QP5038

别名: QP5038; QP 5038; QP-5038; 3031429-88-3; orb3133289; SCHEMBL29195008; GTPL13401;
目录号: V85705 纯度: ≥98%
QP5038 是一种 QPCTL 抑制剂
QP5038 CAS号: 3031429-88-3
产品类别: Beta Amyloid
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
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产品描述
QP5038 是一种 QPCTL 抑制剂,IC50 为 3.8 nM。QP5038 具有抗肿瘤功效。QP5038 是一种基于苯甲腈结构的高效小分子抑制剂,靶向谷氨酰胺酰肽环转移酶样蛋白(QPCTL)。该药通过对 SEN177 进行基于结构的优化而获得。QPCTL 催化 CD47 上焦谷氨酸(pGlu)的形成,这对于 CD47 与 SIRPα 的结合及其“别吃我”信号功能至关重要。抑制 QPCTL 可增强巨噬细胞介导的肿瘤细胞吞噬作用。QP5038 对 QPCTL 的 IC50 为 3.8 ± 0.7 nM,对 QPCT 具有相当的抑制活性。它能减少 CD47 焦谷氨酸化,阻断 CD47/SIRPα 相互作用,在体外和体内促进巨噬细胞介导的癌细胞吞噬,并与抗 PD-1 抗体联用具有协同抗肿瘤效果。[1]
生物活性&实验参考方法
靶点
QPCTL (glutaminyl-peptide cyclotransferase-like protein) – IC50 = 3.8 ± 0.7 nM. [1]
QPCT (glutaminyl-peptide cyclotransferase) – comparable inhibition to QPCTL (exact IC50 not provided in main text; supplementary Fig. S3 shows dose-response curve). [1]
体外研究 (In Vitro)
QP5038 在 HEK293T 细胞中抑制 CD47 焦谷氨酸化(pGlu-CD47),IC50 为 3.3 ± 0.5 nM(通过剂量依赖性抑制实验测定)。[1]
QP5038 在 HEK293T 细胞中以剂量依赖性方式减弱 CD47 与 SIRPα 的结合,IC50 为 8.5 ± 4.9 nM,效力优于 PQ912 和 SEN177。[1]
在 HEK293T 和 Raji 细胞中,QP5038(100 nM)对 CD47 焦谷氨酸化的抑制效果优于 SEN177 和 PQ912,且不改变细胞表面 CD47 的总水平。[1]
QP5038 显著减弱多种癌细胞系中的 CD47 焦谷氨酸化,包括 B16F10、HCT116、SKOV3、Huh7、T24、MCF-6、SU-DHL-8、H929 和 H1299。[1]
在体外吞噬实验中,QP5038(10 μM,处理48小时)显著增强巨噬细胞对抗 TRP1 抗体 TA99 处理的 B16F10 细胞的吞噬,以及对利妥昔单抗处理的 Raji 细胞的吞噬。QP5038 的吞噬效率远优于 SEN177 和 PQ912。[1]
QP5038 不显著损害 Raji 或 B16F10 细胞的活力(补充图 S5)。[1]
QP5038 不降低骨髓来源巨噬细胞(BMDM)的活力,也不减弱其对凋亡 Jurkat 细胞的吞噬能力(补充图 S8)。[1]
在衰老模型中,QP5038 预处理可阻断衰老细胞对巨噬细胞介导的凋亡细胞胞葬作用的抑制(补充图 S7)。[1]
体内研究 (In Vivo)
在 B16F10 同种移植小鼠肿瘤模型(C57BL/6 小鼠,皮下注射 1×10⁶ 个 B16F10 细胞)中,QP5038(25 mg/kg,腹腔注射,每日一次)与抗 PD-1 抗体(80 μg/只,腹腔注射,从第12天开始每周一次)联合治疗,与各单药治疗组及 SEN177 治疗组相比,显著抑制了肿瘤生长和肿瘤重量,且对小鼠体重无影响。[1]
在另一个 B16F10 模型(5×10⁶ 个细胞)中,QP5038(25 mg/kg,腹腔注射,从第6天起每日一次)联合抗 PD-1 抗体显示出优于 SEN177 联合抗 PD-1 的抗肿瘤疗效。[1]
使用抗 CD3 抗体耗竭小鼠 T 细胞后,QP5038 对抗 PD-1 抗体介导的肿瘤抑制的增强作用被阻断,表明 QP5038 的抗肿瘤作用是通过激活免疫反应实现的。[1]
酶活实验
