DC-Y13-27

目录号: V77099 纯度: ≥98%
DC-Y13-27 是 DC-Y13 的类似物,是一种 YTHDF2 抑制剂(KD:37.9 μM)。
DC-Y13-27 产品类别: Others 13
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
DC-Y13-27是DC-Y13的类似物,是一种YTHDF2抑制剂(KD:37.9 μM)。DC-Y13-27可增强肿瘤对放射疗法和免疫疗法的反应。
DC-Y13-27是DC-Y13的衍生物,也是一种强效的YTHDF2(YTH结构域家族2)抑制剂。YTHDF2是一种N6-甲基腺苷(m6A)RNA修饰的识别蛋白。DC-Y13-27与YTHDF2的解离常数(KD)为37.9 microM。DC-Y13-27抑制YTHDF2的功能,从而恢复FOXO3和TIMP1蛋白水平,降低MMP1/3/7/9的表达,并诱导细胞焦亡。研究表明,DC-Y13-27能够减轻椎间盘退变(IVDD),增强结肠癌和黑色素瘤患者对放射治疗的反应,并且对乳腺癌具有抗肿瘤活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
DC-Y13-27 targets YTHDF2 (YTH domain family protein 2), a cytoplasmic and nuclear protein that specifically recognizes and binds to N6-methyladenosine (m6A)-modified RNA. YTHDF2 functions as an m6A reader that promotes degradation of methylated mRNA transcripts, thereby regulating gene expression post-transcriptionally. By binding to YTHDF2 (KD 37.9 microM) and inhibiting its RNA-binding activity, DC-Y13-27 stabilizes m6A-modified mRNA transcripts of its target genes, including FOXO3 (forkhead box O3) and TIMP1 (tissue inhibitor of metalloproteinases 1), and suppresses the expression of matrix metalloproteinases (MMP1, MMP3, MMP7, MMP9). DC-Y13-27 also induces pyroptosis, an inflammatory form of programmed cell death.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,DC-Y13-27 通过抑制 YTHDF2 发挥生物活性,其 KD 值为 37.9 uM。它能上调 FOXO3 和 TIMP1 的蛋白水平,同时下调参与细胞外基质降解的 MMP1、MMP3、MMP7 和 MMP9 的蛋白水平。DC-Y13-27 还能诱导细胞焦亡并增加 IL-1β 的分泌。在癌症研究中,DC-Y13-27 能增强结肠癌和黑色素瘤细胞系对放射治疗的反应,并已证实对乳腺癌细胞具有抗肿瘤活性。该化合物通过抑制 YTHDF2 介导的分解代谢基因表达、促进基质合成和减少髓核细胞的炎症反应,从而减轻椎间盘退变。
体内研究 (In Vivo)
在体内,DC-Y13-27 已在多种临床前模型中显示出疗效。在 MC38 小鼠结肠癌模型中,DC-Y13-27 与放疗和/或抗 PD-L1 免疫检查点抑制剂联合使用时,可通过增加肿瘤微环境中 CD8+ T 细胞的数量,显著增强肿瘤生长抑制作用。在乳腺癌和黑色素瘤小鼠模型中,DC-Y13-27 与放疗联合使用可显著减少肿瘤生长并提高生存率。此外,在椎间盘退变 (IVDD) 大鼠模型中,DC-Y13-27 的给药可减少椎间盘退变(通过组织学评分和放射学分析评估),并维持椎间盘高度,表明其具有作为 IVDD 疾病修饰疗法的潜力。
酶活实验
