或 MMP-2 切割。这种特异性使其成为在其他 MMP 存在的情况下监测 MMP-3 活性的理想选择。在基于细胞的测定中,当用 CyDye 对 (Cy3/Cy5Q) 标记时,由于 FRET 效应,完整的肽段不显示荧光。当被活性 MMP-3 切割时,Cy3 和 Cy5Q 分离,导致 Cy3 荧光强度显著增强,从而可以实时监测蛋白酶活性。这可以直接读取活细胞中 MMP-3 的活性。
体内研究 (In Vivo)
搜索结果中未提供NFF-3 TFA肽的具体体内数据。然而,它可用作体内分子工具来监测MMP-3活性。局部(例如,瘤内注射)或全身给药时,荧光标记(Cy3/Cy5Q)的NFF-3肽可用于对活体动物体内MMP-3高活性区域进行成像。例如,在纤维肉瘤(HT-1080)异种移植小鼠模型中,注射标记的NFF-3探针后,由于MMP-3和MMP-10的切割作用,肿瘤部位会产生强烈的荧光信号。该信号可使用体内荧光成像系统(例如,IVIS)进行检测。由于该肽成本高昂且灵敏度高,TFA盐主要用于体外和离体实验。它可用作蛋白酶活性的直接化学探针。
酶活实验
在96孔黑色板(用于荧光检测)中进行标准的无细胞蛋白酶活性测定。反应混合物(100 uL)包含50 mM Tris-HCl(pH 7.5)、150 mM NaCl、10 mM CaCl2、0.05% Brij-35和10 uM NFF-3 TFA底物。加入10-100 ng重组活性人MMP-3或MMP-10酶启动反应。立即将反应板置于荧光酶标仪中,并在37℃下孵育。每1-2分钟监测一次荧光强度(例如,MCA的激发波长为320/40 nm,发射波长为405/20 nm),持续30-60分钟。荧光强度-时间曲线的初始线性部分用于计算反应速率。进行抑制试验时,先将酶与不同浓度的测试化合物(MMP抑制剂)预孵育15分钟,然后再加入底物。通过绘制抑制率与抑制剂浓度对数的关系图来确定IC50值。加入EDTA(终浓度25 mM)螯合MMP活性所需的钙离子,即可终止反应。
细胞实验
使用荧光底物NFF-3 (Cy3/Cy5Q-NFF-3) 在96孔板中进行基于细胞的MMP-3活性检测。将人纤维肉瘤HT-1080细胞(高表达MMP-3)以每孔20,000个细胞的密度接种于无血清DMEM培养基中,并使其过夜贴壁。然后用PBS洗涤细胞。向细胞中加入终浓度为1-10 uM的Cy3/Cy5Q-NFF-3肽(溶于无血清培养基中)。将培养板置于37℃孵育2-6小时。使用荧光酶标仪,在544 nm激发波长和590 nm发射波长下,定期测量荧光强度。用广谱MMP抑制剂(例如GM6001,10 uM)处理的细胞作为阴性对照,用于确定背景荧光。细胞培养物中荧光强度随时间增加与 MMP-3/10 活性呈正比。该方案可用于在活细胞环境中筛选潜在的 MMP 抑制剂。对于标准酶标仪,使用 Cy3/Cy5Q 标记对。由于背景自发荧光,用于无细胞检测的 MCA/DNP 标记对不适用于基于细胞的检测。
动物实验
对于体内成像研究,可以使用荧光标记的NFF-3(Cy5.5-NFF-3)。将5×10⁶个HT-1080纤维肉瘤细胞皮下注射到6-8周龄的无胸腺裸鼠右侧腹部。当肿瘤体积达到200-300 mm³时,用异氟烷麻醉小鼠。将Cy5.5-NFF-3肽(100 μg溶于100 μL PBS)直接注射到肿瘤内(瘤内注射,IT)或经尾静脉注射。对于静脉注射,在注射后0、1、2、4、8、12和24小时,使用体内荧光成像系统(例如IVIS Spectrum)对小鼠进行成像。激发滤光片设置为640 nm,发射滤光片设置为700 nm。图像采集采用一致的曝光时间、像素合并和光圈值。在肿瘤周围绘制感兴趣区域(ROI),以量化平均辐射强度(光子/秒/平方厘米/球面度)。一组小鼠在探针注射前1小时预先注射MMP抑制剂(例如,巴替马司他,30 mg/kg,腹腔注射),作为信号特异性的对照。肿瘤中的信号强度反映了肿瘤微环境中MMP-3的活性水平。该方案提供了一种非侵入性的肿瘤生物学检测方法。
药代性质 (ADME/PK)
NFF-3 TFA 的分子式为 C80H111F3N22O22,分子量为 1789.87 g/mol。冻干粉末应储存在 -20℃ 的密封容器中,避光防潮,可稳定保存长达 3 年。溶液储存应在 -80℃ 下保存长达 1 年。它可溶于 DMSO 和水。TFA 盐是肽合成和储存的标准形式。基于 FRET 的设计(MCA/DNP)可实现对酶动力学的高灵敏度连续监测。肽序列包含 Nva(正缬氨酸)和 DNP(2,4-二硝基苯基)标记的赖氨酸。MMP-3 的 Kcat/Km 值为 218,000 s-1 M-1。
参考文献

[1]. Comparison of metalloproteinase protein and activity profiling. Anal Biochem. 2011 Feb 1;409(1):37-45.

其他信息
本产品仅供研究使用,不可用于人体。它是MMP-3和MMP-10的高特异性底物,用于药物发现和基础研究。它可被其他蛋白酶切割,但切割速率远低于MMP-3和MMP-10。MCA基团的激发峰位于325 nm,发射峰位于395 nm。该肽具有极高的灵敏度和特异性。它是一种化学工具,而非药物。操作时应格外小心,避免被其他蛋白酶污染。务必使用无蛋白酶的吸头和试管。该肽可溶于DMSO和水。避免反复冻融。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C80H111F3N22O22
分子量
1789.87
相关CAS号
NFF-3;158584-09-9
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~55.87 mM)
H2O :< 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.5587 mL 2.7935 mL 5.5870 mL
5 mM 0.1117 mL 0.5587 mL 1.1174 mL
10 mM 0.0559 mL 0.2793 mL 0.5587 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们