将 QPCTL 或 QPCT 蛋白(7 ng/μL,12.5 μL)和不同浓度的待测化合物(2.5 μL)加入 384 孔板中,置于冰上。反应体系在 37°C、100 rpm 摇动下孵育 10 分钟。然后加入 10 μL 荧光底物 H-Gln-AMC(500 μM),在 37°C、100 rpm 下孵育 20 分钟。最后加入 25 μL PGPEP I(焦谷氨酰氨基肽酶 I,5.74 ng/μL),在 37°C、100 rpm 下孵育 30 分钟。在激发波长 380 nm/发射波长 460 nm 处测量荧光。使用 GraphPad Prism 8.0 计算 IC50 值。QP5038 对 QPCTL 的 IC50 为 3.8 ± 0.7 nM。[1]
PGPEP I 蛋白从转化了含人 PGPEP I 的 pET28a 载体的 E. coli BL21(DE3) 细胞中纯化。细胞用 1 mM IPTG 在 20°C 诱导 48 小时,通过高压匀浆裂解,经 Ni-NTA 亲和层析和尺寸排阻层析纯化。[1]
QPCTL 蛋白使用含人 QPCTL cDNA 的 pGEX-4T-2 载体在 E. coli BL21(DE3) 细胞中表达。细胞用 1 mM IPTG 在 20°C 诱导 8-10 小时,通过超声破碎裂解,使用 GST 亲和珠纯化。[1]
细胞实验
HEK293T、B16F10、HCT116、SKOV3、Huh7、T24、MCF-6、SU-DHL-8、H929、Raji、H1299 和 Jurkat 细胞在含 10% FBS、青霉素(100 U/mL)和链霉素(100 μg/mL)的 DMEM 或 RPMI 1640 培养基中,于 37°C、5% CO2 条件下培养。[1]
CD47 焦谷氨酸化实验:用指定浓度的 QP5038(如 100 nM 或用于 IC50 测定的剂量梯度)处理细胞。通过流式细胞术使用特异性抗体检测 pGlu-CD47 水平和总 CD47 表面水平。[1]
SIRPα 结合实验:细胞与 PE 标记的重组人或小鼠 SIRPα 蛋白在冰上避光孵育 1 小时,然后通过流式细胞术分析。QP5038 在 HEK293T 细胞中以剂量依赖性方式降低 SIRPα 结合,IC50 为 8.5 ± 4.9 nM。[1]
吞噬实验:癌细胞用 5 μM CFSE 在 37°C 染色 10 分钟。巨噬细胞(BMDM)以 1×10⁵ 个细胞/孔铺于 48 孔板。靶细胞与巨噬细胞在 37°C 共培养 4 小时。巨噬细胞用 APC 标记的抗 F4/80 抗体标记,进行流式细胞术分析。吞噬率(%)= [CFSE⁺F4/80⁺ 细胞数 / 总 CFSE⁺ 细胞数] × 100%。QP5038(10 μM,癌细胞预处理 48 小时)显著增强了与 TA99 或利妥昔单抗联合时的吞噬作用。[1]
胞葬实验:衰老 B16F10 细胞通过 10 μM 顺铂诱导 4-7 天,并用 β-半乳糖苷酶染色确认。凋亡 Jurkat 细胞通过 5 μM 喜树碱诱导 4 小时。BMDM 与衰老细胞共培养 16 小时,然后加入 CFSE 标记的凋亡 Jurkat 细胞(巨噬细胞:Jurkat = 1:2)孵育 60 分钟。胞葬率计算为 F4/80⁺ 细胞中 CFSE⁺F4/80⁺ 细胞的百分比。QP5038 预处理阻断了衰老细胞对胞葬作用的抑制。[1]
细胞活力实验:Raji 细胞(5000 个/孔)、B16F10 细胞(3000 个/孔)或 BMDM(10000 个/孔)铺于 96 孔板,使用 CCK-8 试剂盒按说明书检测细胞活力。QP5038 不显著损害细胞活力。[1]
动物实验
B16F10 同种移植肿瘤模型(首次):雄性 C57BL/6 小鼠在第 0 天皮下接种 1×10⁶ 个 B16F10 细胞(溶于 100 μL DMEM)。抗 PD-1 抗体(克隆 RMP1-14)或小鼠 IgG2a 同型对照从肿瘤接种后第 12 天开始腹腔注射,剂量为 80 μg/只,每周一次。QP5038 以 25 mg/kg 每日一次腹腔注射。每日测量肿瘤,24 天后处死小鼠。肿瘤体积 =(长 × 宽²)× 0.5。[1]
与 SEN177 比较实验:雄性 C57BL/6 小鼠在第 0 天皮下接种 5×10⁶ 个 B16F10 细胞(溶于 100 μL DMEM)。抗 PD-1 抗体或同型对照从第 6 天开始腹腔注射,剂量为 80 μg/只,每周一次。QP5038 或 SEN177 从第 6 天开始以 25 mg/kg 每日一次腹腔注射。每三天测量肿瘤,第 15 天处死小鼠。收集小鼠器官和血液用于血常规、血清生化和组织学评估。[1]
