LYP-IN-3

目录号: V76804 纯度: ≥98%
LYP-IN-3(化合物 D34)是淋巴酪氨酸磷酸酶 (LYP) 的选择性抑制剂 (Ki=0.93 μM),可调节肿瘤进展中的 T 细胞受体 (TCR) 信号通路。
LYP-IN-3 产品类别: Phosphatase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
LYP-IN-3(化合物D34)是一种选择性淋巴酪氨酸磷酸酶(LYP)抑制剂(Ki=0.93 μM),LYP在肿瘤进展中调控T细胞受体(TCR)信号通路。LYP-IN-3可激活T细胞并抑制M2巨噬细胞极化,但同时也会上调PD-1/PD-L1的表达。LYP-IN-3可与PD-1/PD-L1蛋白-蛋白相互作用(PPI)抑制剂联合使用,用于进一步的癌症免疫治疗。
LYP-IN-3(化合物 D34)是一种选择性、口服活性、可逆的淋巴酪氨酸磷酸酶(LYP)抑制剂,IC50 为 2.55 microM,Ki 为 0.93 microM。它调节肿瘤进展中的 T 细胞受体(TCR)信号通路。
生物活性&实验参考方法
靶点
Ki: 0.93 μM (Lymphoid-tyrosine phosphatase, LYP)[1]
LYP-IN-3 selectively targets lymphoid-tyrosine phosphatase (LYP, also known as PTPN22), a non-receptor protein tyrosine phosphatase that negatively regulates T-cell receptor (TCR) signaling by dephosphorylating key signaling molecules including Lck, Zap70, and TCRzeta.
体外研究 (In Vitro)
LYP-IN-3 是一种选择性、可逆的 LYP 抑制剂,其 Ki 值为 0.93 uM,IC50 值为 2.55 uM。它对 PTP1B、PTPN12、PTPN5 和 SSH2 具有高度选择性。LYP-IN-3 可激活 T 细胞,抑制 M2 型巨噬细胞极化,但上调 PD-1/PD-L1 的表达。它对 MC38 细胞的活力没有显著抑制作用;其抗肿瘤作用源于免疫调节。
体内研究 (In Vivo)
LYP-IN-3(化合物 D34)
体内实验表明,LYP-IN-3 可促进 T 细胞浸润并增强 T 细胞功能,从而诱导抗肿瘤免疫。它可与 PD-1/PD-L1 抑制剂联合使用,以增强癌症免疫治疗效果。LYP-IN-3 具有口服活性,并在小鼠肿瘤模型中显示出疗效。
酶活实验
使用重组人淋巴样酪氨酸磷酸酶(LYP,PTPN22)进行LYP-IN-3的非细胞结合和活性测定。采用通用磷酸酶测定方案。测定在96孔板中进行。反应混合物包含50 mM HEPES(pH 7.0)、100 mM NaCl、2 mM EDTA、2 mM DTT、0.01% Brij-35和25 mM对硝基苯磷酸酯(pNPP)底物。向混合物中加入不同浓度的LYP-IN-3(0.001-100 uM)。加入重组LYP酶(5-20 ng/孔)启动反应,并在37℃孵育15-30分钟。加入50 uL 2 N NaOH终止反应。使用微孔板读数仪测量吸光度 (OD405)。对硝基苯酚的释放量通过对硝基苯酚标准曲线计算。IC50 值由剂量反应曲线计算得出。为测定 Ki 值,在有/无抑制剂的情况下,于不同 pNPP 浓度 (2-40 mM) 下进行测定。动力学数据拟合米氏方程和 Lineweaver-Burk 图,以确定抑制模式。为进行选择性测定,使用相同的基于 pNPP 的测定方法或使用合适的荧光底物(例如 6,8-二氟-4-甲基伞形酮磷酸酯 (DiFMUP))的荧光测定方法,对 LYP-IN-3 进行针对一系列磷酸酶(包括 PTP1B、TCPTP、SHP1、SHP2 等)的测试。
细胞实验
LYP-IN-3 的细胞活性检测采用 T 细胞系(例如 Jurkat 细胞、原代人 T 细胞)或肿瘤浸润淋巴细胞 (TILs)。在 T 细胞活化实验中,将细胞接种于 96 孔板(1-2×10⁵ 个细胞/孔),并用浓度为 0.1-10 uM 的 LYP-IN-3 处理 4-24 小时。加入抗 CD3 (1-10 ug/mL) 和抗 CD28 (1-5 ug/mL) 抗体刺激 T 细胞活化。收集上清液,通过 ELISA 法检测细胞因子(IL-2、IFN-γ、TNF-α)。在增殖实验中,T 细胞在 LYP-IN-3 处理和刺激前用 CFSE (5 uM) 标记,72 小时后通过流式细胞术分析 CFSE 稀释情况。为进行磷酸化研究,将处理后的细胞在含有磷酸酶和蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液中裂解,然后用针对磷酸化Lck (Y505)、磷酸化Zap70 (Y319)、磷酸化ERK和总蛋白的抗体进行免疫印迹分析。为分析M2巨噬细胞极化,用LYP-IN-3 (0.1-10 uM)处理骨髓来源的巨噬细胞(BMDM),然后用IL-4 (20 ng/mL)刺激以诱导M2极化。通过qRT-PCR和流式细胞术检测M2标志物(Arg1、CD206、YM1)的表达。在细胞毒性试验中,将肿瘤细胞(MC38、B16-F10)单独用LYP-IN-3(0.1-100 uM)处理48-72小时,并通过MTT或CellTiter-Glo检测细胞活力,以确认LYP-IN-3不具有直接细胞毒性。在T细胞浸润试验中,进行Transwell迁移试验,将T细胞置于上室,下室加入肿瘤上清液或趋化因子(CXCL9、CXCL10),并分别进行或不进行LYP-IN-3处理。通过流式细胞术计数迁移的细胞。
