GroES mobile loop

目录号: V76957 纯度: ≥98%
GroES 移动环是 GroES 的一个高度灵活的区域,GroES 可以通过该区域末端的氨基酸 (AA) 残基与 GroEL 结合。
GroES mobile loop 产品类别: Peptides | 多肽
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
GroES 移动环是 GroES 的一个高度灵活的区域,GroES 可以通过该区域末端的氨基酸 (AA) 残基与 GroEL 结合。
GroES移动环(源自大肠杆菌)是一种合成肽(13-16个氨基酸),对应于GroES辅助伴侣蛋白中高度柔性的移动环区域。该环负责与主要伴侣蛋白GroEL结合,并在结合后发生折叠转变,从无序状态转变为明确的beta发夹结构。该肽是研究伴侣蛋白介导的蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质相互作用以及GroEL-GroES系统中变构调节机制的重要生化工具。它可用于结合实验、核磁共振结构研究,并可作为抑制剂设计的模板。其序列通常为ETKSAGGIVLTGS。
生物活性&实验参考方法
靶点
GroEL chaperonin. The GroES mobile loop binds to the apical domain of GroEL, a chaperonin involved in protein folding. GroES is a heptameric co-chaperonin that, together with GroEL, forms a cage for substrate protein folding. The mobile loop of each GroES subunit (approximately 16 amino acids) is responsible for the interaction with GroEL. In free GroES, the loop is highly flexible and disordered, but upon binding to GroEL, it folds into a defined beta-hairpin structure, with a hydrophobic tripeptide (e.g., I/L/V-x-x) physically interacting with hydrophobic residues on GroEL's apical domain. This interaction is essential for GroEL-GroES complex formation, ATP hydrolysis, and substrate protein encapsulation. The peptide is not a drug but a research tool; it does not directly inhibit GroEL but serves as a model for the binding interface.
体外研究 (In Vitro)
GroES 移动环是游离 GroES 中适应性很强的部分,它通过环的尖端残留物连接到 GroEL。
体外实验表明,GroES 移动环肽能以高亲和力与 GroEL 结合,模拟全长 GroES 七聚体与 GroEL 之间的相互作用。结合研究表明,合成肽(对应于大肠杆菌 GroES 的 13-32 或 19-27 位氨基酸残基)与 GroEL 结合时会呈现特征性的凸起 β-发夹构象,这已通过转移 NOE(核奥弗豪瑟效应)核磁共振实验得到证实。该肽以浓度依赖的方式抑制 GroES 支持 GroEL 介导的蛋白质折叠的能力,其机制是通过竞争性阻断 GroEL 上的 GroES 结合位点。在分子伴侣实验中,该肽能阻止功能性 GroEL-GroES 复合物的形成,从而破坏蛋白质折叠和变性底物(例如硫氰酸酶或 GFP)的复性。该肽还可用作研究蛋白质-蛋白质相互作用中无序-有序转变的模型。它不具有酶活性,而是在生化测定中作为 GroEL 的配体或抑制剂发挥作用。
