PROTAC PTK6 ligand-1

目录号: V82844 纯度: ≥98%
PROTAC PTK6配体-1是合成/制备BTK激酶抑制剂的中间体。
PROTAC PTK6 ligand-1 CAS号: 2408341-98-8
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
PROTAC PTK6 配体-1 是 BTK 激酶抑制剂合成/制备的中间体。PROTAC PTK6 配体-1 可用于 ARD-61 的合成。
PROTAC PTK6 配体-1(CAS 2408341-98-8)是一种功能化配体中间体,是构建蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)的关键合成砌块。它作为 BTK 激酶抑制剂合成的中间体,并用于 ARD-61 的制备。该化合物的分子量为 540.63,分子式为 C27H32N4O6S。作为 PROTAC 配体中间体,它为双功能 PROTAC 分子提供靶蛋白结合功能。它是药物化学和化学生物学领域中靶向蛋白降解研究的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
The molecular target of PROTAC PTK6 ligand-1 is PTK6 (protein tyrosine kinase 6), also known as breast tumor kinase (BRK). PTK6 is a non-receptor tyrosine kinase that plays important roles in cell proliferation, differentiation, and survival. In the context of PROTAC technology, this compound serves as the target protein recognition element, while the linker and E3 ligase ligand components facilitate the recruitment of the ubiquitin-proteasome system for targeted degradation of PTK6. It is also an intermediate in the synthesis of BTK kinase inhibitors.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,PROTAC PTK6配体-1是PROTAC分子中的关键组分,该分子靶向PTK6进行降解。该化合物具有靶向结合功能,能够选择性识别PTK6。它可用于合成ARD-61,ARD-61是一种PROTAC分子,可诱导靶向蛋白降解。体外实验通常包括将该配体掺入完整的PROTAC分子中,然后评估培养细胞中PTK6的降解情况。
体内研究 (In Vivo)
由于PROTAC PTK6配体-1并非作为治疗药物本身,而是作为PROTAC设计中的合成中间体或配体构建模块,因此未报道其作为独立化合物的体内活性数据。含有该PTK6配体的PROTAC分子(例如ARD-61)的体内疗效取决于特定的E3连接酶配体、连接子以及整个PROTAC构建体的整体药代动力学特性。作为配体构建模块,其主要作用是通过靶标识别促进靶向蛋白降解。
酶活实验
用于评估 PROTAC PTK6 配体-1 的体外实验通常包括结合实验,以评估其与 PTK6 的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或荧光偏振技术可用于测量配体与 PTK6 之间的结合亲和力 (Kd)。此外,还可以进行三元复合物形成实验,以评估含有该配体的 PROTAC 分子同时与 E3 连接酶和靶蛋白结合的能力。使用荧光标记探针的竞争性结合实验也常用于测定配体对 PTK6 结合的抑制浓度 (IC50)。
细胞实验
体外细胞实验中,PROTAC PTK6配体-1的检测通常包括将其整合到PROTAC分子中,然后评估培养细胞中PTK6的降解情况。用含有该PTK6配体的PROTAC处理细胞,并通过Western印迹或免疫荧光法检测PTK6的水平,以评估降解效率。进行剂量反应实验以确定PROTAC构建体的DC50(半数最大降解浓度)。此外,还可以进行细胞活力和增殖实验,以评估PTK6降解的功能后果。
动物实验
使用 PROTAC PTK6 配体-1 进行的体内动物研究是评估包含该 PTK6 配体的完整 PROTAC 分子的一部分。典型的研究方案包括将 PROTAC 构建体(例如 ARD-61)给药于小鼠异种移植模型或疾病相关动物模型,然后通过蛋白质印迹或免疫组织化学方法评估收集的组织中 PTK6 的降解情况。药效学终点包括测量 PTK6 水平、下游信号通路调节以及在疗效研究中评估肿瘤生长抑制情况。给药方案根据特定 PROTAC 构建体的药代动力学特性进行优化。
药代性质 (ADME/PK)
由于PROTAC PTK6配体-1并非治疗药物,而是一种配体构建单元,因此其完整的药代动力学数据有限。该化合物的分子式为C27H32N4O6S,分子量为540.63,通常为固体,在DMSO中的溶解度为100 mg/mL。当PTK6配体被整合到PROTAC分子中时,它会影响整个构建体的理化性质。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PROTAC PTK6 配体-1 作为单一化合物的毒性特征尚未得到充分表征,因为它主要用作研究试剂和合成砌块。该化合物仅供研究使用,未获准用于人体治疗。建议遵循标准的实验室安全操作规程,包括使用个人防护装备和在通风橱内操作。
参考文献

[1]. Pyrrolo-aromatic heterocyclic compound, preparation method therefor, and medical use thereof. Patent WO2020010204.

其他信息
PROTAC PTK6 配体-1 (CAS 2408341-98-8) 的分子式为 C27H32N4O6S,分子量为 540.63。它是一种功能化的配体中间体,作为合成 PROTAC 的关键构建块。它作为 BTK 激酶抑制剂合成的中间体,并用于 ARD-61 的制备。该化合物在 100 mg/mL 的 DMSO 中可溶,需以粉末形式在 -20°C 存储。它属于 PROTAC 配体类别。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H32N4O6S
分子量
540.63
精确质量
540.204
CAS号
2408341-98-8
PubChem CID
156701347
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.6
tPSA
174
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
853
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC1=NOC(=C1)[C@@H](C(C)C)C(=O)N2C[C@@H](C[C@H]2C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C3=CC=C(C=C3)C4=C(N=CS4)C)O
InChi Key
ALLAYPNFQHTUKN-MDAIXWLXSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H32N4O6S/c1-14(2)24(22-9-15(3)30-37-22)27(36)31-12-19(32)10-21(31)26(35)29-20(11-23(33)34)17-5-7-18(8-6-17)25-16(4)28-13-38-25/h5-9,13-14,19-21,24,32H,10-12H2,1-4H3,(H,29,35)(H,33,34)/t19-,20+,21+,24-/m1/s1
化学名
(3S)-3-[[(2S,4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-3-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]propanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~184.97 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8497 mL 9.2485 mL 18.4969 mL
5 mM 0.3699 mL 1.8497 mL 3.6994 mL
10 mM 0.1850 mL 0.9248 mL 1.8497 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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