| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The primary molecular target of Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc is cereblon (CRBN), an E3 ubiquitin ligase substrate receptor. As a ligand for the E3 ubiquitin ligase complex, this compound binds to CRBN and recruits the ubiquitin-proteasome system. In the context of PROTAC technology, the thalidomide moiety serves as the E3 ligase recognition element, while the PEG3 linker provides a spacer for conjugation to a target protein ligand. This bifunctional design enables the targeted degradation of specific proteins by bringing the target protein into proximity with the E3 ligase.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外研究表明,沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc是PROTAC分子中的关键组分。该化合物包含一个基于沙利度胺的cereblon配体,可与E3泛素连接酶结合;以及一个带有Boc保护胺基的PEG3连接子,该胺基可被脱保护并与靶蛋白配体偶联。PEG3间隔基为靶蛋白、PROTAC和E3连接酶之间三元复合物的形成提供了合适的长度和灵活性。该化合物旨在通过泛素-蛋白酶体途径促进细胞系统中靶向蛋白的降解。
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| 体内研究 (In Vivo) |
由于沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc 并非作为治疗药物本身,而是作为合成中间体或连接子组分用于 PROTAC 设计,因此未报道其作为独立化合物的体内活性数据。含有该沙利度胺基配体和 PEG3 连接子的 PROTAC 分子的体内疗效取决于特定的靶蛋白配体以及完整 PROTAC 构建体的整体药代动力学特性。作为连接子缀合物,其主要作用是通过募集 E3 连接酶来促进靶向蛋白降解。
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| 酶活实验 |
体外评估沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc 的方法通常包括结合实验,以评估其与 E3 泛素连接酶底物受体 cereblon (CRBN) 的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或荧光偏振技术可用于测量沙利度胺基配体与 CRBN 之间的结合亲和力 (Kd)。此外,还可以进行三元复合物形成实验,以评估含有该连接子的 PROTAC 分子同时与 E3 连接酶和靶蛋白结合的能力。使用荧光标记探针的竞争性结合实验也常用于测定配体与 CRBN 结合的抑制浓度 (IC50)。
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| 细胞实验 |
体外细胞分析中,沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc 的检测通常包括将其整合到 PROTAC 分子中,然后评估培养细胞中靶蛋白的降解情况。用含有该沙利度胺基配体和 PEG3 连接子的 PROTAC 处理细胞,并通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测靶蛋白水平以评估降解效率。进行剂量反应实验以确定 PROTAC 构建体的 DC50(半数最大降解浓度)。此外,还可以进行细胞活力和增殖实验以评估靶蛋白降解的功能后果。
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| 动物实验 |
利用沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc进行的体内动物研究是评估包含该沙利度胺基配体和PEG3连接子的完整PROTAC分子的一部分。典型的研究方案包括将PROTAC构建体应用于小鼠异种移植模型或疾病相关动物模型,然后通过Western blot或免疫组织化学方法评估收集组织中靶蛋白的降解情况。药效学终点包括靶蛋白水平的测定、下游信号通路调控以及疗效研究中的肿瘤生长抑制情况。给药方案根据特定PROTAC构建体的药代动力学特性进行优化。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
作为一种连接剂缀合物而非治疗药物,沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc 本身的药代动力学数据十分有限。该化合物的分子式为 C26H36N4O9,分子量为 548.59。其 IUPAC 名称为叔丁基(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-1,3-二氧异吲哚啉-4-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸酯。当将其引入 PROTAC 分子中时,沙利度胺基配体和 PEG3 连接剂共同影响了整个构建体的整体理化性质。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc主要用作PROTAC开发的研究试剂和合成中间体,因此其作为单一化合物的毒性特征尚未得到充分表征。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体治疗。已知沙利度胺核心结构具有致畸作用,因此在处理该化合物时应采取适当的安全预防措施。建议遵循标准的实验室安全操作规程,包括使用个人防护装备和在通风橱内操作。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
沙利度胺-NH-PEG3-NH-Boc (CAS 2204246-03-5) 的分子式为 C26H36N4O9,分子量为 548.59。IUPAC 名称为 tert-丁基 N-[2-[2-[2-[2-[[2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-1,3-二氧异吲哚-4-基]氨基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基]氨基甲酸酯。它是一种先进的 E3 连接酶配体-连接子偶联物,旨在用于靶向蛋白降解技术。Boc 保护基团允许在酸性条件下选择性去保护。它属于 E3 连接酶配体-连接子偶联物类别。
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| 分子式 |
C26H36N4O9
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|---|---|
| 分子量 |
548.585447311401
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| 精确质量 |
548.248
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| CAS号 |
2204246-03-5
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| PubChem CID |
131801484
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow ointment
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| LogP |
0.9
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| tPSA |
162
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
16
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| 重原子数目 |
39
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| 分子复杂度/Complexity |
891
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O=C1C(CCC(N1)=O)N1C(C2C=CC=C(C=2C1=O)NCCOCCOCCOCCNC(=O)OC(C)(C)C)=O
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| InChi Key |
ZAQGFFFSCSRSDJ-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C26H36N4O9/c1-26(2,3)39-25(35)28-10-12-37-14-16-38-15-13-36-11-9-27-18-6-4-5-17-21(18)24(34)30(23(17)33)19-7-8-20(31)29-22(19)32/h4-6,19,27H,7-16H2,1-3H3,(H,28,35)(H,29,31,32)
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| 化学名 |
tert-butyl N-[2-[2-[2-[2-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]carbamate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
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| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8229 mL | 9.1143 mL | 18.2285 mL | |
| 5 mM | 0.3646 mL | 1.8229 mL | 3.6457 mL | |
| 10 mM | 0.1823 mL | 0.9114 mL | 1.8229 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。