Benzyl-PEG9-alcohol

别名: 九乙二醇一苯甲醚,苄基-九聚乙二醇,九甘醇单苄醚,
目录号: V82747 纯度: ≥98%
Benzyl-PEG9-alcohol 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Benzyl-PEG9-alcohol CAS号: 868594-48-3
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
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产品描述
苄基-PEG9-醇是一种聚乙二醇(PEG)类PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
苄基-PEG9-醇(CAS 868594-48-3)是一种离散的单分散聚乙二醇衍生物,具有九个环氧乙烷单元、一个稳定的苄基醚保护基和一个反应性伯羟基。它是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于PROTAC的合成。该化合物一端带有苄基作为保护基,另一端带有伯羟基,可进一步进行功能化修饰。作为一种基于聚乙二醇(PEG)的PROTAC连接剂,它可用于合成一系列PROTAC。PEG9间隔基赋予其优异的水溶性和分子柔性。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
As a PEG-based PROTAC linker, Benzyl-PEG9-alcohol does not have a specific biological target itself but serves as a structural component in PROTAC molecules. The PEG category of linkers is used to connect the E3 ubiquitin ligase ligand to the target protein ligand in PROTAC design. In this context, one ligand binds to an E3 ubiquitin ligase and the other binds to the target protein; these two ligands are joined by the linker to form PROTACs. The intracellular ubiquitin-proteasome system is then utilized by PROTACs to specifically destroy target proteins.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。苄基-PEG9-醇在体外PROTAC合成和生物偶联应用中用作连接子组分。PEG9间隔基具有优异的水溶性和分子柔性,这对于靶蛋白、PROTAC和E3连接酶之间三元复合物的形成至关重要。伯醇可被活化以与各种功能基团偶联,而苄基可通过氢化去除,从而暴露出游离羟基。体外研究通常涉及将该连接子与各种配体偶联,以评估其促进蛋白质降解的有效性。
体内研究 (In Vivo)
由于苄基-PEG9-醇仅用作合成连接剂而非治疗剂,因此未报道其作为独立化合物的体内活性数据。含有该PEG9连接剂的PROTAC分子的体内疗效取决于特定的靶蛋白配体以及完整PROTAC构建体的整体药代动力学性质。作为一种亲水性PEG基连接剂,它可通过提高溶解度和降低免疫原性来改善偶联分子的药代动力学性质。
酶活实验
苄基-PEG9-醇的体外酶/受体结合试验通常涉及偶联研究而非直接结合测量。伯醇可被活化以与各种功能基团偶联,偶联效率可通过核磁共振波谱、质谱或高效液相色谱等技术进行评估。表面等离子共振 (SPR) 可用于评估含有该连接基的 PROTAC 分子与其靶标的结合。PEG9 间隔基可最大限度地减少空间位阻,从而实现高效偶联并保持偶联分子的生物活性。
细胞实验
体外细胞实验中,苄基-PEG9-醇通常被整合到PROTAC分子中,然后在细胞培养系统中进行评估。细胞用含有该PEG9连接子的PROTAC处理,并通过Western印迹或免疫荧光法检测靶蛋白的降解情况。进行剂量反应实验以确定降解研究的最佳浓度。较长的PEG9链具有优异的水溶性,便于化合物在细胞培养基中的操作和递送。
动物实验
使用苄基-PEG9-醇的体内动物研究是评估包含该PEG9连接基的完整PROTAC分子的一部分。典型的研究方案包括将PROTAC构建体给药于动物模型,然后评估其药代动力学、生物分布或疗效。PEG9间隔基有望通过提高亲水性和减少蛋白质吸附来改善药代动力学特性。给药方案因所评估的具体构建体和所研究的疾病模型而异。
药代性质 (ADME/PK)
苄基-PEG9-醇作为一种连接剂而非治疗药物,目前尚无其完整的药代动力学数据。该化合物的分子式为C25H44O10,分子量为504.61。其IUPAC名称为1-苯基-2,5,8,11,14,17,20,23,26-九氧杂二十八烷-28-醇。该化合物是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于PROTAC的合成。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于苄基-PEG9-醇主要用作研究试剂和合成连接剂,因此其作为单一化合物的毒性特征尚未得到充分表征。该化合物仅供研究使用,未获准用于人体治疗。PEG类化合物通常被认为毒性低且具有良好的生物相容性。建议遵循标准的实验室安全操作规程,包括使用个人防护装备。
参考文献

[1]. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562.

其他信息
Benzyl-PEG9-醇 (CAS 868594-48-3) 的分子式为 C25H44O10,分子量为 504.61。其 IUPAC 名称为 1-苯基-2,5,8,11,14,17,20,23,26-九氧代二十八醇。它是一种具有九个环氧乙烷单元的离散单分散聚乙烯醇衍生物。它是基于 PEG 的 PROTAC 连接子,可用于合成一系列 PROTACs。苄基作为保护基团,可以通过氢化去除。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H44O10
分子量
504.61
精确质量
504.293
CAS号
868594-48-3
PubChem CID
68687189
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
LogP
1.328
tPSA
103.3
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
28
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
396
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C(C=C1)COCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCO
InChi Key
GMSWKGHIOXBMJE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H44O10/c26-6-7-27-8-9-28-10-11-29-12-13-30-14-15-31-16-17-32-18-19-33-20-21-34-22-23-35-24-25-4-2-1-3-5-25/h1-5,26H,6-24H2
化学名
2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-phenylmethoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9817 mL 9.9086 mL 19.8173 mL
5 mM 0.3963 mL 1.9817 mL 3.9635 mL
10 mM 0.1982 mL 0.9909 mL 1.9817 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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