Lenalidomide-C5-NH2 TFA

目录号: V82637 纯度: ≥98%
Lenalidomide-C5-NH2 HCl 是一种基于 Lenalidomide 的 Cereblon 配体,可招募 CRBN 蛋白。
Lenalidomide-C5-NH2 TFA CAS号: 2550398-71-3
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
500mg
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  • Lenalidomide-C5-NH2 hydrochloride
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产品描述
来那度胺-C5-NH2 HCl 是一种基于来那度胺的 Cereblon 配体,可募集 CRBN 蛋白。来那度胺-C5-NH2 可通过连接子与靶蛋白配体偶联,形成 PROTAC 分子,例如 MDM2 的 PROTAC 降解剂。
Lenalidomide-C5-NH2 TFA 是一种合成的 E3 泛素连接酶配体-连接子偶联物,它包含一个基于 Lenalidomide 的 cereblon (CRBN) 配体和一个末端带有伯胺 (NH2) 基团的五碳 (C5) 烷基连接子,并以三氟乙酸 (TFA) 盐的形式存在。该偶联物用于 PROTAC 技术,以募集 cereblon E3 泛素连接酶复合物进行靶向蛋白降解。伯胺基团可通过酰胺键形成与含有羧酸的靶蛋白配体偶联,所用偶联剂为标准偶联试剂(例如 EDC/NHS)。C5 烷基间隔基在 cereblon 配体和偶联的靶蛋白配体之间提供了一个中等长度、柔性且疏水的连接。TFA 盐形式提高了溶解度和操作性。分子式为C18H23F3N4O5,分子量为432.40。标准纯度≥95%,呈固体状。为保证长期稳定性,应密封保存于-20℃,并避免受潮。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
CRBN (cereblon), an E3 ubiquitin ligase.
体外研究 (In Vitro)
作为一种与cereblon结合的配体-连接子偶联物,来那度胺-C5-NH2 TFA本身不具有内在的生物活性;其功能是募集E3泛素连接酶复合物。末端伯胺通过酰胺键的形成与靶蛋白配体偶联,该过程使用标准偶联试剂(例如EDC、HATU)。由此产生的PROTAC可以同时结合靶蛋白和cereblon,从而导致靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。C5烷基连接子提供了一个中等长度的柔性疏水间隔基,这对于靶向细胞内蛋白的PROTAC而言是有利的,因为这类PROTAC需要一定的亲脂性才能渗透细胞。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该缀合物本身具有特定的体内活性;其体内降解活性仅在与靶蛋白配体缀合形成完整的PROTAC分子时才能观察到。此类PROTAC的体内疗效通常在靶向疾病的动物模型中进行评估。
酶活实验
不适用;该化合物未在分离的酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体,其质量通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认,标准纯度≥95%。其与cereblon的结合亲和力已通过表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 等生物物理方法,作为完整PROTAC构建体的一部分进行验证。C5烷基连接基可通过质谱法进行表征。三氟乙酸 (TFA) 反离子可通过离子色谱法进行检测。
细胞实验
不适用;该缀合物未单独进行细胞实验测试,而是用作构建PROTAC的构建模块。典型的缀合步骤中,使用EDC和NHS或HATU活化(或直接反应)末端伯胺与含羧酸的靶蛋白配体。然后,通过Western印迹法在表达靶蛋白的癌细胞中检测所得PROTAC的降解活性,以确定DC50(半数最大降解浓度)。C5烷基连接基可能对某些靶蛋白-E3连接酶对最为有利。TFA盐可提高水溶性。
动物实验
不适用;未对单独的配体-连接子偶联物进行动物研究。对于完整的PROTAC的体内研究,将该分子配制在合适的载体中(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45% 生理盐水),并通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给药于动物模型。监测组织中的靶点降解和肿瘤生长抑制情况。C5烷基连接子可能会影响最终PROTAC的亲脂性和细胞渗透性。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量为432.40,分子式为C18H23F3N4O5,标准纯度≥95%。其IUPAC名称为3-(4-((5-氨基戊基)氨基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮2,2,2-三氟乙酸酯。储存时,应密封保存于-20℃,干燥,保存期限最长可达3年。该化合物可溶于DMSO。产品应储存于密封容器中,避光保存。CAS号:2550398-71-3。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。操作时应遵循标准化学品安全预防措施。本产品在推荐的储存条件下稳定。它并非获批的治疗药物,也未获准用于临床。来那度胺是一种免疫调节药物(IMiD),临床上用于治疗多发性骨髓瘤和骨髓增生异常综合征;本衍生物仅供研究用途。
参考文献

[1]. Discovery of a Small-Molecule Degrader of Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Proteins with Picomolar Cellular Potencies and Capable of Achieving Tumor Regression. J Med Chem. 2018;61(2):462-481.

[2]. Discovery of MD-224 as a First-in-Class, Highly Potent, and Efficacious Proteolysis Targeting Chimera Murine Double Minute 2 Degrader Capable of Achieving Complete and Durable Tumor Regression. J Med Chem. 2019;62(2):448-466.

其他信息
C5烷基连接基(五碳链)提供了一个长度适中、柔性且疏水的间隔基,对于结合位点之间距离适中的靶标-E3连接酶对而言,该间隔基可能是最佳选择。该缀合物是构建具有不同长度烷基连接基的cereblon募集PROTAC的重要结构单元。末端伯胺基团可通过标准的酰胺偶联反应直接与靶蛋白配体偶联。TFA盐形式可提高溶解度并便于操作。该化合物也称为来那度胺-C5-NH2 TFA,广泛应用于PROTAC研究中,用于靶向蛋白降解。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
443.167
CAS号
2550398-71-3
相关CAS号
Lenalidomide-C5-NH2 hydrochloride;2595367-27-2
PubChem CID
162640763
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
tPSA
130
氢键供体(HBD)数目
3
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
591
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CC(=O)NC(=O)C1N2CC3=C(C=CC=C3C2=O)CCCCCN.C(=O)(C(F)(F)F)O
InChi Key
XTHUZCHGWIIXLO-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H23N3O3.C2HF3O2/c19-10-3-1-2-5-12-6-4-7-13-14(12)11-21(18(13)24)15-8-9-16(22)20-17(15)23;3-2(4,5)1(6)7/h4,6-7,15H,1-3,5,8-11,19H2,(H,20,22,23);(H,6,7)
化学名
3-[7-(5-aminopentyl)-3-oxo-1H-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione;2,2,2-trifluoroacetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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