PARL-IN-1 TFA

目录号: V88567 纯度: ≥98%
PARL-IN-1 TFA 是一种有效的 PARL 抑制剂,IC50 为 28 nM。
PARL-IN-1 TFA 产品类别: Mitophagy
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PARL-IN-1 TFA 是一种强效的 PARL 抑制剂,IC50 为 28 nM。PARL-IN-1 TFA 抑制 PARL 并导致 PINK1/Parkin 通路的强烈激活。PARL-IN-1 TFA 促进 PINK1/Parkin 依赖的线粒体自噬。
PARL-IN-1 TFA 是一种强效的早老素相关菱形蛋白 (PARL) 抑制剂,PARL 是一种线粒体菱形蛋白酶。它是一种小分子,IC50 值为 28 nM。PARL-IN-1 TFA 通过抑制 PARL 发挥作用,从而显著激活 PINK1/Parkin 通路并促进 PINK1/Parkin 依赖性线粒体自噬。它被用于帕金森病等神经退行性疾病的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 28 nM (PARL)[1]
PARL (presenilin‑associated rhomboid‑like protein), a mitochondrial inner membrane rhomboid protease. PARL is involved in the processing of PINK1, a key regulator of mitophagy. PARL-IN-1 inhibits PARL, leading to the stabilization of PINK1 on the outer mitochondrial membrane and activation of the PINK1/Parkin pathway.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞酶活性测定中,PARL-IN-1 TFA 抑制 PARL 活性,IC50 为 28 nM。这种抑制作用导致 PINK1 在线粒体外膜上积累,随后募集 Parkin,Parkin 泛素化线粒体蛋白并标记受损线粒体以进行自噬清除(线粒体自噬)。
体内研究 (In Vivo)
在体内,PARL-IN-1 TFA可用于研究线粒体自噬在帕金森病细胞和动物模型中的作用。它通过激活PINK1/Parkin通路,促进受损线粒体的清除,这是一种对抗神经退行性变的保护机制。PARL-IN-1 TFA在疾病模型中的体内疗效是目前的研究热点。
酶活实验
一种评估PARL抑制作用的通用无细胞方案:采用荧光法测定蛋白酶活性。将重组PARL(或含PARL的线粒体膜组分)与荧光肽底物(例如,对应于PINK1切割位点的肽)在含有不同浓度PARL-IN-1 TFA(0.1-1000 nM)的缓冲液中于37℃孵育30-60分钟。终止反应后,测量荧光强度(由肽的切割引起)。根据抑制曲线计算IC50值。
细胞实验
PARL-IN-1 TFA 的通用细胞实验方案:将 HEK293T 或 SH-SY5Y 神经母细胞瘤细胞接种于 6 孔板中。用浓度分别为 0.1、1、5、10、25 和 50 uM 的 PARL-IN-1 TFA 处理细胞 24 小时。通过免疫荧光显微镜检测 LC3B(自噬体标记物)与线粒体标记物(例如 Tom20)的共定位来评估线粒体自噬。线粒体分离后,通过蛋白质印迹法检测 PINK1 和 Parkin 向线粒体的募集水平。在存在或不存在溶酶体抑制剂(例如氯喹)的情况下,通过蛋白质印迹法检测线粒体蛋白(例如 Tom20、COX1)的降解情况。
动物实验
PARL-IN-1 TFA 的通用动物实验方案:采用帕金森病小鼠模型(例如,MPTP 处理的小鼠或 PINK1/Parkin 基因敲除小鼠)。雄性 C57BL/6 小鼠接受 MPTP 处理(20 mg/kg,每隔 2 小时给药一次,共 4 次),以诱导多巴胺能神经元变性。将 PARL-IN-1 TFA 配制成合适的载体,并在 MPTP 给药前后连续 7 天,每天腹腔注射 5、15 和 30 mg/kg 的剂量。处死小鼠,解剖纹状体。通过蛋白质印迹法和免疫组织化学法检测酪氨酸羟化酶 (TH) 水平,以评估多巴胺能神经元的存活情况。通过蛋白质印迹法检测线粒体自噬标志物(PINK1、Parkin、LC3B)。进行行为测试(杆测试、转棒测试)以评估运动功能。
药代性质 (ADME/PK)
PARL-IN-1 TFA 的通用药代动力学方案:雄性 Sprague-Dawley 大鼠分别经腹腔注射 (IP) (10 mg/kg) 和静脉注射 (IV) (2 mg/kg) 给予 PARL-IN-1 TFA。分别于 0.083、0.25、0.5、1、2、4、8、12 和 24 小时采集血样。采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 定量分析血浆药物浓度。计算药代动力学参数(Cmax、Tmax、AUC、t1/2、清除率、分布容积和腹腔注射生物利用度)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PARL-IN-1 TFA 的一般毒性试验方案:在 ICR 小鼠中进行为期 14 天的重复给药腹腔注射毒性试验。PARL-IN-1 TFA 的给药剂量分别为 5、15 和 40 mg/kg/天。试验参数包括临床症状、体重、食物消耗量、血液学指标(全血细胞计数)、血清生化指标(ALT、AST、BUN、肌酐)以及主要器官(肝脏、肾脏、脾脏、心脏、肺脏、脑)的组织病理学检查。由于线粒体自噬在脑和肝脏中发挥重要作用,因此特别关注这两个器官。
参考文献

[1]. Poláchová E, et, al. Chemical Blockage of the Mitochondrial Rhomboid Protease PARL by Novel Ketoamide Inhibitors Reveals Its Role in PINK1/Parkin-Dependent Mitophagy. J Med Chem. 2023 Jan 12;66(1):251-265.

其他信息
PARL-IN-1 TFA 是 PARL-IN-1 的三氟乙酸盐形式。游离碱的分子量和分子式未提供。使用三氟乙酸盐是为了提高溶解度。PARL 是一种位于线粒体内膜的菱形丝氨酸蛋白酶。其天然底物是 PINK1。PARL 可切割 PINK1,导致其被蛋白酶体降解,从而防止 PINK1 在受损线粒体上积累。抑制 PARL 可稳定 PINK1,促进线粒体自噬。PARL-IN-1 TFA 是研究线粒体自噬及其在帕金森病中作用的重要研究工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C41H57F3N6O9
分子量
834.92
外观&性状
Solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1977 mL 5.9886 mL 11.9772 mL
5 mM 0.2395 mL 1.1977 mL 2.3954 mL
10 mM 0.1198 mL 0.5989 mL 1.1977 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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