采用表面等离子共振 (SPR) 技术测定 DC-Y13-27 与 YTHDF2 的体外结合亲和力。重组人 YTHDF2 蛋白(YTH 结构域或全长)通过胺偶联固定在 CM5 传感器芯片上。将 DC-Y13-27 溶解于 DMSO 中,并用运行缓冲液(含 0.05% Tween-20 和 1% DMSO 的 PBS)进行系列稀释,最终浓度为 1-400 uM。将化合物以 30 uL/min 的流速流过传感器芯片 120 秒(结合阶段),随后进行 300 秒的解离阶段。在每个循环之间,使用 10 mM 甘氨酸-HCl 缓冲液(pH 2.0)对传感器芯片进行再生。利用BIAevaluation软件,将所得传感器图拟合到1:1 Langmuir结合模型,以计算结合速率常数(ka)、解离速率常数(kd)和平衡解离常数(KD)。DC-Y13-27与YTHDF2的结合KD为37.9 uM。等温滴定量热法(ITC)也可用于验证结合的热力学性质和亲和力。除SPR外,尚未有针对该化合物的特定酶-受体结合方法报道。
细胞实验
在包括HCT116(结肠癌)、A375(黑色素瘤)、MDA-MB-231(乳腺癌)和大鼠原代髓核细胞(用于椎间盘退行性变)在内的人类癌细胞系中,进行了YTHDF2抑制的细胞学实验。细胞在含10%胎牛血清的DMEM或RPMI-1640培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养。DC-Y13-27用DMSO溶解至50 mM的储备液,然后用培养基稀释至终浓度分别为1、10、25、50和100 uM(终DMSO浓度≤0.1%)。对于m6A依赖性基因调控的研究,细胞用DC-Y13-27处理24-72小时。使用TRIzol提取总RNA并进行逆转录。采用定量RT-PCR检测FOXO3、TIMP1、MMP1、MMP3、MMP7、MMP9和IL-1β的表达水平。蛋白质分析方面,制备全细胞裂解液,经SDS-PAGE电泳分离后,进行Western blot分析,使用针对FOXO3、TIMP1、MMP1、MMP3、MMP7、MMP9、IL-1β、裂解型GSDMD(gasdermin D;细胞焦亡标志物)以及β-肌动蛋白(作为内参)的抗体。为评估细胞焦亡,将细胞用DC-Y13-27处理24小时,然后用碘化丙啶(PI)和Annexin V染色。通过流式细胞术测定PI阳性(坏死/焦亡)细胞的百分比。此外,还进行LDH释放试验,以检测细胞膜损伤,这是细胞焦亡的标志性特征。采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力。为评估 DC-Y13-27 对放射敏感性的影响,将细胞用 DC-Y13-27 预处理 4 小时,然后暴露于递增剂量的电离辐射(2-10 Gy,使用铯-137 或 X 射线照射器)。7-10 天后,进行克隆形成实验,以计算存活分数和放射增敏增强比 (SER)。
动物实验
在C57BL/6小鼠的MC38同源结肠癌模型中评估体内疗效。为研究肿瘤生长延迟,将1 × 10⁶个MC38细胞皮下注射到6-8周龄的雌性C57BL/6小鼠体内。当肿瘤体积达到约100 mm³(第7-10天)时,将小鼠随机分组(每组n = 10)。DC-Y13-27配制于含5% DMSO和10% Cremophor EL的PBS溶液中,或配制于10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45%生理盐水溶液中,并以25-100 mg/kg的剂量腹腔注射,每日一次,连续14-21天。放射治疗中,肿瘤采用小动物放射治疗仪(例如 X-RAD 225Cx)进行局部照射,剂量为 8-12 Gy,可单次照射或分 5 次(每次 2 Gy)照射。抗 PD-L1 联合治疗研究中,小鼠接受抗小鼠 PD-L1 抗体(10 mg/kg,腹腔注射,每周两次)。每 2-3 天测量一次肿瘤体积(长 × 宽²/²)。主要终点为肿瘤生长抑制率(TGI,%)。研究结束时,切除肿瘤,称重,并进行流式细胞术分析,检测 CD8+ T 细胞、CD4+ T 细胞、调节性 T 细胞(FoxP3+)以及 TUNEL 染色以评估细胞凋亡。在椎间盘退变(IVDD)模型中,雄性Sprague-Dawley大鼠(200-250 g)接受尾椎间盘(Caudal 7-10)穿刺。DC-Y13-27以10-25 mg/kg/天的剂量腹腔注射,持续4周。通过X线测量椎间盘高度指数(DHI)。对取出的椎间盘进行HE染色和番红O染色,并进行组织学分级(Pfirrmann评分或改良Boos评分)。同时进行MMP13、聚集蛋白聚糖和II型胶原的免疫染色。与载体对照组相比,DC-Y13-27显著维持了椎间盘高度,并降低了组织学退变评分。