T 细胞耗竭实验:6-8 周龄雄性 C57BL/6 小鼠在右 flank 皮下接种 B16F10 细胞(8.5×10⁵ 个/100 μL)。抗 CD3 抗体(200 μg/只)或同型对照从肿瘤接种前一天(第 -1 天)开始每 4 天注射一次。当肿瘤体积达到约 50 mm³ 时,小鼠接受腹腔注射抗 PD-1 抗体(80 μg/只,每周一次)和 QP5038(25 mg/kg,每日一次)或溶剂对照。每周测量两次体重和肿瘤体积。通过流式细胞术使用 PE 标记的抗小鼠 CD3 抗体确认 T 细胞耗竭。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
小鼠体内毒性评估显示,QP5038(25 mg/kg,每日一次,持续 15 天)未引起血常规异常(WBC、RBC、PLT、LYM、MON、NEU)或器官损伤(肝、肾、脾、心),经苏木精-伊红(HE)染色评估。血生化指标(肌酐、ALT、AST、BUN)与溶剂对照组相比无显著差异。[1]
QP5038 在体外不显著损害 Raji 细胞、B16F10 细胞或骨髓来源巨噬细胞(BMDM)的活力。[1]
QP5038 不减弱巨噬细胞对凋亡细胞的吞噬能力。[1]
参考文献

[1].Development of a potent benzonitrile-based inhibitor of glutaminyl-peptide cyclotransferase-like protein (QPCTL) with antitumor efficacy. Signal Transduct Target Ther. 2023 Dec 15;8(1):454.

其他信息
QP5038 是一种基于苯甲腈结构的 QPCTL 抑制剂,通过对 SEN177 进行基于结构的优化而开发。苯甲腈核心中的腈基在结合模型中与 Glu325 残基形成氢键。QP5038 抑制 CD47 焦谷氨酸化,阻断 CD47/SIRPα 相互作用,促进巨噬细胞介导的癌细胞吞噬。[1]
QP5038 联合抗 PD-1 抗体的抗肿瘤作用依赖于 T 细胞,因为使用抗 CD3 抗体耗竭 T 细胞会阻断其增强的肿瘤抑制作用。[1]
QP5038 还能阻断衰老细胞对巨噬细胞介导的凋亡细胞胞葬作用的抑制。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H20FN5
分子量
361.42
精确质量
361.170273
CAS号
3031429-88-3
PubChem CID
169494342
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
LogP
3.1
tPSA
57.7 Ų
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
540
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN1C=NC=C1C2CCN(CC2)C3=C(C=CC=C3C4=CN=C(C=C4)F)C#N
InChi Key
IUBVPNGSCDYBJU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H20FN5/c1-26-14-24-13-19(26)15-7-9-27(10-8-15)21-16(11-23)3-2-4-18(21)17-5-6-20(22)25-12-17/h2-6,12-15H,7-10H2,1H3
化学名
3-(6-fluoro-3-pyridinyl)-2-[4-(3-methylimidazol-4-yl)piperidin-1-yl]benzonitrile
别名
QP5038; QP 5038; QP-5038; 3031429-88-3; orb3133289; SCHEMBL29195008; GTPL13401;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:~100 mg/mL (276.7 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7669 mL 13.8343 mL 27.6686 mL
5 mM 0.5534 mL 2.7669 mL 5.5337 mL
10 mM 0.2767 mL 1.3834 mL 2.7669 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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