| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 50mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
PEGs Alkyl/ether
PROTAC Linkers. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
其中一个配体与E3泛素连接酶结合，另一个配体与靶蛋白结合；这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
作为连接分子，DBCO-PEG8-NHS酯本身不具有生物活性；它在PROTAC合成中作为结构连接体，连接靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体。DBCO基团是一种张力炔烃，可通过SPAAC反应与叠氮基团特异性且快速地反应，无需铜催化剂。这种无铜点击化学反应具有生物正交性和生物相容性，使其成为在细胞或生物样品存在下进行偶联的理想选择。NHS酯基团可在温和条件下通过酰胺键的形成与含伯胺的配体偶联。PEG8间隔基在两个反应基团之间提供长、亲水且柔性的连接，这有利于形成有效的三元复合物。正交的官能团使得可以逐步偶联到两种不同的配体上。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
目前尚未报道该连接子本身具有特定的体内活性；其活性来源于与适当配体偶联后的最终PROTAC分子。完整的PROTAC的体内疗效需在动物模型中进行测定。
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| 酶活实验 |
不适用；该化合物未在分离酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体，其质量通常通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认，标准纯度≥98%。DBCO 基团的特征在于其紫外吸收（约 300 nm）。NHS 酯基的特征在于其在 NMR 光谱中的化学位移以及与伯胺的反应性。其 IUPAC 名称为 (2,5-二氧代吡咯烷-1-基) 1-(11,12-二脱氢二苯并[b,f]氮杂辛-5(6H)-基)-1-氧代-3,6,9,12,15,18,21,24,27-九氧杂-2-氮杂四碳-31,33,35,37,39-戊烯-41-酸酯。
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| 细胞实验 |
不适用；该连接子未单独用于细胞实验。它用作构建PROTAC的结构单元。典型的合成方法是，将NHS酯与含伯胺的配体（例如E3连接酶配体）在室温下于PBS缓冲液（pH 7.4）中反应1-2小时。然后，将DBCO基团与含叠氮基的配体（例如靶蛋白配体）在室温下通过SPAAC无铜点击反应反应1-4小时。最后，在细胞中测试所得PROTAC的靶标降解活性。PEG8间隔基提供了一个长而灵活的连接，对于结合位点之间距离较长的靶标-E3连接酶对而言可能是最佳选择。
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| 动物实验 |
不适用；未对单独的连接子进行动物研究。对于完整的PROTAC偶联物，体内研究将按照机构指南进行。该化合物通常使用含有DMSO、PEG300、Tween-80和生理盐水的载体配制，并通过腹腔注射（IP）或静脉注射（IV）给药。较长的PEG8间隔基可通过提高水溶性和减少聚集来改善偶联物的药代动力学性质。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
该化合物分子量约为 825.90，分子式为 C42H55N3O14，标准纯度 ≥98%。室温下呈固体状。储存时，应以粉末形式于 -20℃ 保存长达 3 年，或以溶剂形式于 -80℃ 保存 6 个月。可溶于 DMSO 和其他有机溶剂。产品应密封存放于阴凉干燥处，避免受潮。DBCO 基团应避光保存，以防止降解。CAS 编号：2553412-88-5。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
本产品仅供研究使用，不得用于人类或兽医用途。操作过程中应遵守标准化学品安全预防措施。DBCO基团具有反应活性，应小心操作，避免与环境中的叠氮化物发生过早反应。NHS酯对水分敏感，应在干燥环境下操作。PROTAC是Arvinas Operations, Inc.的注册商标，经许可使用。本化合物并非已获批准的药物，也未获准用于临床。
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| 参考文献 |
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
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| 其他信息 |
DBCO基团（无铜点击化学）与NHS酯在长PEG8间隔基上的结合，为在生物正交条件下构建PROTAC提供了一个多功能平台。SPAAC的无铜特性避免了铜催化剂可能带来的毒性和副反应，使得该连接子非常适合在敏感生物分子或活细胞存在下进行偶联反应。NHS酯提供了一个多功能的偶联基团，可连接到任何含伯胺的分子上，包括蛋白质上的赖氨酸残基和肽的N端。长PEG8间隔基提供了一个柔性亲水连接子，可以适应靶蛋白结合位点和E3连接酶募集位点之间各种不同的距离。
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| 分子式 |
C42H55N3O14
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|---|---|
| 分子量 |
825.90
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| 精确质量 |
825.368
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| CAS号 |
2553412-88-5
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| PubChem CID |
134159736
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow oil
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| 密度 |
1.29±0.1 g/cm3(Predicted)
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| LogP |
-0.2
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| tPSA |
187
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
14
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| 可旋转键数目(RBC) |
32
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| 重原子数目 |
59
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| 分子复杂度/Complexity |
1320
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1CC(=O)N(C1=O)OC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCC(=O)N2CC3=CC=CC=C3C#CC4=CC=CC=C42
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| InChi Key |
OALUNVCTIRHONS-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C42H55N3O14/c46-38(11-12-39(47)44-33-36-7-2-1-5-34(36)9-10-35-6-3-4-8-37(35)44)43-16-18-52-20-22-54-24-26-56-28-30-58-32-31-57-29-27-55-25-23-53-21-19-51-17-15-42(50)59-45-40(48)13-14-41(45)49/h1-8H,11-33H2,(H,43,46)
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| 化学名 |
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-4-oxobutanoyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2108 mL | 6.0540 mL | 12.1080 mL | |
| 5 mM | 0.2422 mL | 1.2108 mL | 2.4216 mL | |
| 10 mM | 0.1211 mL | 0.6054 mL | 1.2108 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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