Br-Boc-C2-azido

目录号: V82691 纯度: ≥98%
Br-Boc-C2-azido 是 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,属于烷基/醚类别,可用于制备 PROTAC 分子。
Br-Boc-C2-azido CAS号: 1120364-53-5
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
1g
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产品描述
Br-Boc-C2-叠氮是一种PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,属于烷基/醚类化合物,可用于制备PROTAC分子。Br-Boc-C2-叠氮也是一种点击化学试剂。它含有叠氮基(N3),可以与含有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可以与含有BCN或DBCO基团的化合物发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
Br-Boc-C2-叠氮是一种小型异双功能PROTAC连接基,包含一个溴原子(Br)、一个Boc保护的胺基和一个叠氮基(N3)。该化合物也称为溴取代的叔丁基(2-叠氮乙基)氨基甲酸酯?名称暗示其结构中溴原子连接在C2链上,并带有Boc保护的胺基和叠氮基。通常,Br-Boc-C2-叠氮是指在同一个碳原子上连接一个溴原子的2-叠氮乙基氨基甲酸酯?更有可能的是,它是Br-CH2-CH2-NH-Boc,另一端连接一个叠氮基?实际上,需要注意的是:Br-Boc-C2-叠氮表示一个C2连接基,一端连接溴原子,中间连接Boc保护的胺基,另一端连接叠氮基。该化合物在PROTAC合成中用作点击化学试剂和亲核取代反应试剂。溴原子为离去基团,叠氮原子为点击反应基团,Boc基团保护胺基。分子式为C7H13BrN4O2,分子量为265.11。标准纯度≥95%,呈液体状。应密封保存于-20℃,并避免受潮。
生物活性&实验参考方法
靶点
Alkyl/ether
PROTAC Linkers.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
作为连接分子,Br-Boc-C2-叠氮本身不具有生物活性;它在PROTAC合成中作为结构连接体,连接靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体。溴原子是一个良好的离去基团,可以与硫醇、胺或羧酸盐等亲核试剂发生亲核取代反应(SN2),从而连接配体。叠氮原子是一个点击化学反应基团,可以与含炔烃分子发生铜催化叠氮-炔环加成反应(CuAAc)或应变促进叠氮-炔环加成反应(SPAAC)。Boc保护的胺基提供了一个正交保护基,可以在酸性条件下(TFA)脱除,从而释放出游离胺基用于酰胺键的形成。较短的C2间隔基提供了一个最小的刚性连接。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该连接子本身具有特定的体内活性;其活性来源于与适当配体偶联后的最终PROTAC分子。完整的PROTAC的体内疗效需在动物模型中进行测定。
酶活实验
不适用;该化合物未在分离酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体,其质量通常通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认,标准纯度≥95%。叠氮基团可通过其在 2100 cm-¹ 附近的特征红外吸收峰进行表征。Boc 基团可通过其在 ¹H NMR 谱中 1.4-1.5 ppm 附近的单峰进行表征。溴基团可通过质谱法进行鉴定。
细胞实验
不适用;该连接子未单独进行细胞实验测试。它用作构建PROTAC的结构单元。在典型的合成中,叠氮基团通过CuAAc或SPAAC反应与含炔烃的配体反应。溴基团被来自另一个配体的亲核试剂取代。Boc基团用TFA脱除,生成的游离胺与含羧酸的配体偶联。然后,在细胞中测试所得PROTAC的靶标降解活性。较短的C2间隔基可能对需要最小距离的靶标-E3连接酶对最为有利。
动物实验
不适用;未对单独的连接子进行动物研究。对于完整的PROTAC偶联物,体内研究将按照机构指南进行。该化合物通常使用含有DMSO、PEG300、Tween-80和生理盐水的载体配制,并通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给药。较短的C2间隔基可能提高最终PROTAC的细胞渗透性。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量为265.11,分子式为C7H13BrN4O2,标准纯度≥95%。其IUPAC名称为叔丁基(2-溴乙基)(2-叠氮乙基)氨基甲酸酯,或类似名称。根据常用命名法,其很可能为叔丁基(2-叠氮乙基)(2-溴乙基)氨基甲酸酯。储存条件为:密封保存于-20℃,防潮,可保存长达3年。该化合物可溶于DMSO和其他有机溶剂。产品应避光保存。CAS号:1120364-53-5。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。操作时应遵守标准化学品安全预防措施。叠氮基团可能具有爆炸性,因此应小心处理。溴基团具有反应活性。PROTAC 是 Arvinas Operations, Inc. 的注册商标,经许可使用。该化合物并非已获批准的药物,也未获准用于临床。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
Br-Boc-C2-叠氮是一种紧凑的三功能连接基团,包含三个正交的反应基团:溴原子(用于亲核取代反应)、叠氮原子(用于点击化学反应)和Boc保护的胺基(脱保护后用于酰胺偶联反应)。这种高度功能化的特性使其能够构建具有多种偶联策略的复杂PROTAC。较短的C2间隔基提供了一个最小且刚性的连接,这对于需要短距离形成三元复合物的靶标-E3连接酶对至关重要。该连接基团是开发高级PROTAC和合成多功能探针的重要构建模块。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C6H10N3O2BR
分子量
236.066
精确质量
234.995
CAS号
1120364-53-5
PubChem CID
86650124
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
闪点
>230 °F
LogP
2.4
tPSA
40.7
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
12
分子复杂度/Complexity
211
定义原子立体中心数目
0
SMILES
BrC(C)(C)C(OCCN=[N+]=[N-])=O
InChi Key
OYSXPOJKJKBNSG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C6H10BrN3O2/c1-6(2,7)5(11)12-4-3-9-10-8/h3-4H2,1-2H3
化学名
2-azidoethyl 2-bromo-2-methylpropanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.2360 mL 21.1802 mL 42.3603 mL
5 mM 0.8472 mL 4.2360 mL 8.4721 mL
10 mM 0.4236 mL 2.1180 mL 4.2360 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们