KY371

目录号: V76843 纯度: ≥98%
KY371是一种含有炔基的点击化学试剂。
KY371 产品类别: ADC Linker
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
KY371是一种含有炔基的点击化学试剂,也是一种广谱糖苷酶抑制剂。KY371可用于结合蛋白质组学分析研究糖苷酶。
KY371是一种含有炔基的点击化学试剂,可作为广谱糖苷酶抑制剂。它可与靶蛋白的蛋白质组学分析结合使用,以研究糖苷酶。
生物活性&实验参考方法
靶点
Glycosidase[1]
KY371 targets glycosidase enzymes, which are responsible for cleaving glycosidic bonds in carbohydrates, glycoproteins, and glycolipids. As a broad-range glycosidase inhibitor, it can inhibit multiple types of glycosidases.
体外研究 (In Vitro)
KY371 是一种广谱糖苷酶抑制剂。其炔基可进行点击化学偶联,用于蛋白质组学研究,从而鉴定和表征糖苷酶靶蛋白。针对特定糖苷酶的详细 IC50 值尚未公开。
体内研究 (In Vivo)
KY371是一种研究工具而非治疗药物,主要用于离体和体外实验中的蛋白质组学分析和靶点鉴定。由于KY371主要是一种用于研究糖苷酶功能的化学生物学工具,因此其在动物模型中的体内数据有限。
酶活实验
KY371的非细胞酶抑制试验采用纯化的糖苷酶进行。标准试验使用4-甲基伞形酮(4-MU)标记的底物,糖苷键的断裂会释放出荧光标记的4-甲基伞形酮(激发波长360 nm,发射波长450 nm)。反应混合物包含50 mM磷酸钠或柠檬酸盐缓冲液(pH 4.5-6.5,取决于酶的种类)、0.1-1 mM 4-MU糖苷底物以及不同浓度的KY371(0.1-1000 uM)。加入纯化的糖苷酶(0.1-10 ng/uL)启动反应,并在37℃下孵育10-60分钟。加入 200 uL 0.2 M 甘氨酸-NaOH 缓冲液(pH 10.5)终止反应。立即使用荧光酶标仪(激发波长 360 nm,发射波长 450 nm)测量荧光强度。动力学分析中,在有或无 KY371 存在的情况下,测定不同底物浓度(0.01-2 mM)下的初始反应速率 (v0)。IC50 值由剂量-反应曲线(log[KY371] 与活性百分比)计算得出。对于炔烃官能团,可利用体外纯化蛋白进行点击化学反应(铜催化叠氮-炔环加成反应,CuAAC)。将 KY371 与纯化的糖苷酶或细胞裂解液在天然或变性条件下孵育,以促进靶标结合。然后,加入含叠氮基团的生物素或荧光探针、硫酸铜(1 mM)、抗坏血酸钠(1-5 mM)和TBTA或THPTA配体(100 uM)。反应在室温或37℃下进行1-2小时。之后,使用链霉亲和素磁珠捕获生物素化的目标蛋白,并通过质谱分析进行鉴定。
细胞实验
KY371 的细胞活性检测采用 HEK293、HeLa 或癌细胞等细胞系进行。对于基于活性的蛋白质组学分析 (ABPP) 实验,将细胞在 37℃ 下用 KY371 (1-100 uM) 处理 1-4 小时。然后收集细胞,用 PBS 洗涤,并在 RIPA 缓冲液或含 0.5% NP-40 和蛋白酶抑制剂的 PBS 中裂解。如上所述,将与靶糖苷酶结合的含炔基 KY371 通过铜催化点击化学 (CuAAC) 与叠氮-生物素或叠氮-荧光探针偶联。用链霉亲和素磁珠或链霉亲和素-琼脂糖捕获生物素化蛋白,洗涤后,用 SDS-PAGE 上样缓冲液煮沸洗脱,并通过 Western 印迹法用抗生物素抗体或特异性抗体检测靶标结合情况。或者,将荧光探针与细胞裂解液进行点击化学偶联后,通过SDS-PAGE分离总细胞裂解液,并进行凝胶内荧光扫描以观察标记的靶标。为了抑制活细胞中的糖苷酶活性,将细胞用KY371(1-100 uM)处理6-24小时,然后收集细胞,裂解,并使用荧光底物测定糖苷酶活性,方法与非细胞实验相同。对于增殖实验,将细胞用KY371(0.1-100 uM)处理48-72小时,并通过MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力,以评价其潜在的细胞毒性。为了进行蛋白质组学靶标鉴定,将KY371处理细胞中的标记蛋白进行胰蛋白酶消化,并进行LC-MS/MS分析。将鉴定出的独特肽段映射到糖苷酶,从而揭示KY371的靶标谱。
动物实验
