| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
DNA (as a substrate). As a DNA adduct, its primary target is the DNA molecule itself, specifically where it can interfere with DNA replication and transcription. It may also serve as a substrate or marker for specific DNA repair enzymes (like ALKBH homologs or other dioxygenases) that demethylate DNA lesions. It does not have a classical pharmacological receptor target.
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| 体外研究 (In Vitro) |
N1-甲基-2'-脱氧腺苷是由甲基化剂形成的DNA加合物。在体外,它可以被掺入合成的DNA寡核苷酸中,用于研究其如何改变DNA结构以及DNA聚合酶和修复酶如何识别它。它可用于评估DNA修复酶的活性,例如人AlkB同源物(ALKBH)蛋白,这些蛋白可以在底物依赖性检测中去除该损伤位点的甲基。
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| 体内研究 (In Vivo) |
该化合物不作为治疗药物用于体内疗效研究。然而,它被用作DNA损伤的生物标志物。在暴露于DNA损伤剂(例如,甲基磺酸甲酯、MMS或亚硝胺)的动物模型中,可通过液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)定量分析组织(例如,肝脏、肾脏)中N1-甲基-2'-脱氧腺苷的水平,以评估DNA烷基化损伤的程度和DNA修复过程的效率。
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| 酶活实验 |
本检测方法用于测定ALKBH酶对N1-甲基-dA的修复活性。采用非细胞(无细胞)酶活性测定法,测定纯化的DNA修复酶对含有该加合物的寡核苷酸底物的去甲基化活性。将含有单个N1-甲基-dA的荧光标记或放射性标记的寡核苷酸与纯化的酶(例如ALKBH2或ALKBH3)在含有辅因子(例如2-酮戊二酸、Fe2+、抗坏血酸)的反应缓冲液中孵育。终止反应后,通过高效液相色谱(HPLC)或质谱法分离和定量产物(去甲基化的寡核苷酸),以确定酶动力学参数(kcat、Km)。
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| 细胞实验 |
体外细胞实验用于测定甲基化剂的遗传毒性和细胞修复能力。例如,用甲基化剂(如MMS)处理细胞。经过一段时间的恢复后,提取基因组DNA并进行水解。利用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)分析水解产物,以定量N1-甲基-2'-脱氧腺苷(N1-MDA)的水平,N1-MDA是DNA损伤的标志物。该加合物随时间的持续存在表明细胞具有修复DNA损伤的能力。
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| 动物实验 |
体内动物实验旨在评估DNA损伤和修复。一项典型的实验是给小鼠单次注射基因毒性化合物(例如,MMS,50 mg/kg,腹腔注射)。在给药后的不同时间点(例如,1、6、24、48小时),对小鼠进行安乐死。采集组织(例如,肝脏、肾脏、肺脏),提取DNA,纯化DNA,并用酶水解将其转化为核苷。然后,采用灵敏的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)方法定量N1-甲基-2'-脱氧腺苷的水平,并与未处理的对照组进行比较。这项时间进程研究揭示了体内加合物的形成和修复动力学。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
作为DNA加合物标准品,该化合物自身的药代动力学特征并不重要。它的作用在于研究DNA损伤的药代动力学。对于甲基化剂而言,其在血浆和组织中的药代动力学特征(例如,Cmax、AUC)与DNA中该加合物的形成相关。该加合物本身可在生物样本中进行测量,作为甲基化剂暴露的生物标志物,其在DNA中的半衰期可用于衡量DNA修复速率。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
N1-甲基-2'-脱氧腺苷的毒理学数据并不相关,因为它是一种DNA损伤标志物,而非治疗药物。然而,这种加合物的存在本身就是DNA损伤的标志,并且具有潜在的致突变性。在DNA复制过程中,这种损伤会导致碱基错配(例如,与T或G错配),从而导致点突变。它的积累与多种化学物质的遗传毒性效应相关,是遗传毒理学中的一个重要终点指标。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
这种化合物是研究DNA损伤和修复的关键分析标准品。DNA中腺苷的N1-甲基化是一种常见的损伤,由环境烷化剂和某些化疗药物引起。定量分析这种加合物是评估DNA修复途径(特别是ALKBH家族双加氧酶介导的途径)效率的标准技术。它严格来说是一种研究工具,不用于临床治疗。
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| 分子式 |
C11H15N5O3
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|---|---|
| 分子量 |
265.27
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| 精确质量 |
265.117
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| CAS号 |
60192-55-4
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| PubChem CID |
129889465
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
0
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| tPSA |
109.18
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
2
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| 重原子数目 |
19
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| 分子复杂度/Complexity |
404
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
CN1C=NC2=C(C1=N)N=CN2[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)CO)O
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| InChi Key |
AYVJNJNKPVUEGT-XLPZGREQSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C11H15N5O3/c1-15-4-14-11-9(10(15)12)13-5-16(11)8-2-6(18)7(3-17)19-8/h4-8,12,17-18H,2-3H2,1H3/t6-,7+,8+/m0/s1
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| 化学名 |
(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(6-imino-1-methylpurin-9-yl)oxolan-3-ol
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.7697 mL | 18.8487 mL | 37.6974 mL | |
| 5 mM | 0.7539 mL | 3.7697 mL | 7.5395 mL | |
| 10 mM | 0.3770 mL | 1.8849 mL | 3.7697 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。