| 靶点 |
VEGFR2
VEGFR-2-IN-39 targets vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR-2), a receptor tyrosine kinase that is the primary mediator of VEGF-induced angiogenesis. VEGFR-2 is expressed primarily on endothelial cells and plays a critical role in endothelial cell proliferation, migration, survival, and tube formation. As a PROTAC molecule, VEGFR-2-IN-39 not only inhibits VEGFR-2 activity but also induces its degradation. PROTACs are bifunctional molecules that recruit an E3 ubiquitin ligase to the target protein, leading to ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. By degrading VEGFR-2, VEGFR-2-IN-39 provides a more sustained inhibition compared to traditional kinase inhibitors. The compound exhibits an IC50 of 208.6 nM for VEGFR-2 inhibition, indicating potent activity. Its low toxicity profile further supports its utility in research applications. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
VEGFR-2-IN-39（0-60 μM；0-72 h）能以剂量依赖的方式有效降低 VEGFR-2 的蛋白水平[1]。VEGFR-2-IN-39（10-40 μM；72 h）能延长 HUVEC 细胞周期的 S 期[1]。VEGFR-2-IN-39（0.1-40 μM；72 h）能以剂量依赖的方式诱导 HUVEC 细胞凋亡[1]。体外实验表明，VEGFR-2-IN-39 对 VEGFR-2 具有强效抑制作用，IC50 为 208.6 nM。该化合物能以浓度依赖的方式有效抑制人脐静脉内皮细胞系 EA.hy926 细胞的增殖，IC50 为 38.65 μM。 VEGFR-2-IN-39 在浓度为 10-40 μM 时可延长 HUVEC 细胞周期的 S 期，作用时间为 72 小时；在浓度为 0.1-40 μM 时可诱导 HUVEC 细胞凋亡，作用时间为 72 小时。作为一种 PROTAC 分子，VEGFR-2-IN-39 以浓度依赖的方式抑制 VEGFR-2 的活性。该化合物的双重作用机制——酶抑制和蛋白质降解——可能是其对内皮细胞具有强效抗增殖作用的原因。其低毒性表明该化合物具有良好的治疗窗口，适用于研究应用。
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| 体内研究 (In Vivo) |
目前文献中关于VEGFR-2-IN-39体内活性的报道并不多。然而，作为一种在体外对内皮细胞具有抗增殖和促凋亡作用的VEGFR-2抑制剂，该化合物有望在体内抑制肿瘤血管生成和肿瘤生长。其低毒性表明其具有体内应用潜力。作为一种PROTAC分子，VEGFR-2-IN-39在体内可能比传统激酶抑制剂更具优势，包括持续的靶点降解和潜在的更高疗效。然而，目前尚未报道具体的体内数据，包括所用动物模型、给药方案以及肿瘤生长抑制等定量结果。需要开展进一步的体内研究，以表征该化合物在癌症和血管生成相关疾病动物模型中的疗效、药代动力学和安全性。
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| 酶活实验 |
体外酶或受体结合试验方案通常包括使用生化激酶测定法测量其对VEGFR-2激酶活性的抑制作用。标准方案是将重组VEGFR-2激酶与不同浓度的VEGFR-2-IN-39（通常为0.1 nM至10 μM）、ATP和肽底物在激酶测定缓冲液（例如，pH 7.5的HEPES缓冲液，含MgCl₂、DTT和其他成分）中于30°C孵育一定时间（例如30-60分钟）。终止反应后，使用放射性³³P-ATP掺入法、时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）或发光激酶测定法（例如，ADP-Glo）等方法测量底物磷酸化程度。IC₅₀值由浓度-效应曲线确定。对于 PROTAC 活性评估，除了激酶活性测定外，还采用了测量细胞中 VEGFR-2 蛋白降解的测定（例如，蛋白质印迹法）。
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| 细胞实验 |
Western Blot 分析[1]
细胞类型： HUVECs 测试浓度： 0-60 μM 孵育时间： 0-72 h 实验结果： 在 40 μmol/L 的浓度下，VEGFR-2 水平降低高达 60%，24 小时即可观察到快速降解，48 小时后几乎完全降解。 细胞周期分析[1] 细胞类型： HUVECs 测试浓度： 10-40 μM 孵育时间： 0-72 h 实验结果： 导致 S 期细胞比例显著增加，表明细胞周期进程停止或延迟。细胞周期。相应地，G1期细胞数量显著减少。 细胞凋亡分析[1] 细胞类型：人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 测试浓度：0.1-40 μM 孵育时间：0-72 h 实验结果：导致凋亡细胞百分比显著增加，且呈剂量依赖性。晚期凋亡细胞的百分比增加如下：对照组（未处理）：5.34%；10 μM：6.94%；20 μM：8.32%；30 μM：15.6%；40 μM：48.7%。体外细胞实验方案通常包括评估 VEGFR-2-IN-39 对内皮细胞增殖、细胞周期进程和凋亡的影响。标准的增殖实验方案使用 EA.hy926 细胞（人脐静脉内皮细胞系）或 HUVEC 细胞，接种于 96 孔板中，并用不同浓度的 VEGFR-2-IN-39（通常为 0.1 至 100 μM）处理 72 小时。细胞增殖采用 CCK-8、MTT 或 BrdU 掺入法进行检测。IC50 值由浓度-反应曲线计算得出。细胞周期分析中，细胞用 VEGFR-2-IN-39（10-40 μM；72 小时）处理，固定后用碘化丙啶染色，并通过流式细胞术分析细胞周期分布。细胞凋亡检测中，细胞用 0.1-40 μM VEGFR-2-IN-39 处理 72 小时，用 Annexin V-FITC 和碘化丙啶染色，进行流式细胞术分析。合适的对照包括载体处理的细胞和阳性对照，例如已知的 VEGFR-2 抑制剂。 |
| 动物实验 |
