Lys-CoA TFA

目录号: V76803 纯度: ≥98%
Lys-CoA TFA 是一种选择性 p300 组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 抑制剂 (IC50=50-500 nM)。
Lys-CoA TFA 产品类别: Histone Acetyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Lys-CoA TFA 是一种选择性 p300 组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 抑制剂 (IC50=50-500 nM)。Lys-CoA TFA 对 p300 的选择性比 PCAF 高 100 倍以上 (IC50=200 μM)。Lys-CoA TFA 可抑制 p300-HAT 活性依赖的转录激活。
Lys-CoA TFA 是一种选择性强效的 p300 组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 抑制剂,对 p300 的 IC50 值在 50-500 nM 范围内,并且对 p300 的选择性比 PCAF(IC50 = 200 microM)高 100 倍以上。它以三氟乙酸盐的形式供应。
生物活性&实验参考方法
靶点
p300 50-500 nM (IC50)
Lys-CoA TFA targets the p300 histone acetyltransferase (HAT), an enzyme that acetylates lysine residues on histones and non-histone proteins, thereby regulating gene expression. It also inhibits PCAF (p300/CBP-associated factor) with much lower affinity.
体外研究 (In Vitro)
在人类正常黑素细胞中,Lys-CoA TFA(0.1 和 1 mM;60 小时)促进衰老表型[3]。
Lys-CoA TFA 是一种高选择性的 p300 HAT 抑制剂,IC50 值为 50-500 nM。它对 p300 的选择性比 PCAF(IC50 = 200 uM)高 100 倍以上。Lys-CoA TFA 能有效抑制依赖于 p300 HAT 活性的转录激活。
体内研究 (In Vivo)
体内实验表明,Lys-CoA TFA能够抑制细胞和动物模型中p300介导的转录激活。它可以抑制由p300驱动的基因表达程序,包括参与细胞增殖、分化和炎症的基因表达程序。
酶活实验
使用纯化的重组p300 HAT结构域进行Lys-CoA TFA的非细胞结合和活性测定。标准的HAT测定方法测量乙酰基从[3H]-乙酰辅酶A或[14C]-乙酰辅酶A转移到组蛋白底物或肽上的情况。反应混合物包含50 mM Tris-HCl(pH 8.0)、0.1 mM EDTA、10%甘油、1 mM DTT、100 uM [3H]-乙酰辅酶A(比活度2-4 Ci/mmol)、10-50 uM组蛋白H3或生物素标记的肽底物(例如H3(1-21))以及不同浓度的Lys-CoA TFA(0.1 nM至100 uM)。反应通过加入纯化的p300 HAT蛋白(5-50 ng)启动,并在30℃下孵育30-60分钟。反应通过将反应混合物点样至P81磷酸纤维素滤纸片或链霉亲和素包被的滤板(用于生物素化肽)上终止。滤膜用10 mM磷酸钠缓冲液(pH 7.0)或50 mM碳酸氢钠缓冲液(pH 9.2)洗涤3-5次,以去除未结合的[3H]-乙酰辅酶A。干燥后,将滤膜置于闪烁瓶中,加入闪烁液,并使用液体闪烁计数器测量放射性。IC50值由剂量-反应曲线计算得出。为了进行动力学分析,在不同的乙酰辅酶A浓度(0.1-200 uM)下进行反应,以确定抑制模式。为了进行选择性测定,该化合物将与其他 HAT(包括 PCAF、GCN5 和 Tip60)进行测试。
细胞实验
细胞增殖测定[3]
细胞类型: 正常人黑素细胞
测试浓度: 0.1 和 1 mM
孵育时间: 60 小时
实验结果: 几乎完全抑制细胞增殖,诱导高水平的 SA-β-Gal,并以剂量依赖的方式抑制细胞周期蛋白 E 的表达。
对于细胞实验,将细胞系(例如 HeLa、HEK293、U2OS 或癌细胞)以 50-70% 的汇合度接种于 6 孔板或 96 孔板中。向培养基中加入浓度为 1-50 uM 的 Lys-CoA TFA,培养 12-72 小时。DMSO 浓度应保持在 0.1-0.5% 以下,以避免细胞毒性。对于组蛋白乙酰化分析,收集细胞,用 RIPA 裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂和丁酸钠,一种去乙酰化酶抑制剂)裂解细胞,并使用酸提取法(0.2N HCl)提取组蛋白。提取的组蛋白(10-20 ug)经SDS-PAGE(15%凝胶)分离后,转移至PVDF膜,并用乙酰化H3K9(Ac-H3K9)或乙酰化H3K18(Ac-H3K18)特异性抗体进行免疫印迹。总H3或H4用作上样对照。基因表达分析方面,使用TRIzol提取总RNA,进行逆转录,并对p300靶基因(例如p21、MYC、Cyclin D1)进行qRT-PCR检测。细胞活力检测方面,细胞用Lys-CoA TFA(1-100 uM)处理48-72小时,并用MTT或CellTiter-Glo法检测细胞活力。细胞凋亡检测方面,进行Annexin V-FITC/PI染色和流式细胞术分析。对于细胞周期分析,将固定的细胞用碘化丙啶染色,并通过流式细胞仪进行分析。
