DNA relaxation-IN-1

目录号: V84499 纯度: ≥98%
DNA relaxation-IN-1 CAS号: 2190506-29-5
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
DNA松弛抑制剂-IN-1(化合物27)是一种DNA连接酶1(DNA Lig1)抑制剂,它能抑制DNA连接并破坏DNA Lig1的DNA松弛活性。DNA松弛抑制剂-IN-1与拓扑替康联用对结直肠癌细胞具有协同抗增殖作用。
DNA松弛抑制剂-IN-1(CAS号:2190506-29-5)是一种选择性DNA连接酶1(Lig1)抑制剂,Lig1是DNA连接过程中的关键酶。其分子式为C30H27N3O2S,分子量为493.62。DNA松弛抑制剂-IN-1(化合物27)能抑制DNA连接并破坏Lig1的DNA松弛活性。当与拓扑异构酶抑制剂拓扑替康联用时,DNA松弛抑制剂-IN-1对结直肠癌细胞表现出协同抗增殖作用。该化合物用于DNA修复机制和癌症治疗的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA relaxation-IN-1 targets DNA Ligase 1 (Lig1), a member of the ATP-dependent DNA ligase family that plays a critical role in DNA replication and repair. Lig1 is responsible for sealing Okazaki fragments during DNA replication and for joining DNA breaks during base excision repair and nucleotide excision repair. By inhibiting Lig1, DNA relaxation-IN-1 disrupts DNA ligation and the DNA relaxation activity of Lig1. This inhibition leads to the accumulation of DNA breaks and promotes apoptosis in targeted cells. The compound's selectivity for Lig1 makes it a valuable tool for studying the specific role of this enzyme in DNA repair and replication, and for exploring its potential as a therapeutic target in cancer.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,DNA松弛抑制剂IN-1是DNA连接酶1 (Lig1)的选择性抑制剂。它能抑制DNA连接并破坏Lig1的DNA松弛活性。该化合物的活性可通过使用重组Lig1和DNA底物的生化分析进行测定。当与拓扑异构酶抑制剂拓扑替康联用时,DNA松弛抑制剂IN-1对结直肠癌细胞表现出协同抗增殖作用。这种协同作用提示,将Lig1抑制剂与拓扑异构酶抑制剂联用可能是一种有效的癌症治疗策略。该化合物促进靶细胞凋亡的能力进一步支持了其作为抗癌药物的潜力。目前尚未有大量关于其对Lig1抑制的IC50值的报道。
体内研究 (In Vivo)
目前科学文献中尚无DNA松弛抑制剂IN-1的体内活性数据。作为一种DNA连接酶1抑制剂,该化合物在体外已证实具有协同抗增殖作用,因此预期其在体内也具有抗肿瘤活性,尤其是在与拓扑替康联合用药时。然而,目前尚未有关于该化合物的具体动物模型研究、给药方案和定量结果的报道。该化合物对Lig1的选择性及其促进细胞凋亡的能力表明,它可能具有体内应用潜力。需要开展进一步的体内研究,以表征其在癌症动物模型中的疗效、安全性和药代动力学特性。
酶活实验
体外DNA松弛酶活性测定方案通常包括测量其对DNA连接酶1 (Lig1) 活性的抑制作用。标准方案是将重组人Lig1与不同浓度的DNA松弛酶活性测定方案(通常为0.1 nM至10 μM)、DNA底物(例如,缺口或缺口的DNA双链)以及ATP在测定缓冲液(例如,pH 7.5的Tris-HCl缓冲液,含MgCl2、DTT和BSA)中于37°C孵育一定时间(例如,30-60分钟)。DNA连接的程度可通过凝胶电泳、荧光测定或放射性标记DNA的闪烁计数法进行测定。IC50值由浓度-效应曲线确定。DNA松弛活性可通过使用超螺旋DNA底物并通过凝胶电泳监测其向松弛形式的转化来评估。
细胞实验
体外细胞DNA松弛抑制剂IN-1的检测方案通常包括评估其对癌细胞系增殖、DNA修复和凋亡的影响。标准方案是将结直肠癌细胞或其他癌细胞系接种于多孔板中,并用不同浓度的DNA松弛抑制剂IN-1(通常为0.1 nM至10 μM)单独或与拓扑替康联合处理。细胞增殖可通过MTT、CCK-8或克隆形成实验进行检测。细胞凋亡可通过Annexin V染色、caspase活性检测或DNA片段化分析进行评估。DNA损伤和修复可通过γ-H2AX灶的形成或彗星试验进行评估。合适的对照组包括载体处理的细胞和仅用拓扑替康处理的细胞。
动物实验
目前文献中尚未报道DNA松弛剂IN-1的体内动物实验方案。鉴于其与拓扑替康在体外对结直肠癌细胞具有协同作用,潜在的研究可能包括使用结直肠癌小鼠异种移植模型。一种设想的方案是将结直肠癌细胞皮下植入免疫缺陷小鼠体内,待肿瘤生长至一定大小后,单独或联合拓扑替康给予DNA松弛剂IN-1。该化合物可使用标准溶剂配制,例如DMSO:PEG300:Tween 80:生理盐水。治疗通常每日或隔日给药,持续2-4周。终点指标包括肿瘤体积测量、尸检时肿瘤重量、肿瘤组织中细胞凋亡和DNA损伤的评估以及联合用药效果的评价。
药代性质 (ADME/PK)
已发表的研究尚未对DNA松弛剂-IN-1的药代动力学特性进行表征。该化合物的分子量为493.62,分子式为C30H27N3O2S。它在DMSO中的溶解度为100 mg/mL (202.58 mM)。该化合物应储存于-20°C。目前尚未报道具体的药代动力学参数,例如半衰期、Cmax、AUC、生物利用度、分布容积和清除率。该化合物的代谢、蛋白结合和消除途径仍有待进一步研究。需要开展进一步的药代动力学研究以了解其吸收、分布、代谢和排泄情况。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于DNA松弛抑制剂-IN-1仅供研究使用,尚未进行系统的毒性测试,因此其毒理学数据有限。目前尚无针对该化合物的急性毒性(LD50)、亚慢性毒性、遗传毒性或生殖毒性研究报告。作为一种DNA连接酶1抑制剂,其潜在的靶向毒性可能包括对正常细胞DNA复制和修复的影响,这可能导致遗传毒性或骨髓抑制。然而,这些毒性尚未针对DNA松弛抑制剂-IN-1进行专门评估。该化合物不适用于人体。研究人员在处理该化合物时应遵循标准安全预防措施,包括在通风橱中操作、佩戴适当的个人防护装备,并避免吸入、摄入或皮肤接触。
参考文献

