| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 1mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
sBADA targets bacterial peptidoglycan, the major structural component of the bacterial cell wall. Peptidoglycan is a mesh-like polymer composed of alternating N-acetylglucosamine (NAG) and N-acetylmuramic acid (NAM) residues cross-linked by short peptide chains. It provides structural integrity and shape to bacterial cells and is a critical target for antibiotics such as penicillin and vancomycin. sBADA is a fluorescent D-amino acid that is incorporated into the peptidoglycan of live bacteria through the action of transpeptidases and other enzymes involved in cell wall synthesis. By labeling peptidoglycan, sBADA enables visualization of bacterial cell wall synthesis and dynamics in real time. The sulfonated modification enhances the compound's hydrophilicity and thermostability compared to the parent compound BADA, improving its performance in aqueous biological environments.
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
sBADA 是一种用于活细菌中肽聚糖原位标记的荧光探针。它是一种绿色荧光染料,激发/发射波长约为 490/510 nm。该化合物的荧光特性使其能够通过荧光显微镜观察细菌细胞壁,从而使研究人员能够实时研究肽聚糖的合成、动态变化以及细菌形态。sBADA 尤其适用于研究细菌细胞分裂,因为将荧光 D-氨基酸掺入新生肽聚糖中可以标记细胞壁合成活跃的位点。磺化形式的 BADA 具有更高的亲水性和热稳定性,从而改善了其在水性生物环境中的性能。49,000 M⁻¹cm⁻¹ 的消光系数表明其具有强荧光,可实现灵敏的检测。
|
| 体内研究 (In Vivo) |
sBADA的体内活性不适用于治疗或药理活性,因为该化合物是一种荧光探针而非药物。其“体内”应用指的是在活细菌中标记肽聚糖。sBADA可用于活细菌培养,并能整合到生长细菌的肽聚糖中,从而实现对细胞壁动态的实时成像。它已被用于标记多种细菌(包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌)的肽聚糖。磺化形式具有更高的亲水性和热稳定性,使其适用于复杂的生物环境。该化合物的绿色荧光使其易于用标准荧光显微镜设备进行检测。然而,sBADA在动物模型中没有药理活性,也不用作治疗药物。
|
| 酶活实验 |
体外酶或受体结合分析方案不直接适用于sBADA,因为它是一种荧光探针,而非酶抑制剂或受体配体。然而,其应用方案涉及对细菌细胞中的肽聚糖进行标记。典型的方案包括:制备处于指数生长期的细菌培养物,向培养物中加入浓度通常为10至500 μM的sBADA,并在适宜的生长温度下孵育一定时间(例如5至60分钟)。标记后,洗涤细菌以去除过量的探针,并制备样品用于荧光显微镜或流式细胞术分析。对于显微镜分析,将细菌固定或直接制成载玻片,并使用配备合适滤光片组(激发波长~490 nm,发射波长~510 nm)的荧光显微镜进行成像。该探针也可用于脉冲追踪实验,以研究肽聚糖的周转和动态变化。合适的对照包括未标记的细菌和用母体化合物BADA标记的细菌,以作比较。
|
| 细胞实验 |
sBADA 的体外细胞检测方案包括用荧光探针标记活细菌,以研究肽聚糖的动态变化。标准方案包括将细菌(例如大肠杆菌、枯草芽孢杆菌或其他菌种)在液体培养基中培养至对数生长期中期(OD600 约为 0.4-0.6)。向培养物中加入浓度为 10 至 500 μM 的 sBADA,并在 37°C(或适宜的生长温度)下孵育 5-60 分钟。标记后,通过离心收集细菌,用 PBS 或培养基洗涤以去除过量的探针,然后重悬于合适的缓冲液中。显微镜观察时,取少量标记细菌置于载玻片上,盖上盖玻片,使用配备 490 nm 激发滤光片和 510 nm 发射滤光片的荧光显微镜进行成像。在流式细胞术中,使用配备 488 nm 激光器和相应发射滤光片的流式细胞仪分析标记的细菌。该探针也可用于脉冲追踪实验,在该实验中,将标记的细菌洗涤后在不含探针的培养基中孵育,以追踪肽聚糖的周转。
