2-epi-Cucurbitacin B

别名: 2-Epicucurbitacin B; 2-epi-Cucurbitacin B; 59015-72-4; orb2564227;
目录号: V86180 纯度: ≥98%
2-表-葫芦素 B 是从 Ecballium elaterium L. XVI 中提取的天然产物。
2-epi-Cucurbitacin B CAS号: 59015-72-4
产品类别: Terpenoids
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
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产品描述
2-表-葫芦素 B 是从 Ecballium elaterium L. XVI 中提取的天然产物。2-epi-葫芦素B(CAS号:59015-72-4)是一种葫芦烷型三萜类化合物,属于葫芦素家族。该化合物的分子式为C32H46O8,分子量为558.7,是葫芦素B的立体异构体,其特征为C-2位的表异构构型。它是一种天然产物,来源于喷瓜(Ecballium elaterium L.)。该化合物的预测logP为2.6,拓扑极性表面积(TPSA)为138.0 Ų,有3个氢键供体和8个氢键受体。分子复杂度较高(1210),包含9个确定的立体中心和1个确定的键立体中心。根据ESOL分类,该化合物预测为"中度可溶"。
生物活性&实验参考方法
靶点
The precise molecular target of 2-epi-cucurbitacin B has not been definitively identified in the available literature. As a stereoisomer of cucurbitacin B, which is known to target the JAK/STAT3 signaling pathway and the actin cytoskeleton, 2-epi-cucurbitacin B may share similar mechanisms. Cucurbitacin B is well-characterized as an inhibitor of JAK2 and STAT3 phosphorylation, as well as a disruptor of actin polymerization via the RhoA/ROCK pathway. However, the stereochemical variation at the C-2 position may alter target binding affinity and selectivity compared to cucurbitacin B. Further target identification studies are needed for this specific compound.
体外研究 (In Vitro)
该化合物已从喷瓜中分离鉴定,但在可获取的文献中尚未报道详细的生物活性测定。相关的葫芦素类化合物,包括葫芦素B及其立体异构体,通常对多株人癌细胞系表现出强效的细胞毒性。鉴于2-epi-葫芦素B是葫芦素B的立体异构体,它可能保留显著的抗增殖活性,但需要直接实验证实。需要进一步研究以确定该化合物对癌细胞系的具体效力和选择性。
体内研究 (In Vivo)
相关的葫芦素类化合物已在动物模型中显示出体内抗肿瘤活性,提示2-epi-葫芦素B可能具有体内药效潜力,但仍需直接研究加以证实。
酶活实验
对于相关的葫芦素化合物,标准实验通常涉及使用Western blot分析等技术评估JAK/STAT3信号通路的抑制情况,检测JAK2和STAT3蛋白的磷酸化水平。对于靶点结合研究,可采用Cellular Thermal Shift Assay(CETSA)等方法确认与假定蛋白靶点的直接结合。此外,使用生物信息学工具进行分子对接模拟可以在实验验证之前预测与靶蛋白的结合亲和力。
细胞实验
相关化合物的典型方案如下:(1)在适当培养基如含10%胎牛血清的RPMI-1640或DMEM中培养人癌细胞系(如A-549肺癌、HCT-15结肠癌或SK-OV-3卵巢癌细胞);(2)以5,000-10,000细胞/孔的密度将细胞接种于96孔板中;(3)贴壁过夜;(4)用不同浓度的2-epi-葫芦素B(通常为0.1-100 µM)处理48-72小时;(5)使用MTT或SRB比色法评估细胞活力;(6)使用酶标仪测量吸光度,通过回归分析计算IC50值。
动物实验
对于相关的葫芦素类化合物,标准体内方案通常涉及在啮齿动物模型(如小鼠或大鼠)中通过腹腔注射或口服灌胃给药。对于2-epi-葫芦素B等低水溶性化合物(logP ~2.6,中度溶解),推荐的制剂策略可包括使用DMSO:PEG300:Tween 80:生理盐水(10:40:5:45)用于注射,或使用0.5% CMC-Na混悬液用于口服给药。剂量通常基于相关化合物的初步毒性研究和药代动力学特征确定。
药代性质 (ADME/PK)
于其理化性质,该化合物的分子量为558.7,预测logP为2.6(中度亲脂性),拓扑极性表面积(TPSA)为138.0 Ų,有3个氢键供体和8个氢键受体。分子复杂度较高(1210),可能对口服吸收构成挑战。符合Lipinski五规则(True),表明该化合物具有类药特性,但违反Ghose规则(False),提示可能存在吸收或通透性限制。根据ESOL预测,该化合物被分类为"中度可溶"。GI吸收预测为False,表明口服生物利用度可能较低。用于体内制剂时,建议使用DMSO、PEG300、Tween 80或环糊精等增溶剂。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
根据计算预测,该化合物违反Brenk规则(True),这可能表明存在与结构警报或反应性官能团相关的潜在毒性问题。Pfizer 3/75规则和GSK 4/400规则均被违反(False),表明可能存在可开发性问题。葫芦素类化合物在低浓度下即表现出显著的细胞毒性,这既是其抗肿瘤活性的基础,也引起了对潜在脱靶毒性的担忧。需要强调的是,该化合物仅供研究使用,未被批准用于人体治疗。根据TargetMol的产品信息,所有产品仅用于科学研究或药证申报,不能用于人体。
参考文献

[1].The Constituents of Ecballium elaterium L. XVI. Stereochemical Problems in the Cucurbitacins1, 2. The Journal of Organic Chemistry, 1963, 28(7): 1790-1795.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H46O8
分子量
558.702850818634
精确质量
558.319268
CAS号
59015-72-4
PubChem CID
101596930
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.23±0.1 g/cm3(Predicted)
沸点
229-231 °C
tPSA
138
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
1210
定义原子立体中心数目
9
SMILES
CC(OC(C=CC(C(C1C2(C(C3C(C(C2)=O)(C)C2CC(C(C(C2=CC3)(C)C)=O)O)(C)CC1O)C)(O)C)=O)(C)C)=O
InChi Key
IXQKXEUSCPEQRD-PBMNGLKCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H46O8/c1-17(33)40-27(2,3)13-12-23(36)32(9,39)25-21(35)15-29(6)22-11-10-18-19(14-20(34)26(38)28(18,4)5)31(22,8)24(37)16-30(25,29)7/h10,12-13,19-22,25,34-35,39H,11,14-16H2,1-9H3/b13-12+/t19-,20-,21-,22+,25+,29+,30-,31+,32+/m1/s1
化学名
[(E,6R)-6-[(2R,8S,9R,10R,13R,14S,16R,17R)-2,16-dihydroxy-4,4,9,13,14-pentamethyl-3,11-dioxo-2,7,8,10,12,15,16,17-octahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]-6-hydroxy-2-methyl-5-oxohept-3-en-2-yl] acetate
别名
2-Epicucurbitacin B; 2-epi-Cucurbitacin B; 59015-72-4; orb2564227;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
Typically soluble in DMSO (e.g. 10 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7899 mL 8.9493 mL 17.8987 mL
5 mM 0.3580 mL 1.7899 mL 3.5797 mL
10 mM 0.1790 mL 0.8949 mL 1.7899 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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