体内研究 (In Vivo)
不适用(研究试剂,非药物)。GroES 移动环肽不作为治疗剂用于动物,也不用于体内疗效研究。它是一种生化研究工具,主要用于体外系统(试管、纯化蛋白或细胞裂解液)中研究分子伴侣的功能。一些研究人员可能会将该肽用作对照,或通过显微注射或转染来干扰细胞实验中的 GroEL 功能,但这并不常见。目前尚无该肽的体内活性数据。在离体应用中,可以将该肽添加到组织匀浆或细胞提取物中,以研究其对蛋白质聚集或折叠的影响。然而,它并非候选药物,也没有获批的治疗适应症。
酶活实验
对于 GroES 移动环肽与 GroEL 之间的直接结合分析,表面等离子共振 (SPR) 是首选方法。纯化的 GroEL(大肠杆菌)通过胺偶联(EDC/NHS 化学)固定在 CM5 传感器芯片上,或者如果使用 His 标签的 GroEL,则通过抗 His 抗体捕获。GroES 移动环肽(序列:ETKSAGGIVLTGS 或更长的 13-32 个氨基酸残基的肽)溶解于运行缓冲液(10 mM HEPES pH 7.4、150 mM NaCl、3 mM EDTA、0.005% P20、1 mM DTT)中。在 25°C 下,以 30 uL/min 的流速,将浓度递增的肽溶液(0.1-1000 uM)流过固定化的 GroEL。记录结合(2-3分钟)和解离(5-10分钟)阶段的数据。传感器图谱采用双参考(减去参考通道和缓冲液空白)。使用BIAevaluation或类似软件,将数据拟合到稳态亲和力模型或1:1 Langmuir结合模型,计算KD(解离常数)。对于基于荧光的结合分析:将GroEL用荧光染料(例如荧光素或Alexa Fluor)标记。肽结合后,可能会引起荧光强度或各向异性的变化。或者,可以进行竞争性结合分析:使用已知的GroEL结合肽(例如荧光标记的GroES环肽)作为示踪剂,并通过增加未标记的GroES可移动环肽的浓度来竞争其与GroEL的结合。在室温下孵育30-60分钟后测量荧光偏振(FP)。测定IC50值,并使用Cheng-Prusoff方程计算Ki值。对于下拉实验(体外蛋白质-蛋白质相互作用):将生物素标记的GroES移动环肽(生物素-肽)固定在链霉亲和素-琼脂糖珠上。将纯化的GroEL(1-10 ug)与珠子在结合缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、100 mM KCl、5 mM MgCl2、1 mM DTT、0.1% BSA)中于4℃下轻柔旋转孵育1-2小时。洗涤后,洗脱结合的GroEL,通过SDS-PAGE分离,并用考马斯亮蓝染色或抗GroEL抗体免疫印迹法进行检测。
细胞实验
对于研究 GroES 移动环肽对蛋白质折叠影响的细胞实验,可以使用大肠杆菌细胞(或其他细菌系统)。该肽不具有细胞渗透性,因此通常用于细胞裂解液或透化细胞中。对于基于细胞裂解液的蛋白质复性实验:将大肠杆菌细胞在裂解缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、5 mM MgCl2、50 mM KCl、1 mM DTT、1 mM ATP)中裂解,并通过离心获得可溶性部分。将变性模型底物(例如,硫氰酸酶或荧光素酶)稀释到含有递增浓度 GroES 移动环肽(0.1-1000 uM)的裂解液中。在 37°C 孵育 15-60 分钟后,评估酶活性的恢复情况(例如,通过比色法测定硫氰酸酶活性;通过发光法测定荧光素酶活性)。该肽预计会以剂量依赖的方式抑制分子伴侣介导的蛋白质重折叠。对于蛋白质聚集的活细胞成像:用 GroES 移动环的细胞穿透肽缀合物(如果与细胞穿透肽缀合)处理表达温度敏感底物(例如,与易聚集蛋白融合的 GFP)的大肠杆菌细胞,或者对细胞进行透化处理(例如,用溶菌酶/EDTA)。处理后,使用荧光显微镜评估蛋白质聚集模式。然而,由于缺乏细胞透性,大多数应用是在体外(纯化组分)而非活细胞检测中进行的。所有实验均应包含一个打乱序列的肽作为阴性对照,以及一个已知的伴侣蛋白抑制剂(例如苯甲醇)作为阳性对照。
动物实验
