| 靶点 |
SMARCA2 (also known as BRM), a core ATPase subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex. SMD-3040 is a PROTAC that simultaneously binds to SMARCA2 and an E3 ubiquitin ligase, leading to ubiquitination and proteasomal degradation of SMARCA2. This degradation disrupts the SWI/SNF complex, which is essential for chromatin remodeling and gene expression. SMARCA2 is a synthetic lethal target in cancers with loss of the related SMARCA4 protein, making SMD-3040 a potential therapeutic strategy for such tumors.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外实验表明,SMD-3040甲酸盐能有效降解SMARCA2蛋白。在细胞实验中,其DC50为12 nM,表明在极低浓度下即可达到半数最大降解率(Dmax),最大降解率高达91%。它对SMARCA2的选择性降解优于其他SWI/SNF组分。这种降解作用可抑制肿瘤细胞增殖。在依赖SMARCA2生存的癌细胞系中,它表现出强大的抗增殖活性。它不影响SMARCA2的旁系同源物SMARCA4。
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| 体内研究 (In Vivo) |
体内实验表明,SMD-3040甲酸盐具有显著的抗肿瘤活性。在小鼠异种移植模型中,给予SMD-3040可显著抑制肿瘤生长。该化合物的疗效归因于肿瘤组织中SMARCA2的降解,这已通过对收获的肿瘤进行Western blot分析得到证实。它展现出良好的体内特性和强效活性。然而,现有文献中并未详细描述具体的给药方案、给药途径和毒性特征。
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| 酶活实验 |
体外酶/受体结合试验并非表征SMD-3040等PROTAC的主要方法。细胞靶标结合和降解试验才是常用的方法。然而,在无细胞体系中,可以使用表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)测定化合物与SMARCA2和E3连接酶的结合亲和力。这些试验可以验证PROTAC活性所需的二元相互作用。将化合物与重组SMARCA2蛋白或E3连接酶孵育,并测定其结合动力学。
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| 细胞实验 |
在癌细胞系中进行了SMD-3040的体外细胞实验。将细胞用不同浓度的SMD-3040处理一定时间(例如4-24小时)。通过Western blot检测SMARCA2蛋白水平,以确定DC50和Dmax。在更长的处理时间(例如72-120小时)后,使用CellTiter-Glo或MTT法评估细胞增殖。通过检测其他蛋白(包括SMARCA4)的水平来验证选择性。通过caspase激活或Annexin V染色来检测细胞凋亡。这些实验确定了该化合物的效力和选择性。
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| 动物实验 |
在小鼠异种移植模型中开展了SMD-3040的体内动物实验。将对SMARCA2降解敏感的癌细胞系植入免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤达到一定大小后,通过腹腔注射或静脉注射给予小鼠不同剂量的SMD-3040。定期监测肿瘤体积和体重。研究结束时,收集肿瘤组织进行Western blot分析,以确认SMARCA2的降解情况。疗效通过与载体对照组相比的肿瘤生长抑制率来衡量。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
现有文献中未详细描述SMD-3040甲酸盐的药代动力学特性。作为一种PROTAC类药物,它是一种大分子(分子量989.2 g/mol),其特性可能影响口服生物利用度。在动物研究中,它通常采用肠外给药。其溶解度、半衰期、清除率和分布容积尚不清楚。甲酸盐形式用于提高溶解度和稳定性。出于药物开发的目的,需要进行药代动力学研究以表征其吸收、分布、代谢和排泄情况。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
现有文献中未提供SMD-3040甲酸盐的毒理学数据详情。该化合物为研究用化合物,不适用于人体。目前尚无LD50值或重复剂量毒性研究报告。也未进行标准安全药理学研究。与所有研究用化学品一样,操作时应采取适当的安全预防措施。其具体的毒理学特征尚未确定。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
SMD-3040甲酸盐是一种强效且选择性的SMARCA2 PROTAC降解剂,DC50为12 nM,Dmax为91%。它表现出强大的体内抗肿瘤活性。其分子式为C53H68N10O7S,分子量为989.2 g/mol。它是涉及表观遗传调控和合成致死性的癌症研究的有前景的候选物。仅供研究使用。
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| 分子式 |
C53H68N10O7S
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| 分子量 |
989.23
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO :≥ 100 mg/mL (~101.09 mM)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.0109 mL | 5.0544 mL | 10.1089 mL | |
| 5 mM | 0.2022 mL | 1.0109 mL | 2.0218 mL | |
| 10 mM | 0.1011 mL | 0.5054 mL | 1.0109 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。