H3K4(Me2) (1-20)

目录号: V76944 纯度: ≥98%
H3K4(Me2) (1-20) 是一种组蛋白多肽。
H3K4(Me2) (1-20) 产品类别: Peptides | 多肽
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
H3K4(Me2) (1-20) 是一种组蛋白多肽。H3K4me2 调节 DNA 损伤后蛋白质生物合成的恢复和体内平衡。
H3K4(Me2) (1-20) 是一种合成肽,来源于人组蛋白 H3.1(同工型 3.1),包含第 1 至 20 位氨基酸残基,并在第 4 位赖氨酸发生二甲基化修饰 (H3K4me2)。其序列为:Ala-Arg-Thr-Lys(Me2)-Gln-Thr-Ala-Arg-Lys-Ser-Thr-Gly-Gly-Lys-Ala-Pro-Arg-Lys-Gln-Leu。H3K4me2 是一种与活性基因转录相关的组蛋白修饰,在 DNA 损伤后蛋白质生物合成的恢复和稳态维持中发挥作用。它在常染色质中富集,尤其是在活性基因的增强子区域和启动子近端区域。该肽可作为组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶的底物,是表观遗传学研究的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Histone H3. H3K4(Me2) (1-20) is a synthetic peptide corresponding to the N-terminal tail (amino acids 1-20) of human histone H3.1, with dimethylation at lysine 4 (H3K4me2). H3K4me2 is an epigenetic mark associated with active gene transcription. It is found in euchromatin (transcriptionally active regions) and is enriched at enhancer regions and at the promoter-proximal regions of active genes. H3K4me2 is recognized by reader proteins containing PHD fingers or Tudor domains (e.g., CHD1, BPTF, ING2). The methylation is catalyzed by histone methyltransferases (e.g., SET1/MLL complexes, SETD1A/B, MLL1-4) and removed by demethylases (e.g., KDM5 family, LSD1). H3K4me2 is an intermediate in the dynamic methylation cycle, and its levels are regulated in response to cellular stress, including DNA damage. Specifically, H3K4me2 regulates the recovery of protein biosynthesis and homeostasis following DNA damage. This peptide is used as an in vitro substrate for these enzymes. It is not a drug; it is a research reagent for studying chromatin biology and gene regulation.
体外研究 (In Vitro)
体外实验中,H3K4(Me2) (1-20) 可用作组蛋白去甲基化酶(如 KDM5A (JARID1A) 和 KDM5B (JARID1B))以及甲基转移酶的底物。在去甲基化酶活性测定中,将 H3K4(Me2) 肽段 (1-10 uM) 与重组 KDM5A 在 α-酮戊二酸、Fe(II) 和抗坏血酸存在下孵育。通过质谱(MALDI-TOF 或 LC-MS)或使用 H3K4me2 特异性抗体进行 ELISA 检测,监测去甲基化为单甲基化 (H3K4me1) 或未甲基化 (H3K4me0) 形式的过程。由此可以测定抑制剂的 IC50 值。此外,该肽段可作为赖氨酸甲基转移酶(例如MLL1复合物、SETD1A)的底物,生成H3K4me2或H3K4me3。在甲基化分析中,将单甲基化的H3K4肽段或未甲基化的肽段与甲基转移酶和S-腺苷甲硫氨酸(SAM)孵育,并通过放射性测定(3H-SAM)或质谱法定量甲基的掺入。该肽段还可用作抗原,以制备H3K4me2特异性抗体。它可以与载体蛋白偶联用于免疫。它还用于竞争性ELISA,以确认抗体的特异性。在“读取”蛋白(例如CHD1)的结合分析中,将该肽段的生物素化版本固定在链霉亲和素板或磁珠上,以从核提取物中捕获读取蛋白。三氟乙酸盐是常用的,不会影响酶活性。
体内研究 (In Vivo)
不适用(研究试剂)。H3K4(Me2) (1-20) 不是药物,不用于体内给药。它是一种用于体外和离体研究的生化试剂。它可以作为质谱定量细胞提取物中 H3K4me2 水平的标准品。本产品不可用于动物。本产品仅限在试管或无细胞体系中进行研究使用。
酶活实验
