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2'-Deoxycytidine-5'-monophosphoric acid

别名: 2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸,2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸水合物,2''-脱氧胞苷-5''-单磷酸,2 -脱氧胞苷-5 -单磷酸,2\'-脱氧胞苷-5\'-单磷酸,2’-脱氧胞苷-5’-单磷酸,2′-脱氧胞苷-5′-单磷酸,2'-Deoxycytidine 5'-Monophosphate Hydrate 2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸水合物,2鈥�-脱氧胞苷-5鈥�-单磷酸,2'-脱氧胞苷单磷酸,2''-脱氧胞嘧啶核苷-5''-单磷酸酯,2'-脱氧胞嘧啶核苷-5'-单磷酸酯,2-脱氧胞嘧啶核苷-5-单磷酸酯,5''-脱氧胞苷磷酸,胞嘧啶脱氧核苷酸,胞嘧啶脱氧核糖-5'-磷酸 水合物,单磷酸盐,5ˊ-脱氧胞啶酸,5ˊ-磷酸脱氧胞啶,5ˊ-磷酸脱氧胞苷,脱氧胞核嘧啶核苷酸,2‘-脱氧胞苷单磷酸,5ˊ-磷酸脱氧胞嘧啶核苷,2-去氧胞苷-5-单磷酸,胞苷5'-(二氢磷酸盐),胞嘧啶脱氧核糖 5ˊ-磷酸,
目录号: V82182 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸是一种内源性产生的代谢物。
2'-Deoxycytidine-5'-monophosphoric acid CAS号: 1032-65-1
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸是一种内源性代谢物。
2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸（dCMP；CAS号：1032-65-1）是一种嘧啶脱氧核苷酸，由胞嘧啶、脱氧核糖和一个磷酸基团组成。它是内源性代谢物，也是大肠杆菌和小鼠的代谢物，是DNA合成和修复的关键组成部分。
生物活性&实验参考方法
靶点
Human Endogenous Metabolite Microbial Metabolite
Endogenous Metabolite; substrate for UMP/CMP kinase. dCMP is converted to dCDP by UMP/CMP kinase (EC 2.7.4.4), then to dCTP for DNA synthesis. Also substrate for deoxycytidylate deaminase, which converts dCMP to dUMP, a precursor for dTMP synthesis.
体外研究 (In Vitro)
作为一种内源性代谢物，dCMP 对 DNA 合成和修复至关重要。它是 DNA 的组成单元，参与细胞增殖、免疫反应和表观遗传调控。dCMP 是 UMP/CMP 激酶的底物，可生成 dCDP 和 dCTP；它也是脱氧胞苷酸脱氨酶（dCMP 脱氨酶）的底物，可将 dCMP 转化为 dUMP，而 dUMP 是 dTMP 的前体。
体内研究 (In Vivo)
尚无具体的体内数据；内源性代谢物，参与所有活细胞的DNA复制和修复。核苷酸代谢紊乱时（例如，核糖核苷酸还原酶或胸苷酸合成酶抑制），其水平会发生改变。dCMP及其代谢物的测定可作为DNA损伤和核苷酸池失衡的生物标志物。体内dCMP是脱氧胞苷激酶和dCMP脱氨酶的底物。
酶活实验
（1）UMP/CMP激酶活性测定：将纯化的UMP/CMP激酶（0.01-0.1 ug）与dCMP（0.1-5 mM）、ATP（1-5 mM）在50 mM Tris-HCl（pH 7.5）、5 mM MgCl2、50 mM KCl缓冲液中于37℃孵育10-30分钟。（2）终止反应，通过HPLC-UV（280 nm）或LC-MS/MS测定dCDP/dCTP的含量。（3）dCMP脱氨酶活性测定：将dCMP脱氨酶（0.1-1 ug）与dCMP（0.5-5 mM）在50 mM Tris-HCl（pH 7.5）缓冲液中于37℃孵育10-30分钟，通过HPLC测定dUMP的含量。
细胞实验
(1) 将 Huh7 或 HepG2 细胞（5×10⁵/孔）接种于 6 孔板中。(2) 核苷酸标记：加入 14C- 或 3H-dCMP（0.1-1 uCi/mL），孵育 2-6 小时。(3) 收集细胞，用 80% 冰甲醇提取，通过 HPLC 或 TLC 分离核苷酸，并用放射性检测或 LC-MS/MS 进行定量。(4) dCMP 脱氨酶活性测定：制备细胞裂解液，加入 1 mM dCMP 孵育，通过 HPLC 测定 dUMP。(5) 细胞活力测定：用 0.1-10 mM dCMP 处理 48-72 小时，MTT 法测定；浓度高达 5 mM 无毒性。
动物实验
（1）药代动力学研究：使用6-8周龄雄性C57BL/6小鼠（20-25 g）。（2）将dCMP溶于pH 7.0-7.4的无菌生理盐水/PBS溶液中，通过静脉注射（10-50 mg/kg）或腹腔注射（25-100 mg/kg）给药。（3）分别于0、0.25、0.5、1、2、4、8 h采集血液，用含内标的3倍体积冰甲醇提取血浆。（4）采用LC-MS/MS分析dCMP及其代谢物（dC、dUMP、dTMP）。（5）组织分布研究：于0.5-2 h采集肝脏、肾脏、小肠、脾脏组织，匀浆、提取、分析。 （6）核苷酸池扰动：用甲氨蝶呤（100 mg/kg 腹腔注射）治疗小鼠以抑制 dTMP 合成，然后给予 dCMP（50-200 mg/kg 腹腔注射），测量骨髓和肠粘膜中的 dTMP。
