Thalidomide-PEG4-NH2 hydrochloride

目录号: V83016 纯度: ≥98%
Thalidomide-PEG4-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-接头缀合物,含有基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个接头。
Thalidomide-PEG4-NH2 hydrochloride CAS号: 2387510-82-7
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
沙利度胺-PEG4-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-连接子缀合物,包含基于沙利度胺的 cereblon 配体和 1 个连接子。
沙利度胺-PEG4-NH2 盐酸盐是一种 PEG4 连接的沙利度胺衍生物,带有末端胺(HCl 盐),可作为 cereblon 结合配体用于 PROTAC 合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
Cereblon (CRBN) as a ligand; neo-substrates Ikaros (IKZF1) and Aiolos (IKZF3) for ubiquitination and degradation.
体外研究 (In Vitro)
沙利度胺与cereblon的结合亲和力中等(Kd约为10-20 uM)。PEG4连接基(4个乙二醇单元)提高了水溶性,并提供了一个1.5-2 nm的间隔。末端胺基(以盐酸盐形式存在)使其能够与含羧基的靶向配体偶联。该化合物单独使用时,其诱导Ikaros/Aiolos降解的效力低于泊马度胺衍生物。在PROTACs中,它能募集cereblon来降解新靶点。
体内研究 (In Vivo)
沙利度胺-PEG4-NH2衍生的PROTACs在小鼠异种移植模型中显示出降解多种蛋白质(例如BRD4、CDK6)的体内疗效。PEG4连接基团在溶解性和渗透性之间实现了良好的平衡。该中间体本身由于与cereblon结合而显示出较弱的抗骨髓瘤活性,但主要用作构建模块。目前关于该中间体的具体体内数据有限。
酶活实验
通过时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)评估Cereblon的结合情况。将重组CRBN-DDB1蛋白与生物素标记的来那度胺探针和沙利度胺-PEG4-NH2(0-500 uM)孵育。IC50通常为5-15 uM。由于空间位阻,PEG4链与沙利度胺相比,结合略有降低(2-3倍)。该结合是竞争性的,且可逆。
细胞实验
将细胞(例如 MM.1S 细胞)用沙利度胺-PEG4-NH2(1-100 uM)处理 24-48 小时。通过蛋白质印迹法评估 Ikaros/Aiolos 的降解情况(DC50 约为 10-30 uM)。该化合物本身具有中等的抗增殖活性(IC50 约为 20-50 uM)。在 PROTAC 测试中,使用该缀合物以较低浓度(1-1000 nM)降解靶蛋白。
动物实验
在体内,将含有该结构单元的PROTACs(10-50 mg/kg,静脉注射或腹腔注射)给药于异种移植小鼠。检测肿瘤生长抑制和靶点降解情况。有时单独测试该中间体作为非特异性效应的对照。沙利度胺-PEG4-NH2本身在高剂量(100 mg/kg)下可能引起轻微的肿瘤生长延迟。
药代性质 (ADME/PK)
分子量:约 460 g/mol(游离碱)加 HCl。PEG4 链(分子量约 176)赋予其水溶性 >5 mg/mL。盐酸盐增强了稳定性。末端胺的 pKa 值约为 9.5。该化合物储存于 -20℃。由于沙利度胺戊二酰亚胺环的自发水解,其在血浆中的半衰期较短(t1/2 约 1-2 小时)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
沙利度胺及其衍生物具有致畸性和潜在的神经毒性。啮齿动物急性毒性:沙利度胺的LD50约为200-500 mg/kg。PEG4-NH2衍生物可能具有类似的毒性。操作时务必极其小心:戴手套,避免吸入,并防止污染工作台面。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Structure of the DDB1-CRBN E3 ubiquitin ligase in complex with thalidomide. Nature. 2014 Aug 7;512(7512):49-53. [Content Brief].

其他信息
该化合物是经典的PROTAC结构单元。沙利度胺最初作为镇静剂上市,但因其致畸性而被撤市;后来发现它能与cereblon结合并诱导Ikaros/Aiolos降解,从而解释了其免疫调节活性。PEG4-NH2连接基因其最佳长度而被广泛使用。盐酸盐可改善其操作性。该中间体尚未获得临床批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H28CLN3O8
分子量
485.915325164795
精确质量
485.156
CAS号
2387510-82-7
PubChem CID
146018962
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
147
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
688
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CC(=O)NC(=O)C1N2C(=O)C3=C(C2=O)C(=CC=C3)OCCOCCOCCOCCN.Cl
InChi Key
NDHMOOQETYCWFG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H27N3O8.ClH/c22-6-7-29-8-9-30-10-11-31-12-13-32-16-3-1-2-14-18(16)21(28)24(20(14)27)15-4-5-17(25)23-19(15)26;/h1-3,15H,4-13,22H2,(H,23,25,26);1H
化学名
4-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0580 mL 10.2898 mL 20.5795 mL
5 mM 0.4116 mL 2.0580 mL 4.1159 mL
10 mM 0.2058 mL 1.0290 mL 2.0580 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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