目前文献中关于VEGFR-2-IN-39的体内动物实验方案报道较少。基于其作为VEGFR-2抑制剂和PROTAC分子的作用机制，潜在的研究方案包括将该化合物应用于荷瘤小鼠，以评估其抗肿瘤和抗血管生成作用。一种设想的方案是将肿瘤细胞（例如，异种移植模型）皮下植入免疫缺陷小鼠体内，待肿瘤生长至一定大小后，通过灌胃或腹腔注射给予VEGFR-2-IN-39，剂量根据初步的药代动力学和耐受性研究确定。治疗通常每日或隔日给药，持续2-4周。研究终点包括肿瘤体积测量、尸检时肿瘤重量、肿瘤血管密度评估（例如，CD31染色）、通过Western blot检测肿瘤组织中VEGFR-2的降解情况以及肿瘤切片中细胞凋亡的评估。适当的对照组应包括载体处理组和使用标准 VEGFR-2 抑制剂处理组。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
已发表的研究中，VEGFR-2-IN-39 的药代动力学特性尚未得到充分表征。该化合物分子量高达 1000.23，其较大的分子量和多个功能基团（PROTAC 结构）可能会限制其口服生物利用度和细胞渗透性。然而，作为一种 PROTAC 化合物，该化合物旨在发挥细胞内活性，其亲脂性可能有助于其细胞摄取。该化合物毒性较低，提示其可能具有良好的安全性。然而，目前尚未报道其具体的药代动力学参数，例如半衰期、Cmax、AUC、生物利用度、分布容积和清除率。该化合物的蛋白结合、代谢和排泄途径仍未明确。需要开展进一步的药代动力学研究，以了解其吸收、分布、代谢和排泄情况。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
VEGFR-2-IN-39 的毒理学数据表明该化合物毒性较低。然而，尚未有全面的毒理学研究报告。目前尚无急性毒性（LD50）、亚慢性毒性、遗传毒性或生殖毒性数据。作为一种 VEGFR-2 抑制剂，其潜在的靶向毒性可能包括对正常血管生成的影响，例如伤口愈合受损、高血压和心血管效应，这些都是已知的 VEGFR 抑制剂类效应。然而，这些效应尚未针对 VEGFR-2-IN-39 进行专门评估。该化合物仅供研究使用，不得用于人体。研究人员在处理该化合物时应遵循标准安全预防措施，包括在通风橱中操作、佩戴适当的个人防护装备，并避免吸入、摄入或皮肤接触。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
VEGFR-2-IN-39是一种研究级化合物，作为VEGFR-2的强效抑制剂，IC50为208.6 nM。它是一种PROTAC分子，诱导VEGFR-2的靶向降解。该化合物抑制EA.hy926细胞的增殖（IC50 = 38.65 μM），延长HUVEC细胞周期的S期，并诱导HUVEC细胞凋亡。它表现出低毒性，适合用于血管生成和血管生物学的研究。VEGFR-2-IN-39尚未进入临床试验，也未获得任何治疗适应症的批准。其作用机制涉及抑制VEGFR-2激酶活性和通过泛素-蛋白酶体途径降解受体蛋白。该化合物仅供研究用途，不用于诊断、治疗或人类应用。应在2-8°C下保存。
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| 分子式 |
C55H66FN9O6S
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|---|---|
| 分子量 |
1000.23
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| 精确质量 |
999.484
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| CAS号 |
2353417-86-2
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| PubChem CID |
141744224
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| tPSA |
242
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| 氢键供体(HBD)数目 |
6
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| 氢键受体(HBA)数目 |
11
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| 可旋转键数目(RBC) |
21
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| 重原子数目 |
72
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| 分子复杂度/Complexity |
1780
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
CC1=CC(=C(C=C1)F)NC(=O)NC2=CC=C(C=C2)C3=C4C(=CC=C3)N(N=C4N)C(=O)CCCCCCCCCCC(=O)N[C@H](C(=O)N5C[C@@H](C[C@H]5C(=O)NCC6=CC=C(C=C6)C7=C(N=CS7)C)O)C(C)(C)C
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| InChi Key |
YZGNCBAFOZBYKS-SHPBXJAASA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C55H66FN9O6S/c1-34-19-28-42(56)43(29-34)61-54(71)60-39-26-24-37(25-27-39)41-15-14-16-44-48(41)51(57)63-65(44)47(68)18-13-11-9-7-6-8-10-12-17-46(67)62-50(55(3,4)5)53(70)64-32-40(66)30-45(64)52(69)58-31-36-20-22-38(23-21-36)49-35(2)59-33-72-49/h14-16,19-29,33,40,45,50,66H,6-13,17-18,30-32H2,1-5H3,(H2,57,63)(H,58,69)(H,62,67)(H2,60,61,71)/t40-,45+,50-/m1/s1
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| 化学名 |
(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[12-[3-amino-4-[4-[(2-fluoro-5-methylphenyl)carbamoylamino]phenyl]indazol-1-yl]-12-oxododecanoyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO :~200 mg/mL (~199.95 mM; with sonication)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 0.9998 mL | 4.9989 mL | 9.9977 mL | |
| 5 mM | 0.2000 mL | 0.9998 mL | 1.9995 mL | |
| 10 mM | 0.1000 mL | 0.4999 mL | 0.9998 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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