由于KY371主要是一种用于离体和体外应用的化学生物学工具,因此其体内动物研究数据有限。在体内靶点结合研究中,可对小鼠或大鼠进行腹腔注射(10-50 mg/kg)或静脉注射KY371。在特定时间(30-120分钟)后,处死动物并收集组织(肝脏、肾脏、脑组织)。制备组织裂解液,并对裂解液进行点击化学偶联。然后,通过质谱分析鉴定生物素标记的靶点,以确定组织特异性靶点占有率。在药代动力学研究中,对啮齿动物给予KY371,并在不同时间点采集血液和组织样本。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)定量分析血浆中KY371的浓度。然而,已发表的关于KY371的详细体内数据仍然匮乏。该化合物并非作为治疗药物开发,因此尚未进行或报告广泛的体内药理学和毒理学研究。由于目前尚无既定方案,使用KY371的研究人员应开展适当的预试验,以确定针对其特定实验终点的合适剂量和给药途径。
药代性质 (ADME/PK)
KY371 是一种小分子点击化学试剂,其药代动力学性质尚未得到充分表征。炔基的存在不会显著改变其预测的 ADME 性质。预计其分子量在 200-500 Da 范围内,这使其能够被动扩散穿过细胞膜并可能分布到组织中。作为一种糖苷酶抑制剂,KY371 在口服或腹腔注射后可能具有良好的生物利用度,但具体参数(生物利用度、半衰期、分布容积、清除率)尚未进行正式评估。预计该化合物将通过 I 期和 II 期药物代谢酶代谢,包括 CYP450 和结合酶(葡萄糖醛酸化、硫酸化)。由于目前尚无已发表的药代动力学数据,建议研究人员在与其研究相关的物种和剂量范围内进行初步的药代动力学表征。 KY371 的点击化学特性使其能够与叠氮化物发生化学反应,这可能会影响其在生物基质中的稳定性。炔基的存在通常不会影响其与糖苷酶的结合。对于使用基于活性的蛋白质谱分析进行靶点鉴定的研究,即使化合物清除迅速,只要在体内给药期间(通常为 15-60 分钟)有足够的靶点结合,也可以在体外组织裂解液中进行标记。应按照制造商的建议储存和处理该化合物,以防止过早降解或发生反应。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未对KY371进行正式的毒性研究。作为一种研究用化学品,KY371通常以低浓度使用(细胞实验中通常为1-100 μM,动物实验中为10-50 mg/kg),预计其在短期实验中具有可接受的耐受性。在细胞实验中,KY371在高浓度(>50 μM,持续48-72小时)下可能引起浓度依赖性的细胞毒性。研究人员应使用适当的对照来确定安全范围。在动物实验中,点击化学试剂的典型研究剂量(10-50 mg/kg,腹腔注射)通常耐受性良好,未出现明显的急性毒性症状(无明显体重减轻、行为改变或死亡)。然而,由于缺乏已发表的毒性数据,在处理和使用KY371时应谨慎。处理潜在危险化学品时应遵循标准安全预防措施,包括在通风橱内操作、穿戴适当的个人防护装备(手套、实验服、护目镜),并避免吸入、摄入或皮肤接触。目前尚未公布致癌性、致突变性(Ames试验)或生殖毒性数据。观察到的任何毒性都可能归因于糖苷酶的抑制,而糖苷酶对碳水化合物代谢和溶酶体功能至关重要。
参考文献
[1]. handrasekar B, et al. Broad-range glycosidase activity profiling. Mol Cell Proteomics. 2014 Oct;13(10):2787-800.
其他信息
KY371 是一种点击化学试剂和广谱糖苷酶抑制剂,可用作化学生物学工具来研究糖苷酶的功能。点击化学(铜催化叠氮-炔环加成反应,CuAAC)是一种强大的生物正交反应,能够对复杂生物混合物中含炔基的分子进行特异性标记。炔基的存在使 KY371 区别于传统的糖苷酶抑制剂,因为它可以与叠氮标记的探针(例如,生物素-叠氮化物、荧光团-叠氮化物)进行下游偶联,从而实现可视化和亲和纯化。这一特性使 KY371 成为一种基于活性的探针 (ABP),可用于蛋白质组学研究中糖苷酶活性的分析。KY371 通过抑制糖苷酶并同时提供点击化学反应的靶点,使研究人员能够识别在特定细胞环境中哪些糖苷酶被结合和抑制。糖苷酶参与多种生物过程,包括蛋白质糖基化、糖蛋白降解、碳水化合物消化、溶酶体功能和病毒入侵。糖苷酶失调与多种疾病相关,包括溶酶体贮积症(例如戈谢病、泰-萨克斯病)、癌症转移、糖尿病和细菌感染。KY371 是一种严格意义上的研究用化合物,尚未获准用于临床或诊断用途。该化合物仅供实验室研究使用,不得用于人类或兽医用途。作为蛋白质组学分析试剂,KY371 可用于药物发现和化学生物学中的靶点识别和验证研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H29NO5
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~294.61 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们