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Thalidomide-4-O-C2-NH2 hydrochloride

目录号: V83021 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Thalidomide 4'-ether-烷基C2-amine HCl 是一种配体（用于E3 连接酶）-连接体缀合物，含有基于Thalidomide 的cereblon 配体和连接体，用于PROTAC 技术。
Thalidomide-4-O-C2-NH2 hydrochloride CAS号: 2341840-99-9
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
沙利度胺 4'-醚-烷基 C2-胺 HCl 是一种配体（用于 E3 连接酶）-连接子缀合物，含有基于沙利度胺的 cereblon 配体和连接子，用于 PROTAC 技术。
沙利度胺-4-O-C2-NH2 盐酸盐是一种沙利度胺衍生物，其中 4 位氧原子与以胺结尾的双碳间隔基相连（HCl 盐），用作 cereblon 结合 PROTAC 构建单元。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
Cereblon (CRBN) as a ligand; neo-substrates Ikaros (IKZF1) and Aiolos (IKZF3).
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合，另一个配体与靶蛋白结合；这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统，靶向并选择性地降解靶蛋白。
沙利度胺与cereblon的结合亲和力中等（Kd约为10-20 uM）。4-O-C2-NH2修饰引入了一个短的亲水性间隔基（2个碳原子加一个氧原子）。末端胺基（以盐酸盐形式）可与含羧基的靶配体偶联。该化合物本身可导致Ikaros/Aiolos轻微降解。较短的C2间隔基使胺基靠近沙利度胺核心，这可能会影响PROTACs中的偶联效率和三元复合物的形成。
酶活实验
Cereblon 的结合通过时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 法测定。将沙利度胺-4-O-C2-NH2 (0-500 uM) 与 CRBN-DDB1 和荧光探针孵育。IC50 通常为 10-30 uM。由于 4 位上的空间位阻，C2-NH2 基团可能略微降低结合亲和力（2-3 倍），但与沙利度胺相比，它仍然可用于 PROTAC 的合成。
细胞实验
将细胞（例如 MM.1S 细胞）单独用该化合物（1-100 uM）处理 24-48 小时。通过蛋白质印迹法评估 Ikaros/Aiolos 的降解情况（DC50 约为 20-50 uM）。该化合物显示出中等的抗增殖活性（IC50 约为 30-60 uM）。对于 PROTACs，在较低浓度（1-1000 nM）下测试该缀合物对目标蛋白的降解作用。
动物实验
在体内，由该结构单元衍生的PROTAC被注射到异种移植小鼠体内（10-50 mg/kg，静脉注射）。有时单独使用中间体作为对照。由于亲水性，较短的C2连接基可能导致最终PROTAC的快速清除。药代动力学参数取决于具体的活性基团。对肿瘤组织进行分析，以检测靶点降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
分子量：约 350 g/mol（游离碱）加上 HCl。C2-NH2 链（分子量约 44）可提高水溶性。盐酸盐稳定。该化合物储存于 -20℃。沙利度胺戊二酰亚胺环在水性缓冲液中水解（pH 7.4，37℃ 时半衰期约为 1-2 小时）。4-O-C2-NH2 基团不能阻止水解。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
沙利度胺衍生物具有致畸性和潜在的神经毒性。C2-NH2修饰并不能降低这种风险。啮齿动物急性毒性：沙利度胺的LD50约为200-500 mg/kg。操作时务必极其小心：戴双层手套，在通风橱内操作，并在专用工作区域进行。本品仅供研究使用，不得用于人体。
参考文献

[1]. Binding of thalidomide to alpha1-acid glycoprotein may be involved in its inhibition of tumor necrosis factor alpha production. Proc Natl Acad Sci U S A. 1996;93(15):7552‐7556.
其他信息
该PROTAC结构单元以沙利度胺为核心，通过4-O-C2-NH2连接基连接。4位是衍生化的优选位点之一，因为它不会完全破坏cereblon的结合。C2间隔基是最短的（乙胺）。这种紧凑的连接基可能适用于那些较长间隔基会阻碍三元复合物形成的靶点。与含有PEG的连接基相比，该结构单元具有更高的溶解度。目前尚未获得临床批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H16CLN3O5
分子量
353.757642745972
精确质量
353.077
CAS号
2341840-99-9
PubChem CID
138991788
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
119
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
549
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CC(=O)NC(=O)C1N2C(=O)C3=C(C2=O)C(=CC=C3)OCCN.Cl
InChi Key
AZQNUQDFOMUSBB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H15N3O5.ClH/c16-6-7-23-10-3-1-2-8-12(10)15(22)18(14(8)21)9-4-5-11(19)17-13(9)20;/h1-3,9H,4-7,16H2,(H,17,19,20);1H
化学名
4-(2-aminoethoxy)-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~125 mg/mL (~353.35 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8268 mL 14.1339 mL 28.2678 mL
5 mM 0.5654 mL 2.8268 mL 5.6536 mL
10 mM 0.2827 mL 1.4134 mL 2.8268 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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