|
| 动物实验 |
由于sBADA是一种用于标记细菌的荧光探针,而非用于动物研究的药物,因此体内动物实验方案不适用于该化合物。然而,sBADA可能用于离体或原位标记感染组织或感染动物模型中的细菌。此类应用的设想方案包括局部给药(例如,注射到感染组织中)或将其应用于离体组织样本,然后通过荧光显微镜观察细菌。sBADA的磺化修饰增强了其亲水性,这可能提高其在复杂生物环境(例如组织)中的性能。然而,目前尚未有大量关于sBADA在动物模型中体内或离体应用的具体方案报道。该化合物并非用于治疗用途,不应出于药理目的全身性地给动物给药。
|
| 药代性质 (ADME/PK) |
由于sBADA是一种用于标记细菌而非治疗药物的荧光探针,因此其药代动力学性质不适用于药物研发。然而,该化合物的理化性质与其作为探针的应用密切相关。sBADA是磺化BODIPY-FL衍生物,与母体化合物BADA相比,具有更高的亲水性和热稳定性。它在DMSO中的溶解度可达10 mM,并呈现强烈的绿色荧光,激发/发射波长约为490/510 nm。为保证长期稳定性,该化合物应储存在-20°C。磺化修饰提高了其水溶性,这有利于其在水性生物环境中的应用。然而,诸如半衰期、分布容积、清除率和生物利用度等具体的药代动力学参数与其作为研究探针的应用无关。
|
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于sBADA仅供研究使用,尚未进行系统的毒性测试,因此其毒理学数据有限。目前尚无针对该化合物的急性毒性(LD50)、亚慢性毒性、遗传毒性或生殖毒性研究报告。与所有荧光染料一样,潜在危害可能包括皮肤和眼睛刺激,因此在处理该化合物时应采取适当的安全预防措施。该化合物不适用于人体,应按照标准实验室安全操作规程进行操作,包括佩戴适当的个人防护装备、在通风橱内操作,并避免吸入、摄入或皮肤接触。研究人员应查阅材料安全数据表(MSDS)以获取具体的安全信息和操作建议。建议将该化合物储存在-20°C的低温环境中。
|
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
sBADA是一种研究级荧光探针,用于标记活细菌细胞壁中的肽聚糖。它是一种绿色磺化BODIPY-FL 3-氨基-D-丙氨酸(sBADA)或荧光D-氨基酸(FFDA)。该化合物的激发/发射波长约为490/510 nm,消光系数为49,000 M-1cm-1。磺化修饰提供了比母体化合物BADA更高的亲水性和热稳定性。sBADA用于微生物学研究,以研究细菌细胞壁合成、肽聚糖动态和细菌形态。它尚未进入临床试验,也未获得任何治疗适应症的批准。其作用机制涉及通过转肽酶和其他细胞壁合成酶的作用,融入细菌肽聚糖中,从而实现活细胞壁合成的可视化。该化合物仅供研究用途,不用于诊断、治疗或人类应用。
|
| 精确质量 |
458.124
|
|---|---|
| CAS号 |
2376838-11-6
|
| PubChem CID |
138991774
|
| 外观&性状 |
Solid powder
|
| tPSA |
163
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
4
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
10
|
| 可旋转键数目(RBC) |
7
|
| 重原子数目 |
31
|
| 分子复杂度/Complexity |
1010
|
| 定义原子立体中心数目 |
1
|
| SMILES |
[B-]1(N2C(=CC(=C2C=C3[N+]1=C(C(=C3)S(=O)(=O)O)CCC(=O)NC[C@H](C(=O)O)N)C)C)(F)F
|
| InChi Key |
OLMGTLBVHKBMSH-GFCCVEGCSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C17H21BF2N4O6S/c1-9-5-10(2)23-14(9)6-11-7-15(31(28,29)30)13(24(11)18(23,19)20)3-4-16(25)22-8-12(21)17(26)27/h5-7,12H,3-4,8,21H2,1-2H3,(H,22,25)(H,26,27)(H,28,29,30)/t12-/m1/s1
|
| 化学名 |
(2R)-2-amino-3-[3-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-5-sulfo-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-4-yl)propanoylamino]propanoic acid
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
Typically soluble in DMSO (e.g. 10 mM)
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。