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Azide-A-DSBSO crosslinker

别名: 叠氮-A-DSBSO CROSSLINKER,
目录号: V85744 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Azide-A-DSBSO crosslinker CAS号: 1704097-02-8
产品类别: Others 14
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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020-31522723 sales@invivochem.cn
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

COA
MSDS
NMR
产品说明书
产品描述
Azide-A-DSBSO交联剂是一种可被质谱(MS)裂解、可透过膜、具有同双功能、经叠氮标记且可被酸裂解的交联肽。Azide-A-DSBSO交联剂可用于通过交联质谱(XL-MS)研究蛋白质-蛋白质相互作用。
Azide-A-DSBSO交联剂（CAS号：1704097-02-8）是一种可被质谱(MS)裂解、可透过膜、具有同双功能、经叠氮标记且可被酸裂解的交联肽。它含有一个叠氮基团，可促进点击化学反应，从而实现其他分子或生物分子的选择性连接。该交联剂通过与赖氨酸残基的NHS酯反应交联蛋白质。它可用于通过交联质谱(XL-MS)研究蛋白质动力学、相互作用和复合物形成。
生物活性&实验参考方法
靶点
Not applicable (chemical crosslinker; no specific drug target). Azide-A-DSBSO crosslinker is a chemical tool used for studying protein-protein interactions and protein complex structures. It does not target a specific biological receptor or enzyme; rather, it covalently crosslinks proteins that are in close proximity, enabling structural and interaction studies by mass spectrometry.
体外研究 (In Vitro)
叠氮-A-DSBSO交联剂是一种化学交联剂，本身不具有直接的生物活性。它通过NHS酯基团与蛋白质上的赖氨酸残基反应，在相互作用的蛋白质之间形成共价交联。叠氮基团可用于点击化学反应，从而进行进一步的功能化修饰。其酸裂解和质谱裂解的特性有助于通过质谱分析鉴定交联肽段。
体内研究 (In Vivo)
叠氮-A-DSBSO交联剂不适用于体内药理学研究；它是一种用于结构生物学和蛋白质组学的化学工具。它在药物发现、蛋白质组学和靶向治疗方面具有潜在的应用价值。它可用于研究细胞和组织中的蛋白质动力学、相互作用和复合物形成。
酶活实验
不适用于生物测定。叠氮-A-DSBSO交联剂用于化学交联质谱（XL-MS）工作流程。将蛋白质或蛋白质复合物与交联剂孵育，然后通过质谱分析交联产物。其质谱可裂解特性可用于鉴定交联肽段并绘制蛋白质相互作用界面。
细胞实验
叠氮-A-DSBSO交联剂具有膜渗透性，可用于基于细胞的交联实验。用该交联剂处理细胞后，交联剂进入细胞并通过NHS酯-赖氨酸反应交联细胞内蛋白质。然后提取交联的蛋白质，用蛋白酶消化，并通过质谱分析鉴定蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质复合物。
动物实验
叠氮-A-DSBSO交联剂通常不用于动物实验。它是一种化学工具，常用于结构生物学和蛋白质组学研究。如果用于体内实验，则需将其施用于组织或生物体，但由于在完整生物体内进行交联的复杂性，这并非标准做法。
药代性质 (ADME/PK)
叠氮-A-DSBSO交联剂是一种不具有药理学和药代动力学特性的化学试剂。它可溶于合适的有机溶剂，并可用于水性缓冲液中进行交联反应。通常以粉末形式储存于-20°C。该化合物在推荐的储存条件下稳定。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
叠氮-A-DSBSO交联剂是一种化学试剂，应按照标准实验室安全操作规程进行操作。它不可用于体内给药。处理该化合物时应使用适当的个人防护装备（PPE）。目前尚无毒性数据；请遵循标准化学品安全预防措施。
参考文献

[1].Fast and Highly Efficient Affinity Enrichment of Azide-A-DSBSO Cross-Linked Peptides. J Proteome Res. 2020 May 1;19(5):2071-2079.
其他信息
叠氮-A-DSBSO交联剂是一种用于通过交联质谱（XL-MS）研究蛋白质-蛋白质相互作用的研究级化学交联剂。CAS: 1704097-02-8。它是一种可通过质谱切割的、膜可渗透的、同功能的、叠氮标记的、酸切割的交联肽。它通过与赖氨酸残基的NHS酯反应交联蛋白质。仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H33N5O12S2
分子量
647.675123929977
精确质量
647.156
CAS号
1704097-02-8
PubChem CID
122221677
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-2.3
tPSA
233
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
18
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
1130
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1(OCC(CO1)(CS(=O)CCC(=O)ON2C(=O)CCC2=O)CS(=O)CCC(=O)ON3C(=O)CCC3=O)CCCN=[N+]=[N-]
InChi Key
AKLJWXIVLPURNY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H33N5O12S2/c1-23(9-2-10-26-27-25)38-13-24(14-39-23,15-42(36)11-7-21(34)40-28-17(30)3-4-18(28)31)16-43(37)12-8-22(35)41-29-19(32)5-6-20(29)33/h2-16H2,1H3
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[[2-(3-azidopropyl)-5-[[3-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-3-oxopropyl]sulfinylmethyl]-2-methyl-1,3-dioxan-5-yl]methylsulfinyl]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~154.40 mM; with sonication)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5440 mL 7.7199 mL 15.4397 mL
5 mM 0.3088 mL 1.5440 mL 3.0879 mL
10 mM 0.1544 mL 0.7720 mL 1.5440 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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电话: 020-31522723 传真: 463611831 邮箱: sales@invivochem.cn
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