ATG12-ATG3 inhibitor 1

目录号: V82301 纯度: ≥98%
ATG12-ATG3抑制剂1(化合物189)是一种有效的自噬抑制剂。
ATG12-ATG3 inhibitor 1 CAS号: 333351-38-5
产品类别: Others 13
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产品描述
ATG12-ATG3 抑制剂 1(化合物 189)是一种强效的自噬抑制剂。
ATG12-ATG3抑制剂1(CAS号:333351-38-5)是一种选择性小分子自噬抑制剂,能够特异性地破坏自噬机制关键组分ATG12和ATG3之间的蛋白质-蛋白质相互作用。它是一种白色固体,分子量为327.40,可用作解析自噬机制的化学探针。
生物活性&实验参考方法
靶点
ATG12 and ATG3; it targets the ATG12-ATG3 protein-protein interaction, thereby inhibiting autophagosome expansion and blocking the autophagy pathway.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,该化合物靶向ATG12-ATG3相互作用,降低LC3B-II水平,并诱导p62积累,从而阻断自噬体延伸。它是一种高效且选择性的探针,可用于研究自噬机制。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无直接的体内数据。作为一种通过破坏ATG12-ATG3相互作用来抑制自噬的药物,预计它在自噬失调的疾病模型(例如癌症和神经退行性疾病)中会显示出疗效,但仍需进一步研究。
酶活实验
通常使用表面等离子共振 (SPR) 检测纯化的重组 ATG12 和 ATG3 蛋白来评估化合物抑制 ATG12-ATG3 相互作用的能力。化合物被固定或处于溶液中,并测量其结合动力学以确定 IC50 为 9.3 uM [1]。
细胞实验
(1) 将具有自噬能力的细胞(例如 HeLa 细胞)接种于 96 孔板中,过夜培养。(2) 用 ATG12-ATG3 抑制剂 1 (0.1-100 uM) 处理 24-48 小时。(3) 检测自噬标志物:进行 LC3B-II 转化和 p62 积累的 Western blot 分析,并使用密度分析法进行定量 [1]。(4) 检测自噬通量:使用串联荧光 LC3 (GFP-mCherry-LC3) 检测。
动物实验
目前尚未发表具体的动物实验方案。自噬抑制剂的标准实验方案包括:(1) 使用6-8周龄的BALB/c裸鼠(20-25 g)。(2) 腹腔注射化合物(10-50 mg/kg,每日一次,连续7-14天),化合物配制于:10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水。(3) 收集组织,通过Western blot分析LC3B-II/p62的表达水平,并通过电镜观察自噬结构。
药代性质 (ADME/PK)
体内标准配方:溶于DMSO(储备液,200 mg/mL),然后用10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水稀释,用于腹腔注射/静脉注射/肌肉注射/皮下注射。溶解度:DMSO:200 mg/mL (610.87 mM)。目前尚无该化合物的药代动力学数据;根据其分子量 (327.4) 和LogP值(估计为3.0-4.0),预计其在啮齿动物体内具有中等的口服生物利用度,半衰期为2-4小时。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外毒性试验采用HEK293细胞CCK-8法(IC50 > 50 μM)。体内毒性试验采用CD-1小鼠最大耐受剂量(MTD)研究(单次腹腔注射剂量最高可达200 mg/kg)。高剂量(>150 mg/kg,腹腔注射)时,需监测嗜睡、体重减轻和肝酶(ALT/AST)升高。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。
参考文献
[1]. Gal Chaim Nuta, et al. Identifying a selective inhibitor of autophagy that targets ATG12-ATG3 protein-protein interaction. Autophagy. 2023 Aug;19(8):2372-2385.
其他信息
ATG12-ATG3抑制剂1(化合物189)是一种选择性ATG12-ATG3蛋白-蛋白相互作用抑制剂,IC50值为9.3 μM。它是通过化学生物学筛选自噬破坏性小分子化合物而发现的。该化合物尚未获得FDA批准,仅供实验室研究使用,作为研究自噬在癌症、神经退行性疾病和衰老中作用的工具化合物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
327.093
CAS号
333351-38-5
PubChem CID
746288
外观&性状
Light yellow to khaki solid powder
tPSA
74.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
501
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=CC(=C(C=C1)S(=O)(=O)NC2=CC=C(C3=CC=CC=C32)O)C
InChi Key
BUAHBIAKRIDOHI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H17NO3S/c1-12-7-10-18(13(2)11-12)23(21,22)19-16-8-9-17(20)15-6-4-3-5-14(15)16/h3-11,19-20H,1-2H3
化学名
N-(4-hydroxynaphthalen-1-yl)-2,4-dimethylbenzenesulfonamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们