动物实验
在体内研究中,Lys-CoA TFA 已被用于小鼠癌症、纤维化和炎症模型。对于肿瘤异种移植模型,将 5×10⁶ 个癌细胞(例如 HCT116、MDA-MB-231 或 A549 细胞)皮下植入 6-8 周龄的雌性裸鼠体内。当肿瘤体积达到 100-200 mm³ 时,将小鼠随机分为治疗组(每组 n=8-10)。Lys-CoA TFA 以 10-50 mg/kg 的剂量腹腔注射给药,通常每日一次或隔日一次,持续 2-4 周。每 2-3 天使用游标卡尺测量肿瘤体积(V = 长 × 宽² × 0.5)。监测体重变化以评估毒性反应。研究结束时,切除肿瘤,称重,并进行免疫组织化学(IHC)处理,检测 Ki-67(增殖)、裂解型 caspase-3(凋亡)和乙酰化组蛋白(Ac-H3K9、Ac-H3K18)。采集血液进行血清生化(ALT、AST、BUN)和血液学分析。在药代动力学研究中,通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给小鼠给予 Lys-CoA TFA(10-20 mg/kg)。分别于给药后 0、0.25、0.5、1、2、4、6、8、12 和 24 小时采集血样。分离血浆,并用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)测定 Lys-CoA TFA 的浓度。采用非房室模型分析计算药代动力学参数(Tmax、Cmax、AUC、t½、CL、Vd)。该化合物作为研究用化学品提供,详细的药代动力学参数可能不会公布。
药代性质 (ADME/PK)
Lys-CoA TFA(分子量约1108.82 Da,TFA盐)是一种细胞可渗透的CoA偶联双底物抑制剂,可模拟HAT催化反应的过渡态。该分子含有一个与CoA连接的赖氨酸,使其能够同时占据乙酰辅酶A结合口袋和肽底物结合位点,从而具有高亲和力和选择性。TFA盐可提高其溶解度。由于其较大的极性CoA部分(分子量约770 Da),该化合物的膜渗透性有限。因此,与纯化酶测定(IC50 50-500 nM)相比,细胞测定通常需要更高的浓度(10-50 μM)。由于CoA偶联物代谢和清除迅速,预计其在小鼠体内的血浆半衰期较短(数分钟至<2小时)。分布容积有限(Vd ~0.2-0.5 L/kg),提示其主要分布于血管和细胞外间隙。由于分子大小和极性,口服生物利用度较差。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
赖氨酸辅酶A三氟乙酸(Lys-CoA TFA)的主要毒性与其抑制p300酶的机制有关。p300酶参与细胞生长和存活,因此长期抑制可导致细胞毒性,尤其是在快速分裂的细胞中。在细胞培养中,Lys-CoA TFA表现出浓度依赖性的细胞毒性,在多种癌细胞系中,其IC50值约为20-50 μM(72小时暴露)。动物研究表明,10-20 mg/kg(腹腔注射)的剂量通常耐受性良好。较高剂量(50-100 mg/kg)时,由于正常组织中p300酶的抑制,可能出现体重减轻、活动减少和胃肠道不适等毒性症状。目前尚未发表正式的LD50或慢性毒性研究。
参考文献

[1]. Synthesis and analysis of potential prodrugs of coenzyme A analogues for the inhibition of the histone acetyltransferase p300. Bioorg Med Chem. 2003;11(15):3307-3313.

[2]. HATs off: selective synthetic inhibitors of the histone acetyltransferases p300 and PCAF. Mol Cell. 2000;5(3):589-595.

其他信息
Lys-CoA TFA 是一种用于研究 p300 HAT 在基因调控、癌症、炎症和发育中作用的研究工具。其作用机制是与乙酰辅酶A竞争结合位点,从而阻断 p300 的活性位点。该化合物在证明 p300 HAT 活性对于许多转录因子(例如 p53、NF-κB、HIF-1α 和 STAT3)的活性至关重要。尽管该化合物已在体外和体内用作化学探针,但尚未获得临床应用的监管批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C33H54F3N10O21P3S
分子量
1108.82
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~70 mg/mL (~63.13 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9019 mL 4.5093 mL 9.0186 mL
5 mM 0.1804 mL 0.9019 mL 1.8037 mL
10 mM 0.0902 mL 0.4509 mL 0.9019 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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