UDP-xylose disodium

别名: UDP-木糖;尿苷二磷酸木糖 (UDP-XYLOSE,CAS 108320-89-4);尿苷二磷酸木糖,钠盐(UDP-XYLOSE,CAS 108320-89-4);尿苷-5'-(二磷酸三氢)P'-Α-D-吡喃木糖酯二钠盐;URIDINE 5'-(二磷酸三氢),P'-Α-D-吡喃木糖酯二钠盐;尿苷二磷酸木糖,钠盐(UDP-XYLOSE,CAS1083);尿苷二磷酸木糖二钠盐
目录号: V83074 纯度: ≥98%
UDP-木糖二钠是从劳伦隐球菌 (N RRL Y-1401) 中提取的天然化合物。
UDP-xylose disodium CAS号: 108320-89-4
产品类别: Terpenoids
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
UDP-木糖二钠是从劳伦氏隐球菌(N RRL Y-1401)中提取的一种天然化合物。UDP-木糖二钠是核苷酸糖代谢中的一种代谢产物。
UDP-木糖(尿苷二磷酸木糖)是一种内源性糖核苷酸,可作为高能糖基供体。它是戊糖木糖的活化形式。在脊椎动物、植物和真菌中,它是木糖基转移酶的必需底物,这些酶负责将木糖残基添加到糖蛋白、蛋白聚糖和多糖上。UDP-木糖由UDP-葡萄糖醛酸经UDP-木糖合酶(UXS)合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary biological targets of UDP-xylose are xylosyltransferases (XYLT1 and XYLT2), which initiate the synthesis of glycosaminoglycan (GAG) chains on proteoglycans. It also targets various other glycosyltransferases involved in the elongation of GAGs (like chondroitin sulfate and heparan sulfate). Beyond enzymes, UDP-xylose is a key regulator of its own synthesis; it acts as a feedback inhibitor of UDP-glucuronic acid decarboxylase (UXS), controlling the flux through the nucleotide sugar pathway.
体外研究 (In Vitro)
体外研究利用UDP-木糖作为底物来测定各种糖基转移酶的活性。例如,在重组系统中,UDP-木糖可通过重组木糖基转移酶掺入受体肽中。它也被用于研究β-1,4-半乳糖基转移酶7 (GalTI) 的底物特异性,该酶可将半乳糖转移至木糖引物上。反应产物(UDP)可通过高效液相色谱法(HPLC)或偶联酶法进行检测。UDP-木糖本身对细胞没有直接的“活性”,但对细胞外基质的合成至关重要。
体内研究 (In Vivo)
在体内,UDP-木糖是细胞外基质形成的关键代谢物。它被用于研究结缔组织疾病中的蛋白聚糖生物合成。通过追踪同位素标记的UDP-木糖(或其前体),研究人员可以测量软骨和皮肤等组织中蛋白聚糖的周转率。UXS或木糖基转移酶缺陷的动物模型表现出严重的骨骼和结缔组织异常,凸显了UDP-木糖在发育过程中的重要作用。
酶活实验
典型的非细胞检测方法是木糖基转移酶 (XYLT) 检测。反应混合物包含 50 mM MES 缓冲液(pH 6.5)、10 mM MnCl2、0.5% Triton X-100、10 mM UDP-D-木糖和合成受体肽(例如,来自蛋白聚糖核心蛋白)。加入酶源(例如,重组 XYLT1)启动反应。在 37°C 孵育 1 小时后终止反应。产物 UDP 可通过高效液相色谱-紫外检测 (262 nm) 或通过检测无机磷酸盐的偶联比色法进行定量。
细胞实验
由于UDP-木糖是一种代谢底物而非细胞毒性药物,因此目前尚无标准的“细胞活力”检测方法。在细胞研究中,通常培养原代软骨细胞或成纤维细胞,并用[3H]-木糖或[14C]-UDP-木糖前体进行标记。通过用十六烷基氯化吡啶(CPC)沉淀细胞裂解液或培养基,并进行闪烁计数,来测定放射性标记物掺入蛋白聚糖的情况。或者,也可以用UDP-木糖类似物处理细胞以抑制糖胺聚糖(GAG)的合成。
动物实验
体内实验通常采用链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠模型来研究糖尿病肾病。在肾皮质中测定UDP-木糖水平。将动物安乐死后,立即将组织置于液氮中冷冻钳制。使用高氯酸提取核苷酸,中和后,采用高效液相色谱法(HPLC)结合强阴离子交换(SAX)柱进行分析。这使得研究人员能够将疾病进展与核苷酸糖池(UDP-木糖、UDP-葡萄糖醛酸)的紊乱联系起来。
药代性质 (ADME/PK)
UDP-木糖二钠具有高度亲水性。其药代动力学通常在其代谢前体的背景下进行研究。作为一种核苷酸糖,它不能被动穿过细胞膜;必须在细胞内合成。由于外源性UDP-木糖会在胃肠道和血液中降解,因此不存在“吸收”或“分布”的药代动力学特征。它是一种完全的细胞内代谢物。细胞内UDP-木糖池的半衰期很短(几分钟到几小时),反映了其高周转率。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
UDP-木糖二钠是一种内源性代谢产物,而非外源性毒素。在生理浓度下,它无毒。毒性并非源于化合物本身,而是源于缺乏利用或合成该化合物的酶(导致结缔组织疾病)。对于实验室操作而言,UDP-木糖二钠盐被认为是无害的,不会造成急性健康风险。应遵循标准良好实验室规范 (GLP);避免吸入干粉和接触眼睛。
参考文献

[1]. ISOLATION OF UDP-D-XYLOSE FROM CRYPTOCOCCUS LAURENTII (NRRL Y-1401). Biochim Biophys Acta. 1964 Aug 19;90:397-9.

[2]. Biosynthesis of UDP-xylose: characterization of membrane-bound AtUxs2. Planta. 2005 Jun;221(4):538-48.

其他信息
UDP-木糖二钠并非药物,而是一种研究用生化试剂。它目前尚无临床试验阶段或获批的治疗适应症。其主要价值在于糖生物学和蛋白聚糖的研究。它是研究硫酸软骨素、硫酸皮肤素和硫酸肝素生物合成的必备工具,也可用于寡糖的酶促合成。二钠盐形式(CAS号:108320-89-4)是其稳定的水溶性形式,常用于研究应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H23N2NAO16P2
分子量
560.273517847061
精确质量
582.023
CAS号
108320-89-4
相关CAS号
UDP-xylose; 3616-06-6
PubChem CID
162394077
外观&性状
White to off-white solid
tPSA
271
氢键供体(HBD)数目
8
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
916
定义原子立体中心数目
8
SMILES
O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@H]2OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)O[C@H]1N1C=CC(=O)NC1=O)O.[NaH]
InChi Key
NEJJEMLBIKJTCC-SMSDBRRYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H22N2O16P2.2Na/c17-5-3-28-13(11(22)8(5)19)31-34(26,27)32-33(24,25)29-4-6-9(20)10(21)12(30-6)16-2-1-7(18)15-14(16)23;;/h1-2,5-6,8-13,17,19-22H,3-4H2,(H,24,25)(H,26,27)(H,15,18,23);;/t5-,6-,8+,9-,10-,11-,12-,13-;;/m1../s1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~100 mg/mL (~172.34 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7849 mL 8.9243 mL 17.8485 mL
5 mM 0.3570 mL 1.7849 mL 3.5697 mL
10 mM 0.1785 mL 0.8924 mL 1.7849 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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