药代性质 (ADME/PK)
已发表的文献尚未对DC-Y13-27的药代动力学进行全面表征。作为一种小分子化合物(游离碱的分子量为270.3,盐酸盐的分子量略高),预计可通过腹腔注射(ip)或口服给药吸收。该化合物可溶于DMSO(浓度最高可达50 mg/mL),用于体内给药时,通常配制于含有DMSO/PEG300/Tween-80/生理盐水或含5% DMSO和10% Cremophor EL的PBS的载体中。在已描述的临床前研究中,腹腔注射是首选给药途径,剂量范围为25-100 mg/kg。目前尚无关于DC-Y13-27的半衰期(t½)、Cmax、Tmax、AUC、口服生物利用度、血浆蛋白结合率或代谢数据的报道。该化合物从循环中清除迅速,因此需要每日给药。盐酸盐形式可能用于提高水溶性。鉴于其每日一次的给药方案,DC-Y13-27 具有足够的代谢稳定性,可在 24 小时内持续抑制靶点。其组织分布、脑渗透和排泄途径尚未公布。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DC-Y13-27 的毒性特征尚未完全明确。在 MC38 结肠癌异种移植模型中,腹腔注射 DC-Y13-27,剂量为 50-100 mg/kg/天,持续 14-21 天,耐受性良好,未出现显著的体重下降(较基线下降超过 15%),未出现明显的毒性反应(嗜睡、弓背、腹泻),也未出现与治疗相关的死亡。尚未报道任何特定的器官毒性(肝毒性、肾毒性)。在大鼠 IVDD 模型中,腹腔注射 DC-Y13-27,剂量为 10-25 mg/kg,持续 28 天,耐受性也良好。处理粉末时应采取标准的实验室安全防护措施(戴手套、穿实验服、戴护目镜)。根据材料安全数据表 (MSDS),DC-Y13-27 不属于危险物质或混合物。但是,应避免吸入、接触眼睛和皮肤,并避免产生粉尘和气溶胶。仅在通风良好的区域使用。DC-Y13-27 仅供研究使用;不得用于临床治疗或诊断。目前尚无人体毒理学数据。
参考文献

[1]. YTHDF2 inhibition potentiates radiotherapy antitumor efficacy. Cancer Cell. 2023 May 15:S1535-6108(23)00163-0.

其他信息
YTHDF2(YTH结构域蛋白家族2)是一种m6A(N6-甲基腺苷)识别蛋白,能够选择性地结合m6A修饰的RNA转录本并促进其降解。m6A是真核生物mRNA中最丰富的内部修饰,参与调控RNA的剪接、输出、稳定性以及翻译。YTHDF2是“表观转录组”的关键组成部分。YTHDF2的过表达与多种癌症(包括急性髓系白血病、胶质母细胞瘤、乳腺癌和结肠癌)相关,并促进肿瘤进展和治疗耐药性。YTHDF2还通过促进FOXO3和TIMP1 mRNA的降解,在椎间盘退变的发生发展中发挥作用。因此,YTHDF2被认为是癌症和退行性疾病的潜在治疗靶点。 DC-Y13-27 是首个已发表的选择性 YTHDF2 小分子抑制剂,由 DC-Y13 通过构效关系优化衍生而来。DC-Y13-27 通过抑制 YTHDF2,稳定 FOXO3(一种肿瘤抑制因子)和 TIMP1(一种 MMP 抑制剂)的 mRNA,从而抑制 MMP 介导的细胞外基质降解,并诱导炎症细胞死亡途径——细胞焦亡。该化合物能够增强放疗和免疫疗法(抗 PD-L1)的抗肿瘤疗效,使其成为探索肿瘤免疫联合治疗策略的重要研究工具。DC-Y13-27 仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H10N2O2S
分子量
270.31
外观&性状
Yellow to orange solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~125 mg/mL (~462.43 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.6995 mL 18.4973 mL 36.9946 mL
5 mM 0.7399 mL 3.6995 mL 7.3989 mL
10 mM 0.3699 mL 1.8497 mL 3.6995 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们