不适用。GroES 移动环肽是一种用于体外生化研究的研究工具,不用于动物实验。因此,目前尚无针对该肽作为治疗剂的体内动物实验方案。该肽可用于离体研究:在动物体内给药或诱导疾病模型后,收集组织(例如脑、肝),裂解组织,并将裂解液与该肽孵育,以研究其对组织中蛋白质聚集或 GroEL 样分子伴侣功能的影响。然而,此类研究非常罕见。该肽不适用于体内应用,因为它无法穿过细胞膜(除非与细胞穿透肽偶联或配制成递送载体)。目前尚无已发表的关于使用裸露的 GroES 移动环肽的动物疗效研究。对于需要研究 GroEL/ES 在细菌感染模型中作用的研究人员而言,基因方法(例如 GroES 基因敲低或过表达)比基于肽的方法更为合适。GroES 移动环肽严格来说是一种实验室试剂。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无GroES移动环肽的药代动力学(PK)数据。该肽由13-16个氨基酸组成(分子量约为1.2-1.5 kDa),静脉给药后会迅速从血液循环中清除,由于肾小球滤过以及血清和组织肽酶的蛋白水解作用,其血浆半衰期仅为几分钟。由于其分子量和亲水性,该肽无法穿过血脑屏障(BBB)或细胞膜。该肽不适用于体内给药,仅用于体外或离体生化分析。因此,吸收、分布、代谢、排泄(ADME)、生物利用度、半衰期和清除率等PK参数与本研究无关,也未见相关报道。对于需要胞内递送的研究,可以考虑将其与细胞穿透肽(CPP)(例如TAT、穿透肽)偶联或封装于脂质体中,但这些修饰会改变其药代动力学特征。未经修饰的肽本身不适用于体内研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无GroES移动环肽的毒性数据。作为一种由天然L-氨基酸组成的短肽,GroES移动环肽通常被认为毒性较低。体外实验表明,浓度高达1 mM时,该肽对细菌或哺乳动物细胞均无细胞毒性(通过细胞活力测定评估)。由于该肽不具有细胞渗透性,因此在标准培养条件下不会进入细胞干扰细胞内分子伴侣的功能。在裂解液或纯化系统中,只要采取标准的实验室安全防护措施(手套、实验服、护目镜),该肽对研究人员无毒性风险。该肽通常以冻干粉末或三氟乙酸盐的形式供应;三氟乙酸反离子含量极低,被认为无毒。该肽不适用于人类或动物,也未进行毒理学研究。目前尚无遗传毒性、致癌性、器官毒性或生殖毒性数据。标准的实验室卫生操作规范足以保证安全操作。
参考文献

[1]. Flexibility of GroES mobile loop is required for efficient chaperonin function. J Mol Biol. 2012 Sep 14;422(2):291-9.

其他信息
GroEL-GroES分子伴侣系统对大肠杆菌和其他细菌的蛋白质折叠至关重要。GroEL是一种大型双环分子伴侣,能够结合错误折叠的蛋白质;GroES是一种七聚体辅助分子伴侣,它覆盖在GroEL环上,形成一个隔离的“安芬森笼”,蛋白质折叠可以在其中安全进行。GroES的移动环(约16个氨基酸残基)是介导GroEL结合的关键结构元件,在游离状态下呈无规卷曲,与GroEL结合后则转变为结构明确的β发夹。该肽序列在细菌和真核生物线粒体同源物中高度保守。GroES移动环肽是一种合成肽,代表该环(通常是大肠杆菌GroES序列的第13-32或19-27位氨基酸残基:ETKSAGGIVLTGS)。该肽并非药物,也未获准用于治疗用途。它是一种研究级的生化工具,用于研究分子伴侣功能、蛋白质折叠和蛋白质-蛋白质相互作用。该肽还可用于核磁共振和X射线晶体衍射,以确定GroEL-GroES界面的结构。该肽仅供研究使用,不得用于临床或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C51H90N14O20
分子量
1219.34
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~33.33 mg/mL (~27.33 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.8201 mL 4.1006 mL 8.2012 mL
5 mM 0.1640 mL 0.8201 mL 1.6402 mL
10 mM 0.0820 mL 0.4101 mL 0.8201 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们