DAPK Substrate Peptide TFA

目录号: V77106 纯度: ≥98%
DAPK 底物肽 TFA 是一种合成的死亡相关蛋白激酶 (DAPK) 肽底物,Km 为 9 μM。
DAPK Substrate Peptide TFA 产品类别: DAPK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
DAPK 底物肽 TFA 是一种合成的死亡相关蛋白激酶 (DAPK) 肽底物,其 Km 值为 9 μM。
DAPK底物肽TFA是一种合成肽,可作为死亡相关蛋白激酶(DAPK)的底物。该肽由15至17个氨基酸组成,来源于肌球蛋白轻链(MLC)磷酸化位点或其他已知的DAPK靶位点。它包含DAPK的核心识别基序,可用于体外定量DAPK激酶活性。该肽底物的DAPK米氏常数(Km)为9 microM。TFA盐形式可提高溶解度和操作性。
生物活性&实验参考方法
靶点
DAPK (death-associated protein kinase) is a calcium/calmodulin (CaM)-dependent serine/threonine protein kinase that plays a key role in apoptosis, autophagy, and tumor suppression. DAPK Substrate Peptide TFA is not a drug and does not bind to a receptor; rather, it is a peptide sequence recognized and phosphorylated by DAPK. The peptide substrate contains specific amino acid residues (usually an arginine in the -3 position and a hydrophobic residue at the phosphorylation site) that fit into the catalytic pocket of DAPK. DAPK phosphorylates the substrate peptide at a serine or threonine residue, and the reaction can be quantified in vitro.
体外研究 (In Vitro)
该底物肽本身不具有固有的生物活性;其用途在于作为体外测定DAPK酶活性的工具。它可用于测定DAPK的动力学参数(Km、Vmax),筛选DAPK抑制剂或激活剂,以及测定细胞裂解液或免疫沉淀物中的DAPK活性。该肽与DAPK的Km值为9 uM,表明其对活性位点具有中等偏高的亲和力。TFA盐形式用作激酶活性测定中的标准底物。该底物肽不具有其他相关的体外“活性”。
体内研究 (In Vivo)
由于DAPK底物肽TFA是一种研究工具,因此不用于体内给药。它仅用于体外激酶活性测定,不具备体内治疗活性。该底物肽本身如果注射,会被蛋白酶迅速降解,不会产生显著的生物学效应。其作用仅限于用于研究DAPK功能的生化和无细胞实验。目前尚未进行过单独使用该肽的体内动物实验;它仅用作试剂。
酶活实验
DAPK底物肽TFA用于体外激酶活性测定,所用DAPK为纯化的重组DAPK(全长或催化结构域)。DAPK活性测定的标准方案如下:配制激酶反应缓冲液,其中包含50 mM HEPES-NaOH(pH 7.5)、10 mM MgCl2、2 mM MnCl2、1 mM DTT、0.1 mM CaCl2、0.5 uM钙调蛋白(CaM)和50 uM ATP(包括1-10 uCi的γ-32P-ATP或33P-ATP)。将DAPK底物肽(序列衍生自KKALRRQE FVA S,不同供应商的序列可能有所不同)加入反应混合物中,浓度范围为0至200 uM(通常为0、10、25、50、100和200 uM)。反应通过向反应体系中加入DAPK(10-50 ng)启动,最终反应体积为25-50 uL。在30℃孵育15-30分钟后,加入10%三氯乙酸(TCA)或点样至P81磷酸纤维素滤纸上终止反应。对于P81滤纸法,取20 uL反应混合物点样至1 cm2的P81滤纸片上。滤纸片用75 mM磷酸溶液洗涤3次(每次10分钟),再用丙酮洗涤1次,然后干燥。放射性(掺入的32P)通过液体闪烁计数法测定。掺入的磷酸盐量(pmol)根据ATP的比活度计算。动力学参数(Km、Vmax)通过非线性回归(例如使用GraphPad Prism软件)拟合米氏方程(反应速率与底物浓度的关系)获得。对于底物肽,测得其 Km 值为 9 uM。也可计算其周转数 (kcat)。为测定复杂生物样品(例如细胞裂解液)中的 DAPK 活性,可在 DAPK 免疫沉淀后使用该底物肽。对于抑制剂筛选,在加入底物肽之前,先将测试化合物与 DAPK 预孵育 10 分钟。然后计算 DAPK 抑制剂的 IC50 值。
细胞实验
由于DAPK底物肽并非药物,因此不用于标准的细胞活力或增殖检测。然而,它可用于基于细胞裂解液的激酶活性检测。在一个典型的实验方案中,将细胞(例如HeLa细胞、HEK-293细胞或癌细胞)培养于10 cm培养皿中(汇合度为80-90%)。用冰冷的PBS洗涤细胞,然后在RIPA裂解缓冲液或非变性裂解缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.4、150 mM NaCl、1% NP-40、0.5%脱氧胆酸钠、0.1% SDS、1 mM DTT、1 mM PMSF和蛋白酶抑制剂)中裂解细胞。裂解液在4℃下以13,000 rpm离心10分钟以去除细胞碎片。蛋白质浓度通过BCA法测定。每次反应使用 50-200 ug 细胞裂解液。或者,使用特异性抗 DAPK 抗体和蛋白 A/G 琼脂糖珠从细胞裂解液中免疫沉淀 DAPK。免疫沉淀的琼脂糖珠用激酶缓冲液洗涤 2-3 次。然后按照“酶/受体结合”部分所述进行 DAPK 活性测定,使用 DAPK 底物肽 TFA (50-200 uM) 和 γ-32P-ATP (50 uM,0.5-1 uCi/反应)。反应终止后,将混合物点样至 P81 滤纸上,洗涤后计数。活性以每分钟每毫克细胞裂解液(或每个免疫沉淀物)掺入的磷酸盐的皮摩尔数表示。为了控制 DAPK 的含量,使用相同的细胞裂解液进行平行实验,通过 Western blot 检测 DAPK 蛋白水平。 DAPK底物肽也用于无需放射性的基于FRET或基于发光(ADP-Glo)的激酶活性测定。对于ADP-Glo测定,将10 uL激酶反应体系(40 mM Tris pH 7.5、20 mM MgCl2、0.1 mg/mL BSA、50 uM ATP、200 uM底物肽和50 ng DAPK)孵育60分钟。然后加入10 uL ADP-Glo试剂,孵育40分钟,再加入20 uL激酶检测试剂,孵育30分钟,最后读取发光值。发光信号与ADP浓度(激酶活性)成正比。DAPK底物肽TFA在此测定中用作标准底物。
动物实验
该肽是一种实验室试剂,不用于动物疗效研究。然而,它可用于检测从疾病动物模型(例如,肿瘤异种移植、缺血再灌注损伤、神经退行性疾病模型)中获取的组织中DAPK的体外活性。典型的体外实验方案是:处死小鼠或大鼠,迅速切取目标组织(例如,脑、肝、肿瘤),液氮速冻后储存于-80℃。将冷冻组织用组织研磨器或超声破碎仪在裂解缓冲液中研磨匀浆。离心澄清裂解液。使用抗DAPK抗体从裂解液(500-1000 μg总蛋白)中免疫沉淀DAPK。洗涤免疫沉淀物,并按照所述方法,使用DAPK底物肽TFA和32P-ATP测定DAPK活性。通过比较不同处理组(例如,药物处理组与载体组)的结果,确定治疗对体内DAPK活性的影响。在药理学研究中,可在组织采集前向动物施用测试化合物(假定的DAPK抑制剂或激活剂)(例如,通过灌胃或腹腔注射),然后使用底物肽在体外测量DAPK活性。这种方法将分子效应(DAPK活性的变化)与体内治疗联系起来。活体动物实验中不使用肽本身。
药代性质 (ADME/PK)
由于该肽仅作为体外研究底物,其药代动力学研究意义不大。它不会进入体循环,也没有治疗用途。三氟乙酸(TFA)反离子可提高该肽的溶解度和固态稳定性,使其可用作实验室试剂。该肽的分子量约为1692.84 Da。在浓度高达10 mg/mL时,该肽可溶于水或PBS缓冲液。配制储备液时,通常将该肽溶于水或50 mM Tris-HCl缓冲液(pH 7.5)中,并分装后储存于-20℃或-80℃,以避免反复冻融。TFA盐形式的肽在-20℃避光防潮干燥条件下可稳定保存2年。除标准实验室安全操作规程外,该肽无需特殊处理。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DAPK底物肽TFA是一种合成肽(TFA盐),仅用于研究用途。它不适用于人类或兽医用途。该肽的毒理学特性与其他任何基于肽的实验室试剂并无差异。TFA的抗衡离子是三氟乙酸根阴离子,其在最终产品中的残留量(通常<5%)被认为是安全的。急性毒性可忽略不计;由于该化合物不用于体内给药,因此LD50不适用。操作时应采取标准预防措施:佩戴手套、实验服和护目镜。避免吸入粉末,并避免皮肤接触(尽管刺激风险较低)。该化合物目前尚未发现具有致突变性、致癌性或发育毒性。如果意外摄入或注射大量(可能性很小),应立即就医。处置时,请遵循机构关于非危险化学废物的处理指南。为保持稳定性,本产品应储存于-20℃的密封干燥容器中,避光防潮。DAPK底物肽TFA仅供研究使用。
参考文献