对于识别 H3K4me2 的读取蛋白的非细胞结合实验,使用生物素标记的 H3K4(Me2) (1-20) 肽段。在 96 孔链霉亲和素包被板中,加入生物素标记的 H3K4(Me2) 肽段(0.1-10 uM),溶于结合缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、150 mM NaCl、0.05% Tween-20、1 mM DTT、0.1% BSA)中,室温孵育 1 小时。洗涤孔板。用 3% BSA 封闭。加入重组读取蛋白(例如 CHD1,1-10 ug/mL),孵育 1-2 小时。洗涤后,加入针对读取蛋白的一抗(如果是 His 标签蛋白,则加入抗 His 标签抗体),然后加入 HRP 标记的二抗和 TMB 底物。在 450 nm 波长处测量吸光度。为进行竞争实验,可逐步添加浓度递增的未修饰的 H3K4(Me2) 肽或 H3K4me3/me1/me0 肽以评估特异性。为进行下拉实验,将生物素标记的肽与链霉亲和素磁珠孵育,然后加入 293T 细胞的核裂解液。洗涤、洗脱后进行 SDS-PAGE 电泳,然后进行 Western 印迹分析以检测目标蛋白(例如,抗 CHD1 抗体)。为进行去甲基化酶活性测定(无细胞):将 H3K4(Me2) 肽 (1-10 uM) 与重组 KDM5A (0.1-1 uM) 在反应缓冲液(50 mM HEPES pH 7.5、100 uM α-酮戊二酸、100 uM Fe(NH4)2(SO4)2、2 mM 抗坏血酸、1 mM DTT)中于 37℃ 孵育 30-60 分钟。加入 0.5% TFA 终止反应。脱盐后,用 MALDI-TOF 质谱分析样品。质量从 1142 Da(二甲基)到 1128 Da(单甲基)的偏移表明发生了去甲基化。或者,也可以在 ELISA 中使用 H3K4me2 特异性抗体:反应后用肽包被酶标板,用抗 H3K4me2 抗体进行检测。对于甲基转移酶活性测定(未甲基化或 H3K4me1 肽),在反应缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.0、5 mM DTT、10 mM MgCl2)中,加入甲基转移酶(0.1-1 uM)和 1-10 uM 3H-SAM,孵育 30-60 分钟。终止反应,点样于 P81 滤纸上,洗涤,并用液体闪烁计数法计数 3H。这些是标准操作流程。TFA 盐溶于水。
细胞实验
对于基于细胞的检测,需要培养细胞(例如HEK293、HeLa细胞)并分离组蛋白。H3K4(Me2)(1-20)肽段不直接添加到细胞中;它是体外检测的底物。虽然可以设计一种细胞渗透性版本(带有Tat细胞穿透肽),将该肽段递送到细胞内,与内源性H3K4me2竞争结合读取蛋白,但这并非标准方法。通常,该肽段用作质谱定量细胞内H3K4me2水平的标准品。例如,从细胞中酸提取的组蛋白(5-20 ug)用内切蛋白酶Arg-C或胰蛋白酶消化。将已知量的稳定同位素标记的H3K4(Me2)肽段(例如13C/15N标记)作为内标添加到消化液中。采用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)在选择反应监测(SRM)模式下分析混合物。内源性(未标记)肽与内标的比值可用于H3K4me2水平的绝对定量。该方法用于测量药物处理后或疾病模型中H3K4me2占有率的变化。ChIP对照实验不使用未标记肽。体外竞争实验如上所述。由于该肽不具有细胞渗透性,因此不适用于基于细胞的实验。所有使用分离组蛋白或核提取物的实验均可进行。TFA盐是可接受的;可溶于水或0.1% TFA溶液中配制成1-10 mM的储备液。使用时应选择与酶促反应兼容的缓冲液。
动物实验
不适用。H3K4(Me2) (1-20) 不用于动物实验。由于该肽段为体外研究试剂,因此没有针对该肽段的体内动物实验方案。它可用于离体实验:例如,将小鼠脑组织匀浆,提取组蛋白,并将该肽段用作质谱标准品,用于定量分析 H3K4me2。然而,这是一种分析方法,而非动物实验。本产品仅供研究使用,不得用于动物给药。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无H3K4(Me2) (1-20)的药代动力学(PK)数据。该肽段不用于体内给药;因此,其PK参数(吸收、分布、代谢、排泄、半衰期)不适用。该肽段仅供体外研究使用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无H3K4(Me2) (1-20)的毒性数据。作为一种由天然L-氨基酸组成的合成肽,它通常被认为毒性较低。体外实验表明,浓度高达100 μM的该肽不会干扰酶活性测定,且添加到培养基中对细胞无细胞毒性(尽管它不具有细胞渗透性)。然而,由于该肽并非用于体内实验,因此未进行毒理学研究。该肽中含有少量三氟乙酸盐,且为化学计量比,无毒。使用时应采取标准的实验室安全防护措施(手套、实验服、护目镜)。本产品仅供研究使用,不得用于人体或动物。
参考文献
[1]. Mulder KW, et al. Regulation of histone H3K4 tri-methylation and PAF complex recruitment by the Ccr4-Not complex. Nucleic Acids Res. 2007;35(7):2428-2439.
[2]. Wang S, et al. H3K4me2 regulates the recovery of protein biosynthesis and homeostasis following DNA damage. Nat Struct Mol Biol. 2020;27(12):1165-1177.
其他信息
H3K4二甲基化(H3K4me2)是一种组蛋白翻译后修饰(PTM),与活跃的基因转录相关。它在增强子区域和启动子近端区域高度富集,其水平通常与H3K4me3和H3K4me1共同调控。H3K4me2在DNA损伤后蛋白质生物合成的恢复和稳态维持中发挥作用。H3K4(Me2)(1-20)肽是组蛋白H3 N端尾部(氨基酸残基1-20)的合成版本,其中第4位赖氨酸被二甲基化。它可用作甲基转移酶和去甲基化酶的体外底物、质谱标准品以及研究阅读蛋白的工具。三氟乙酸盐用于提高溶解度和便于储存。本产品并非药物,不具有治疗用途;它是一种用于表观遗传学研究的科研级化学品。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C93H171N35O27
分子量
2211.61
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~25 mg/mL (~11.30 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.4522 mL 2.2608 mL 4.5216 mL
5 mM 0.0904 mL 0.4522 mL 0.9043 mL
10 mM 0.0452 mL 0.2261 mL 0.4522 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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