Propargyl-PEG2-CH2COOH

目录号: V82889 纯度: ≥98%
Propargyl-PEG2-CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC。
Propargyl-PEG2-CH2COOH CAS号: 944561-46-0
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
500mg
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产品描述
丙炔基-PEG2-CH2COOH 是一种基于聚乙二醇 (PEG) 的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备 PROTAC。丙炔基-PEG2-CH2COOH 是一种点击化学试剂。它含有炔基,可以与含有叠氮基的化合物发生 CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
丙炔基-PEG2-CH2COOH 是一种基于聚乙二醇 (PEG) 的 PROTAC 连接剂和点击化学试剂,其包含一个丙炔基(末端炔烃)和一个羧酸(乙酸)基团,二者通过一个由两个单元组成的 PEG 间隔基 (PEG2) 连接。这种异双功能连接剂用于合成靶向蛋白降解的 PROTAC 分子。末端炔烃基团可与含有叠氮基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应 (CuAAc),形成稳定的三唑键。羧酸基团可被 EDC/NHS 活化,与含有伯胺的配体形成酰胺键。PEG2 间隔基在共轭配体之间提供了一个短而亲水的柔性连接,从而降低了空间位阻并提高了水溶性。其分子式为 C9H14O5,分子量为 202.20。该产品标准纯度≥95%,呈固体或无色液体状。为保证长期稳定性,应在氮气保护下于4℃保存。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
PROTAC Linkers.
体外研究 (In Vitro)
作为连接分子,丙炔基-PEG2-CH2COOH本身不具有生物活性;它在PROTAC合成中作为结构连接体,连接靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体。末端炔基是一个点击化学反应位点,可与含叠氮基团的分子发生CuAAc反应,形成稳定的三唑键。该反应具有高度特异性,且可在温和条件下进行。羧酸基团可被EDC和NHS活化,与含伯胺的配体形成酰胺键。正交的官能团(炔基和羧酸)使得该分子能够逐步偶联两种不同的配体。PEG2间隔基提供了一个短而亲水且柔性的连接,有利于形成高效的三元复合物。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该连接子本身具有特定的体内活性;其活性来源于与适当配体偶联后的最终PROTAC分子。完整的PROTAC的体内疗效需在动物模型中进行测定。
酶活实验
不适用;该化合物未在分离酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体,其质量通常通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认,标准纯度≥95%。炔基的特征红外吸收峰位于2100-2260 cm-¹附近。根据取代模式的不同,末端炔烃质子在¹H NMR谱中通常表现为2.4-2.5 ppm附近的三重峰(J ≈ 2.5 Hz)或2.0-3.0 ppm附近的单峰。其IUPAC名称为2-(2-(2-(丙-2-炔-1-氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸。
细胞实验
不适用;该连接子未单独进行细胞实验测试。它用作构建PROTAC的结构单元。典型的合成方法是:在THF/水混合物中,以CuSO4和抗坏血酸钠为催化剂,通过CuAAc与含叠氮基的配体反应。羧酸经EDC和NHS活化后,与含伯胺基的配体反应形成酰胺键。所得PROTAC随后在细胞中测试其靶标降解活性。PEG2间隔臂较短,可能最适合靶向结合位点间距较小的蛋白质的PROTAC。
动物实验
不适用;未对单独的连接子进行动物研究。对于完整的PROTAC偶联物,体内研究将按照机构指南进行。该化合物通常使用含有DMSO、PEG300、Tween-80和生理盐水的载体配制,并通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给药。PEG2间隔基可通过提高水溶性来改善偶联物的药代动力学性质。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量为202.20,分子式为C9H14O5,标准纯度≥95%。其IUPAC名称为2-(2-(2-(丙-2-炔-1-氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸。外观为固体或无色液体。储存条件为:4℃,氮气保护,密封,防潮。可溶于DMSO和其他有机溶剂。产品应避光保存。SMILES代码:C(COCCOCC#C)OCC(O)=O。CAS号:944561-46-0。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用,不得用于人体治疗或临床应用。操作过程中应遵守标准化学品安全预防措施。应小心处理炔烃基团,避免过早反应。本产品应远离氧化剂存放。本产品并非已获批准的药物,也未获准用于临床。PROTAC 是 Arvinas Operations, Inc. 的注册商标,经许可使用。
参考文献
[1]. Guangrong Zheng, et al. Compounds that induce degradation of anti-apoptotic bcl-2 family proteins and the uses thereof. WO2017184995A1.
其他信息
短链PEG2间隔基与末端炔烃和羧酸基团组合,构成了一种用于构建PROTAC的极简连接基。该连接基非常适合需要短而刚性连接以形成最佳三元复合物的靶标-E3连接酶对。末端炔烃基团可与叠氮基功能化的配体进行CuAAc点击化学反应,从而提供了一种通用的偶联策略。短链PEG2间隔基也可作为构建单元,通过迭代点击化学或其他偶联反应构建更长的连接基。该化合物是研究PROTAC设计中构效关系的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H14O5
分子量
202.20
精确质量
202.084
CAS号
944561-46-0
PubChem CID
58281034
外观&性状
Colorless to light yellow liquid(Density:1.158±0.06 g/cm3)
密度
1.158±0.06 g/cm3(Predicted)
沸点
334.9±27.0 °C(Predicted)
闪点
129.8±17.2 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.466
LogP
-0.83
tPSA
65
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
14
分子复杂度/Complexity
193
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C#CCOCCOCCOCC(=O)O
InChi Key
FWONAGPFSKACQC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H14O5/c1-2-3-12-4-5-13-6-7-14-8-9(10)11/h1H,3-8H2,(H,10,11)
化学名
2-[2-(2-prop-2-ynoxyethoxy)ethoxy]acetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.9456 mL 24.7280 mL 49.4560 mL
5 mM 0.9891 mL 4.9456 mL 9.8912 mL
10 mM 0.4946 mL 2.4728 mL 4.9456 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们