[1].Synergy between human DNA ligase I and topoisomerase 1 unveils new therapeutic strategy for the management of colorectal cancer. J Biomol Struct Dyn. 2024 Jan 5:1-16.

其他信息
DNA松弛-IN-1是一种研究级化合物,作为DNA连接酶1(Lig1)的选择性抑制剂。它抑制DNA连接并破坏Lig1的DNA松弛活性。当与拓扑替康结合时,DNA松弛-IN-1对结直肠癌细胞表现出协同的抗增殖效果。该化合物促进靶向细胞的凋亡,并用于DNA修复机制和癌症治疗的研究。它尚未进入临床试验,也未获得任何治疗适应症的批准。其作用机制涉及抑制DNA连接酶1,导致DNA断裂的积累和细胞死亡。该化合物仅供研究目的使用,不用于诊断、治疗或人类应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H27N3O2S
分子量
493.62
精确质量
493.182
CAS号
2190506-29-5
PubChem CID
145957134
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
120
氢键供体(HBD)数目
2
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
959
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(C2=CC=CC=C2N1)C3C4=C(C(=CC(=C4)/C=C/C(=O)C5=CC=CS5)C(C)(C)C)OC(=C3C#N)N
InChi Key
XAAIDHPZKXBLMF-VAWYXSNFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H27N3O2S/c1-17-26(19-8-5-6-9-23(19)33-17)27-20-14-18(11-12-24(34)25-10-7-13-36-25)15-22(30(2,3)4)28(20)35-29(32)21(27)16-31/h5-15,27,33H,32H2,1-4H3/b12-11+
化学名
2-amino-8-tert-butyl-4-(2-methyl-1H-indol-3-yl)-6-[(E)-3-oxo-3-thiophen-2-ylprop-1-enyl]-4H-chromene-3-carbonitrile
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
Typically soluble in DMSO (e.g. 10 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0258 mL 10.1292 mL 20.2585 mL
5 mM 0.4052 mL 2.0258 mL 4.0517 mL
10 mM 0.2026 mL 1.0129 mL 2.0258 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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