[1]. Velentza AV. A protein kinase associated with apoptosis and tumor suppression: structure, activity, and discovery of peptide substrates. J Biol Chem. 2001;276(42):38956-38965.

其他信息
死亡相关蛋白激酶 (DAPK) 是一种受钙离子/钙调蛋白调控的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,是细胞凋亡(程序性细胞死亡)的正向介质。DAPK 参与多种细胞过程,包括细胞凋亡、自噬、细胞骨架重组和肿瘤抑制。由于启动子高甲基化,许多人类癌症(例如非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、结直肠癌)中均观察到 DAPK 表达或活性降低,这与预后不良和转移潜能相关。因此,DAPK 被认为是一种肿瘤抑制因子。DAPK 底物肽来源于已知的 DAPK 磷酸化位点,通常是肌球蛋白轻链 (MLC) 或高亲和力合成肽。底物序列通常为 RRFS*V(其中 S* 为可磷酸化的丝氨酸)或类似序列。研究级肽的具体序列可能因生产商而异,但其共同结构基序基于MLC磷酸化位点。该肽的Km值为9 μM,这是丝氨酸/苏氨酸激酶肽底物的典型值。三氟乙酸(TFA)盐形式用于将肽从固相合成树脂中转化为稳定、可溶且可结晶的粉末。DAPK底物肽用于DAPK活性测定,用于筛选DAPK抑制剂(例如,用于癌症治疗,因为DAPK的重新激活可能抑制肿瘤生长)或激活剂(用于神经保护)。它也用于旨在调节DAPK活性的药物研发项目。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C72H116F3N25O19
分子量
1692.84
相关CAS号
DAPK Substrate Peptide;386769-53-5
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~50 mg/mL (~29.54 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.5907 mL 2.9536 mL 5.9072 mL
5 mM 0.1181 mL 0.5907 mL 1.1814 mL
10 mM 0.0591 mL 0.2954 mL 0.5907 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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