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EDA-DA TFA

目录号: V84035
COA 产品数据 产品说明书 SDS
EDA-DA TFA CAS号: 87156-01-2
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
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020-31522723 sales@invivochem.cn
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产品描述
EDA-DA 是一种 N 端标记的二肽探针，可用于标记细菌肽聚糖 (PG)。EDA-DA 是一种点击化学试剂，含有炔基，可与含有炔基的分子发生铜催化叠氮-炔环加成反应 (CuAAc)。
EDA-DA TFA 是一种 N 端标记的二肽探针，可用于标记细菌肽聚糖 (PG)。它是一种点击化学试剂，含有炔基，可与含有叠氮基的分子发生铜催化叠氮-炔环加成反应 (CuAAc)。其分子量为 298.22，分子式为 C10H13F3N2O5。仅供研究使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
EDA-DA TFA targets bacterial peptidoglycan (PG), a major component of the bacterial cell wall. As a dipeptide probe, it incorporates into the peptidoglycan structure, allowing labeling and visualization of bacterial cell walls. The alkyne group enables click chemistry conjugation with azide-containing fluorophores or other labels. This allows detection of peptidoglycan synthesis and turnover in bacteria.
体外研究 (In Vitro)
EDA-DA TFA 的体外活性可通过其标记细菌肽聚糖的能力得到证实。作为一种含有炔基的点击化学试剂，它能与含叠氮基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应 (CuAAc)。这使得该化合物能够与荧光团或其他标记物偶联用于检测。该化合物可用于研究细菌细胞壁的合成和动态变化。详细的活性数据尚未得到充分报道。
体内研究 (In Vivo)
EDA-DA TFA 的体内活性数据不适用，因为该化合物是一种主要用于体外标记细菌肽聚糖的研究探针。如果与合适的检测方法结合使用，它可能在体内研究细菌感染方面具有应用价值。然而，搜索结果中没有提供详细的体内数据。
酶活实验
EDA-DA TFA 的体外标记实验包括将细菌与探针孵育，探针会掺入肽聚糖中。标记后，固定并透化细胞，然后使用叠氮偶联荧光染料进行点击化学反应。标记的肽聚糖可通过荧光显微镜观察或通过流式细胞术进行定量。标准实验方案包括适当的对照，例如未处理的细菌和竞争实验。
细胞实验
体外细胞检测EDA-DA TFA的方法采用细菌培养物。将细菌与不同浓度的探针处理，然后通过与叠氮-荧光团偶联物进行点击化学反应，利用荧光显微镜评估肽聚糖的标记情况。评估标记效率和特异性。可通过测量生长抑制率来评估对细菌的细胞毒性。标准方案包括适当的阳性对照和阴性对照。
动物实验
现有文献中关于EDA-DA TFA的体内动物研究资料并不丰富。作为一种细菌肽聚糖标记探针，它可用于感染模型中研究细菌细胞壁的体内合成。然而，检索结果并未提供详细的体内实验方案和疗效数据。该化合物仅供研究使用。
药代性质 (ADME/PK)
EDA-DA TFA 的药代动力学性质包括分子量为 298.22，分子式为 C10H13F3N2O5。该化合物为固体，纯度为 95% 以上。由于该化合物仅供研究使用，因此不适用详细的药代动力学参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
关于EDA-DA TFA的毒性信息有限。应遵循研究用化学品的标准安全操作规程。该化合物仅供研究使用，不得用于人体治疗。搜索结果中未提供详细的毒性数据。
参考文献

[1].A new metabolic cell-wall labelling method reveals peptidoglycan in Chlamydia trachomatis. Nature. 2014 Feb 27;506(7489):507-10.
其他信息
EDA-DA TFA是一种N端标记的二肽探针，用于标记细菌肽聚糖。它是一种具有炔基的点击化学试剂，可与含叠氮化合物的分子进行CuAAc反应。其分子量为298.22，化学式为C10H13F3N2O5。用于研究细菌细胞壁合成。仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H13F3N2O5
分子量
298.22
精确质量
298.078
CAS号
87156-01-2
PubChem CID
164885338
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
130
氢键供体(HBD)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
337
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H](CC#C)N.C(=O)(C(F)(F)F)O
InChi Key
BRIXKPONTJDKNO-KGZKBUQUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C8H12N2O3.C2HF3O2/c1-3-4-6(9)7(11)10-5(2)8(12)13;3-2(4,5)1(6)7/h1,5-6H,4,9H2,2H3,(H,10,11)(H,12,13);(H,6,7)/t5-,6-;/m1./s1
化学名
(2R)-2-[[(2R)-2-aminopent-4-ynoyl]amino]propanoic acid;2,2,2-trifluoroacetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~100 mg/mL (~335.32 mM; with sonication)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3532 mL 16.7661 mL 33.5323 mL
5 mM 0.6706 mL 3.3532 mL 6.7065 mL
10 mM 0.3353 mL 1.6766 mL 3.3532 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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电话: 020-31522723 传真: 463611831 邮箱: sales@invivochem.cn
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