| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Cereblon
CRBN (cereblon), an E3 ubiquitin ligase. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
PROTAC 中存在两种不同的配体,分别是 E3 泛素连接酶配体和靶蛋白配体,它们通过连接子连接。具体而言,靶蛋白通过细胞内泛素-蛋白酶体系统被 PROTAC 降解 [1]。
作为一种与cereblon结合的配体-连接子缀合物,泊马度胺4'-PEG5-酸本身不具有内在的生物活性;其功能是募集E3泛素连接酶复合物。末端羧酸通过酰胺键的形成与靶蛋白配体偶联,所用偶联剂为标准偶联剂(例如EDC、HATU)。由此产生的PROTAC可同时结合靶蛋白和cereblon,导致靶蛋白泛素化并随后被蛋白酶体降解。PEG5连接子提供了一个长、亲水且柔性的间隔基团,对于结合位点远离cereblon募集位点的靶蛋白而言,这可能是最佳选择。PEG5连接子显著提高了最终PROTAC的水溶性,而水溶性通常是PROTAC分子面临的挑战。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
目前尚未报道该缀合物本身具有特定的体内活性;其体内降解活性仅在与靶蛋白配体缀合形成完整的PROTAC分子时才能观察到。此类PROTAC的体内疗效通常在靶向疾病的动物模型中进行评估。
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| 酶活实验 |
不适用;该化合物未在分离的酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体,其质量通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认,标准纯度≥95%。其与cereblon的结合亲和力已通过表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 等生物物理方法,作为完整PROTAC构建体的一部分进行验证。PEG5连接基可通过质谱进行表征。其IUPAC名称为3-(2-(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-1,3-二氧异吲哚啉-4-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙酸。
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| 细胞实验 |
不适用;该缀合物未单独进行细胞实验测试,而是用作构建PROTAC的基元。典型的缀合步骤中,末端羧酸用EDC和NHS活化,并与含伯胺的靶蛋白配体反应。所得PROTAC随后在表达靶蛋白的癌细胞中进行Western blotting检测,以确定其降解活性,从而测定DC50(半数最大降解浓度)。预计长PEG5连接子将显著提高最终PROTAC的水溶性,这可能增强细胞摄取和靶标结合。
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| 动物实验 |
不适用;未对单独的配体-连接子偶联物进行动物研究。对于完整的PROTAC的体内研究,将该分子配制在合适的载体中(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45% 生理盐水),并通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给药于动物模型。监测组织中的靶点降解和肿瘤生长抑制情况。较长的PEG5间隔基可能通过提高水溶性和减少聚集来改善偶联物的药代动力学性质,从而可能提高体内疗效。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
该化合物的分子量约为565.58,分子式为C26H35N3O11,标准纯度≥95%。储存时,应将其以固体形式密封于-20℃下,防潮保存,最长可达3年。该化合物可溶于DMSO。产品应储存于惰性气氛下的密封容器中。CAS号:2139348-63-1。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
本产品仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。操作过程中应遵循标准化学品安全预防措施。本产品在推荐的储存条件下稳定。它并非获批的治疗药物,也未获准用于临床。泊马度胺是一种免疫调节药物 (IMiD),临床上用于治疗多发性骨髓瘤;本衍生物仅供研究用途。PROTAC 是 Arvinas Operations, Inc. 的注册商标,经许可使用。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
5单元聚乙二醇(PEG5)连接子提供了一个长、亲水且柔性的间隔臂,对于需要更长结合位点间距离的靶标-E3连接酶对而言,这可能是最佳选择。PEG5连接子还能显著提高最终PROTAC的水溶性,从而解决PROTAC开发中常见的难题。该缀合物是构建具有针对特定靶蛋白优化连接子长度的cereblon募集PROTAC的重要结构单元。末端羧酸基团可通过标准的酰胺偶联反应直接与靶蛋白配体连接。该化合物也称为泊马度胺-PEG5-CO2H,广泛应用于靶向蛋白降解研究。
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| 分子式 |
C26H35N3O11
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|---|---|
| 分子量 |
565.569607973099
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| 精确质量 |
565.227
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| CAS号 |
2139348-63-1
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| PubChem CID |
132020460
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| 外观&性状 |
White to yellow solid-liquid Mixture
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| LogP |
-0.4
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| tPSA |
179
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
12
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| 可旋转键数目(RBC) |
20
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| 重原子数目 |
40
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| 分子复杂度/Complexity |
871
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O=C1C(CCC(N1)=O)N1C(C2C=CC=C(C=2C1=O)NCCOCCOCCOCCOCCOCCC(=O)O)=O
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| InChi Key |
PMCQLKMOQUEEDR-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C26H35N3O11/c30-21-5-4-20(24(33)28-21)29-25(34)18-2-1-3-19(23(18)26(29)35)27-7-9-37-11-13-39-15-17-40-16-14-38-12-10-36-8-6-22(31)32/h1-3,20,27H,4-17H2,(H,31,32)(H,28,30,33)
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| 化学名 |
3-[2-[2-[2-[2-[2-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoic acid
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
H2O :~50 mg/mL (~88.41 mM)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7681 mL | 8.8406 mL | 17.6813 mL | |
| 5 mM | 0.3536 mL | 1.7681 mL | 3.5363 mL | |
| 10 mM | 0.1768 mL | 0.8841 mL | 1.7681 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。