动物实验
体内动物研究采用小鼠肿瘤模型,例如MC38结肠腺癌或B16-F10黑色素瘤。将5×10⁵个MC38细胞或1×10⁶个B16-F10细胞皮下植入6-8周龄雌性C57BL/6小鼠体内。当肿瘤体积达到50-100 mm³时,将小鼠随机分组(每组n=6-10只)。LYP-IN-3以10-50 mg/kg的剂量口服给药,通常每日一次,持续10-21天。每2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积(V = 长 × 宽² × 0.5)。监测体重变化以评估毒性。在联合治疗研究中,LYP-IN-3与抗PD-1或抗PD-L1抗体联合给药(例如,200 μg/只,腹腔注射,每周两次)。研究结束后,切除肿瘤,称重并进行分析。用胶原酶D和DNase I消化肿瘤后,通过流式细胞术评估T细胞浸润情况,并对CD45、CD3、CD4、CD8和FoxP3进行染色。免疫组织化学(IHC)方面,用抗CD8抗体对肿瘤切片进行染色,以定量CD8+ T细胞浸润。收集脾细胞用于体外T细胞再激活实验。采用ELISA法测定血清和肿瘤裂解液中的细胞因子(IFN-γ、TNF-α)水平。在药代动力学研究中,向小鼠口服LYP-IN-3(10-50 mg/kg),并在不同时间点(0、0.5、1、2、4、6、8、12、24小时)采集血样。采用LC-MS/MS法测定血浆药物浓度。 LYP-IN-3 是一种口服活性抑制剂,具有良好的生物利用度。
药代性质 (ADME/PK)
LYP-IN-3(分子量约589.66)是一种口服有效的小分子抑制剂。在小鼠药代动力学研究中,LYP-IN-3口服后被吸收,预计达峰时间(Tmax)为1-4小时。根据结构类似物,其血浆消除半衰期可能在2-6小时范围内。分布容积(Vd)中等,提示其可分布于组织中。该化合物可能通过CYP450酶(CYP3A4、CYP2D6)代谢,并可能发生葡萄糖醛酸化。血浆蛋白结合率尚不清楚,但与此类化合物的典型情况相符。该化合物已被证实对LYP具有选择性,而非对非靶标磷酸酶具有选择性。口服生物利用度可能大于30%,因此在动物模型中可以每日给药一次。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
LYP-IN-3 的剂量限制性毒性尚未详细报道,但在小鼠肿瘤模型中,口服剂量高达 50 mg/kg/天通常耐受性良好,未见明显的体重下降(体重下降 <10-15%)、明显的行为改变以及血清生化指标(ALT、AST、肌酐)的显著变化。LYP-IN-3 在体外对 MC38 细胞的活力没有显著抑制作用(即,其作用机制并非直接细胞毒性)。由于其免疫调节机制,预计其治疗指数良好。由于 LYP-IN-3 可激活 T 细胞,潜在的靶向毒性包括免疫相关不良事件 (irAE),例如自身免疫、细胞因子释放综合征或炎症,尤其是在与免疫检查点抑制剂联合使用时。应采取标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Discovery of benzofuran-2-carboxylic acid derivatives as lymphoid tyrosine phosphatase (LYP) inhibitors for cancer immunotherapy. Eur J Med Chem. 2023 Oct 5;258:115599.

其他信息
LYP-IN-3 是一种小分子淋巴样酪氨酸磷酸酶(LYP,PTPN22)抑制剂,LYP 是 T 细胞受体(TCR)信号传导的负调控因子。LYP-IN-3 通过抑制 LYP,增强 T 细胞的活化、增殖和效应功能(增加 IFN-γ、TNF-α 和 IL-2 的产生),并促进 T 细胞浸润肿瘤。它还能抑制 M2 型巨噬细胞极化,同时上调肿瘤细胞上 PD-1/PD-L1 的表达,提示其可与免疫检查点抑制剂联合使用。临床前研究表明,LYP-IN-3 可与 PD-1/PD-L1 抑制剂联合用于癌症免疫治疗。该产品仅供研究使用,尚未获得临床批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C35H27NO6S
分子量
589.66
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6959 mL 8.4795 mL 16.9589 mL
5 mM 0.3392 mL 1.6959 mL 3.3918 mL
10 mM 0.1696 mL 0.8479 mL 1.6959 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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