Biotin-PEG4-SH

目录号: V82898 纯度: ≥98%
Biotin-PEG4-SH 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Biotin-PEG4-SH CAS号: 2762393-22-4
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
Biotin-PEG4-SH 是一种聚乙二醇 (PEG) 类 PROTAC (蛋白水解靶向嵌合体) 连接剂,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Biotin-PEG4-SH 是一种基于聚乙二醇 (PEG) 的 PROTAC 连接剂,包含一个生物素基团(用于与亲和素或链霉亲和素高亲和力结合)和一个硫醇 (SH) 基团,两者通过一个 4 单元 PEG 间隔基 (PEG4) 连接。这种异双功能连接剂用于 PROTAC 分子的合成,其中硫醇基团可用于通过二硫键形成或硫醇-马来酰亚胺点击化学进行偶联,而生物素基团则可用于使用基于链霉亲和素的检测方法捕获、检测和纯化最终的 PROTAC 或其靶蛋白。PEG4 间隔基赋予其水溶性、柔韧性和降低的空间位阻,从而增强了生物素与链霉亲和素结合的亲和力,并减少了生物系统中的非特异性相互作用。其分子式为 C20H37N3O6S2,分子量为 479.65,标准纯度 ≥95%,呈固体状。为了长期保持稳定性,应将其储存在 -20degC 下,避光保存,并在氮气保护下储存以防止硫醇氧化。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
PROTAC Linkers; Biotin-binding proteins (avidin/streptavidin).
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
作为一种连接分子,Biotin-PEG4-SH 本身不具有生物活性;它用于将生物素标签和硫醇基团引入 PROTAC 分子或其他生物偶联物中。生物素基团与亲和素和链霉亲和素具有极高的亲和力(Kd ~10-¹⁵ M),从而能够在下拉实验、蛋白质印迹、ELISA 和其他基于亲和力的技术中捕获和检测偶联分子。硫醇 (SH) 基团可通过形成二硫键(与其他硫醇)或通过与含马来酰亚胺的分子进行硫醇-马来酰亚胺迈克尔加成反应形成稳定的硫醚键。PEG4 间隔基赋予了分子水溶性和柔韧性,确保生物素基团能够与链霉亲和素结合。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该连接子本身具有特定的体内活性;其活性来源于与适当配体结合后的最终缀合物。
酶活实验
不适用;该化合物未在分离酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体,其质量通常通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认,标准纯度≥95%。生物素-链霉亲和素相互作用可通过比色法或荧光法结合试验(例如,生物素-4-荧光素置换试验)进行确认。硫醇含量可使用 Ellman 试剂 (DTNB) 进行定量。PEG4 间隔基可通过质谱法进行表征。
细胞实验
不适用;该连接子未单独用于细胞实验。它用作构建生物素化PROTAC的结构单元。在典型的合成过程中,巯基与含有马来酰亚胺的PROTAC组分(例如,靶蛋白配体或经马来酰亚胺功能化的E3连接酶配体)在pH 6.5-7.5条件下通过迈克尔加成反应反应。所得生物素化PROTAC随后用于细胞实验。例如,用生物素化PROTAC处理细胞,裂解细胞,并将生物素化物质(包括任何结合的靶蛋白)捕获在链霉亲和素包被的磁珠上,用于蛋白质印迹或质谱分析。
动物实验
不适用;目前尚无单独使用该连接子的动物实验数据。对于完整的生物素化PROTAC,体内实验可能包括向动物体内施用该化合物,然后收集组织、制备裂解液,并进行链霉亲和素下拉实验以评估靶标结合和PROTAC分布。生物素标签能够实现对复杂生物基质的灵敏检测和纯化。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量为479.65,分子式为C20H37N3O6S2,标准纯度≥95%。储存时,应以粉末形式在-20℃下避光保存,并置于氮气保护下,可保存长达3年。溶剂保存时,可在-80℃下保存6个月,或在-20℃下保存1个月(避光,并置于氮气保护下)。该化合物可溶于DMSO(50 mg/mL)和其他有机溶剂。产品应储存在密封容器中,避光防潮。硫醇基团易氧化,应在惰性气氛下操作。CAS号:2762393-22-4。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。操作过程中应遵守标准化学品安全预防措施。巯基易被氧化,应在惰性气氛(例如氮气或氩气)下操作。本产品应远离氧化剂存放。本产品并非已获批准的治疗药物,也未获准用于临床。PROTAC是Arvinas Operations, Inc.的注册商标,经许可使用。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
生物素亲和标签与PEG4间隔臂上的硫醇偶联基团相结合,为PROTAC研究提供了一种多功能工具。硫醇基团能够与马来酰亚胺功能化的配体进行位点特异性偶联,这是将配体连接到连接臂上的常用策略。生物素标签可用于利用链霉亲和素检测方法检测、捕获和纯化所得PROTAC或其蛋白靶标,从而促进对靶标结合、三元复合物形成和细胞分布的研究。PEG4间隔臂提供了一种水溶性、柔性连接臂,确保生物素基团能够与链霉亲和素结合,并减少非特异性相互作用。该连接臂还广泛应用于表面修饰、纳米颗粒功能化、蛋白质标记和亲和力检测。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
479.212
CAS号
2762393-22-4
PubChem CID
162642635
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
133
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
19
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
517
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C1[C@H]2[C@@H]([C@@H](S1)CCCCC(=O)NCCOCCOCCOCCOCCS)NC(=O)N2
InChi Key
NIJSULOOONHHJS-LNLFQRSKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H37N3O6S2/c24-18(4-2-1-3-17-19-16(15-31-17)22-20(25)23-19)21-5-6-26-7-8-27-9-10-28-11-12-29-13-14-30/h16-17,19,30H,1-15H2,(H,21,24)(H2,22,23,25)/t16-,17-,19-/m0/s1
化学名
5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[2-[2-[2-[2-(2-sulfanylethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]pentanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们