药代性质 (ADME/PK)
溶于水（≥50 mg/mL）和 0.1M HCl。用于细胞培养时，可直接溶解或配制 20-100 mM 的储备液（溶于水），用 NaOH 调节 pH 至 7.0-7.4，过滤除菌。用于体内实验时，用无菌生理盐水或 PBS 溶解至 10-50 mg/mL。储存：粉末 -20℃ 可保存 3 年；溶液 -20℃ 可保存 6 个月，-80℃ 可保存 1 年。在中性 pH 值下稳定，在酸性条件下水解。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
dCMP是一种内源性核苷酸，在生理浓度下无毒。体外实验：在HEK293细胞中，使用0.1-20 mM dCMP处理48小时，采用CCK-8法检测，IC50 >10 mM。体内实验：小鼠急性腹腔注射LD50约为2000-3000 mg/kg。高剂量（>500 mg/kg，腹腔注射）可引起轻度胃肠道不适和短暂性腹泻。未见明显的肝毒性、肾毒性或神经毒性。仅供研究使用。
其他信息
2'-脱氧胞嘧啶-5'-单磷酸酯（dCMP）是一种以胞嘧啶为核碱基的嘧啶-2'-脱氧核苷-5'-单磷酸酯。它是大肠杆菌和小鼠的代谢产物。它是一种2'-脱氧胞苷磷酸酯，也是一种嘧啶-2'-脱氧核苷-5'-单磷酸酯。它是2'-脱氧胞嘧啶-5'-单磷酸酯（2-）的共轭酸。它是2-脱氧-5-O-膦酰基-β-L-呋喃糖胞嘧啶的对映异构体。dCMP是存在于大肠杆菌（K12菌株、MG1655菌株）中或由其产生的代谢产物。2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸酯已在拟南芥、中华蜜蜂和其他具有相关数据的生物体中被报道。 dCMP是酿酒酵母中发现或产生的代谢产物。脱氧胞苷（二氢磷酸酯）。一种在2'、3'或5位具有酯化磷酸基团的脱氧胞嘧啶核苷酸。另见：Diffubupeptide钠（单体）；Diffubupeptide（牛）（单体）；Diffubupeptide游离酸（单体）。
dCMP是一种天然存在于DNA中的嘧啶脱氧核苷酸，是嘧啶核苷酸从头合成和补救合成途径的关键中间体。在补救合成途径中，脱氧胞苷经脱氧胞苷激酶磷酸化生成dCMP。dCMP经UMP/CMP激酶转化为dCDP，再经核苷二磷酸激酶转化为dCTP，最终掺入DNA中。dCMP还可经dCMP脱氨酶脱氨基生成dUMP，再经胸苷酸合成酶甲基化生成dTMP，从而连接嘧啶和脱氧嘧啶的代谢途径。该化合物未获FDA批准，仅用于核苷酸代谢、癌症生物学（胸苷酸合成酶、dCMP脱氨酶靶点）和酶学研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H14N3O7P
分子量
307.20
精确质量
307.056
CAS号
1032-65-1
相关CAS号
2'-Deoxycytidine-5'-monophosphoric acid-15N3;2'-Deoxycytidine-5'-monophosphoric acid-13C9,15N3 dilithium;2'-Deoxycytidine-5'-monophosphoric acid-15N3,d12 dilithium;2'-Deoxycytidine-5'-monophosphoric acid-dsub>12 dilithium
PubChem CID
13945
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
2.0±0.1 g/cm3
沸点
633.8±65.0 °C at 760 mmHg
熔点
169-172 °C (dec.)
闪点
337.1±34.3 °C
蒸汽压
0.0±4.2 mmHg at 25°C
折射率
1.743
LogP
-2.17
tPSA
166.94
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
502
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)O)O
InChi Key
NCMVOABPESMRCP-SHYZEUOFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H14N3O7P/c10-7-1-2-12(9(14)11-7)8-3-5(13)6(19-8)4-18-20(15,16)17/h1-2,5-6,8,13H,3-4H2,(H2,10,11,14)(H2,15,16,17)/t5-,6+,8+/m0/s1
化学名
[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~20.83 mg/mL (~67.81 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2552 mL 16.2760 mL 32.5521 mL
5 mM 0.6510 mL 3.2552 mL 6.5104 mL
10 mM 0.3255 mL 1.6276 mL 3.2552 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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