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  5. PROTAC Linkers

Lenalidomide-5-Br

目录号: V82924 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Lenalidomide-5-Br 是一种基于 Lenalidomide 的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体，用于招募 cereblon 蛋白。
Lenalidomide-5-Br CAS号: 1010100-26-1
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
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产品描述
来那度胺-5-Br 是一种基于来那度胺的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体，用于募集 cereblon 蛋白。来那度胺-5-Br 可通过连接子与蛋白质配体连接，形成 PROTAC。
来那度胺-5-Br 是一种基于来那度胺的 cereblon (CRBN) E3 泛素连接酶配体，其异吲哚环的 5 位引入了一个溴原子。该化合物用于 PROTAC 技术，以募集 CRBN 蛋白进行靶向蛋白降解。溴原子提供了一个可进行进一步功能化的位点，例如通过交叉偶联反应（如 Suzuki-Miyaura 偶联、Ullmann 偶联）连接连接子或靶蛋白配体。这使得可以在 5 位合成具有多种连接子的 CRBN 募集 PROTAC，5 位是除戊二酰亚胺氮原子之外的另一个偶联位点。其分子式为 C13H11BrN2O3，分子量约为 323.15。标准纯度≥98%，为固体粉末。为了长期保持稳定性，应密封保存于-20degC，远离潮湿环境。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
CRBN (cereblon), an E3 ubiquitin ligase.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合，另一个配体与靶蛋白结合；这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[2]。
作为一种 cereblon 结合配体，来那度胺-5-Br 本身不具有内在的降解活性；其功能是与 cereblon 结合并募集 E3 泛素连接酶复合物。5 位上的溴原子可用于交叉偶联反应（例如，与硼酸进行 Suzuki-Miyaura 偶联，与胺类进行 Ullmann 偶联），从而直接连接连接子或靶蛋白配体。当通过连接子与靶蛋白配体偶联时，所得的 PROTAC 可以同时结合靶蛋白和 cereblon，导致靶蛋白泛素化并随后被蛋白酶体降解。与戊二酰亚胺氮上的修饰相比，5 位偶联位点可能更好地保持来那度胺核心与 cereblon 的结合亲和力，因为戊二酰亚胺氮上的修饰会干扰结合。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该配体本身具有特定的体内活性；只有当其与靶蛋白配体偶联形成完整的PROTAC分子时，才能观察到其体内降解活性。此类PROTAC的体内疗效通常在靶向疾病的动物模型中进行评估。
酶活实验
不适用；作为配体，其与cereblon的结合亲和力通常采用生物物理方法测定，例如表面等离子体共振（SPR）或等温滴定量热法（ITC），作为最终PROTAC构建体验证的一部分。该化合物用作合成中间体。化合物的纯度通常通过高效液相色谱（HPLC）确认，标准纯度≥98%。溴原子可通过质谱分析中的特征同位素模式和核磁共振（NMR）光谱中的化学位移进行表征。
细胞实验
不适用；该配体未在基于细胞的实验中单独进行评估，而是用作构建塞雷布隆募集PROTAC的结构单元。在典型的功能化步骤中，溴原子通过Suzuki-Miyaura交叉偶联反应，在钯催化剂的作用下与含硼酸的连接基或靶配体反应。然后，通过Western印迹法在表达靶标的癌细胞中检测所得PROTAC的降解活性，以确定DC50（半数最大降解浓度）。5位偶联位点允许构建多种PROTAC结构，而这些结构无法通过戊二酰亚胺氮上的标准酰胺偶联反应实现。
动物实验
不适用；未进行单独使用该配体的动物研究。体内疗效研究将使用由该结构单元合成的完整PROTAC分子进行。PROTAC将配制在合适的载体中（例如，10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45% 生理盐水），并通过腹腔注射（IP）或静脉注射（IV）给药于动物模型。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量约为323.15，分子式为C13H11BrN2O3，标准纯度≥98%。其IUPAC名称为3-(5-溴-1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮。外观为固体粉末。储存时，应密封保存于-20℃，可保存长达3年；或保存于4℃，可保存长达2年。溶于溶剂后，可在-80℃保存6个月；或在-20℃保存1个月。可溶于DMSO。CAS号：1010100-26-1。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用，不可用于人体治疗或临床应用。操作过程中应遵循标准化学品安全预防措施。本产品尚未经过全面的医疗应用验证。它并非获批的治疗药物，也未获准用于临床。来那度胺是一种免疫调节药物（IMiD），临床上用于治疗多发性骨髓瘤和骨髓增生异常综合征；本衍生物仅供研究用途。
参考文献

[1]. Bivalent Ligands for Protein Degradation in Drug Discovery. Comput Struct Biotechnol J. 2019;17:160-176. Published 2019 Jan 25.

[2]. PROTACs: An Emerging Therapeutic Modality in Precision Medicine. Cell Chem Biol. 2020;27(8):998-985.
其他信息
异吲哚环5位上的溴原子为交叉偶联反应提供了一个多功能的连接位点，可通过碳-碳键的形成连接连接子和靶配体。对于PROTAC而言，这种替代偶联位点可能具有优势，因为在戊二酰亚胺氮原子上连接会降低其与cereblon的结合亲和力。5位偶联位点已被用于开发靶向多种蛋白质（包括IRAK4和BET蛋白）的PROTAC。该化合物也称为3-(5-溴-1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮，是开发具有新型连接子连接策略的cereblon募集PROTAC的重要结构单元。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H11BRN2O3
分子量
323.14
精确质量
321.995
CAS号
1010100-26-1
PubChem CID
69049011
外观&性状
Off-white to gray solid powder
密度
1.688±0.06 g/cm3
沸点
587.6±50.0 °C
LogP
0.9
tPSA
66.5
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
440
定义原子立体中心数目
0
SMILES
BrC1C([H])=C([H])C2C(N(C([H])([H])C=2C=1[H])C1([H])C(N([H])C(C([H])([H])C1([H])[H])=O)=O)=O
InChi Key
CMRQAKJTXKOGSF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H11BrN2O3/c14-8-1-2-9-7(5-8)6-16(13(9)19)10-3-4-11(17)15-12(10)18/h1-2,5,10H,3-4,6H2,(H,15,17,18)
化学名
3-(6-bromo-3-oxo-1H-isoindol-2-yl)piperidine-2,6-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~12.5 mg/mL (~38.68 mM )
H2O :< 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0946 mL 15.4732 mL 30.9463 mL
5 mM 0.6189 mL 3.0946 mL 6.1893 mL
10 mM 0.3095 mL 1.5473 mL 3.0946 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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