2'-Deoxy-2'-fluoroarabinoadenosine

别名: 9-(2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃基)腺嘌呤;(2R,3R,4S,5R)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-4-氟-2-(羟甲基)四氢呋喃-3-醇
目录号: V88714
2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷是一种具有抗人类免疫缺陷病毒 (HIV) 活性的核苷类似物。
2'-Deoxy-2'-fluoroarabinoadenosine CAS号: 20227-41-2
产品类别: HIV
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷是一种核苷类似物,具有抗人类免疫缺陷病毒(HIV)的活性。
2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷(2'-氟-2'-脱氧阿拉伯腺苷)是一种靶向DNA合成的核苷类似物。阿拉伯糖2'位上的氟原子赋予其抗酶降解的能力,并改变了该化合物与DNA聚合酶的相互作用。它具有显著的抗癌活性,并已被用于人类免疫缺陷病毒(HIV)研究,作为潜在的抗病毒药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA polymerases (enzymes involved in DNA replication and repair). The compound acts as a nucleoside analog, incorporating into DNA and terminating chain elongation.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞实验中,2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷是细胞激酶的底物,可将其转化为活性三磷酸形式。该三磷酸随后作为DNA聚合酶(包括HIV逆转录酶)的链终止剂。现有数据中未提供抑制HIV-1逆转录酶的特异性IC₅0值。
体内研究 (In Vivo)
体外实验表明,2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷可通过诱导DNA复制过程中的链终止来抑制多种癌细胞系的增殖,从而导致细胞周期阻滞和凋亡。此外,它还具有抗HIV病毒活性,因为它能被逆转录酶掺入病毒DNA中,导致链提前终止。
酶活实验
一种评估核苷类似物活性的通用无细胞方案:将化合物与含有胸苷激酶或其他核苷激酶的细胞裂解液孵育,以测定其磷酸化为单磷酸形式的程度。对于DNA聚合酶抑制,合成5'-三磷酸衍生物,并使用DNA引物/模板、三磷酸和纯化的DNA聚合酶(例如,HIV-1逆转录酶或人DNA聚合酶α)进行引物延伸实验。通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)分析反应产物,以确定链终止程度。计算IC₅0值。
细胞实验
评估抗HIV活性的通用细胞实验方案:将HIV-1感染的MT-2细胞(或其他易感细胞系)培养于96孔板中。用2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷(0.01 nM至100 uM)系列稀释液处理细胞5-7天。收集上清液,并通过ELISA检测HIV-1 p24抗原水平,以确定抗病毒EC₅0值。使用MTT法在未感染细胞中评估细胞毒性,计算CC₅0值。计算选择性指数(SI = CC₅0/EC₅0)。
动物实验
评估抗癌活性的一般动物实验方案:将人源肿瘤异种移植瘤(例如,A549肺癌细胞或HCT116结肠癌细胞)皮下植入裸鼠体内。当肿瘤体积达到约150 mm³时,将小鼠随机分组(每组n=8)。腹腔注射(IP)2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷,剂量分别为10、30和100 mg/kg,每日一次,持续14-21天。每周测量两次肿瘤体积。实验结束时,收集肿瘤组织进行组织学分析和细胞凋亡评估(TUNEL法)。对于HIV研究,该化合物在HIV-1感染的Hu-PBMC-SCID小鼠模型中进行评估。
药代性质 (ADME/PK)
2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷的一般药代动力学方案:雄性Sprague-Dawley大鼠分别经口灌胃(PO,10 mg/kg)和静脉注射(IV,2 mg/kg)给药。分别于0.083、0.25、0.5、1、2、4、8、12和24小时采集血样。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)定量血浆药物浓度。计算药代动力学参数(Cmax、Tmax、AUC、t½、清除率、分布容积和口服生物利用度)。作为一种核苷类似物,该化合物预计分布迅速,主要经肾脏排泄清除。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷的一般毒性试验方案:在大鼠中进行为期28天的重复给药静脉毒性研究,剂量分别为5、15和50 mg/kg/天。评估指标包括临床症状、体重、食物消耗量、血液学指标(重点关注血小板、红细胞和白细胞计数)、血清生化指标(ALT、AST、BUN、肌酐和尿酸)以及骨髓、胃肠道和肾脏的组织病理学检查。核苷类似物的主要剂量限制性毒性通常是骨髓抑制(贫血、中性粒细胞减少症)和胃肠道毒性。
参考文献

[1]. 2',3'-Dideoxy-2'-fluoro-ara-A. An acid-stable purine nucleoside active against human immunodeficiency virus (HIV). Biochem Pharmacol. 1987 Sep 1;36(17):2719-22.

其他信息
2'-脱氧-2'-氟阿拉伯腺苷的分子式为C10H12FN₅O3,分子量为269.23 g/mol。该化合物是一种嘌呤核苷类似物,可通过作为链终止剂抑制DNA合成。阿拉伯糖2'位上的氟原子通过阻止糖苷键断裂赋予其代谢稳定性。目前已对其抗多种实体瘤的活性以及抗HIV病毒的活性进行了研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H12FN5O3
分子量
269.23
精确质量
269.092
CAS号
20227-41-2
PubChem CID
11065470
外观&性状
Solid powder
密度
2.0±0.1 g/cm3
沸点
628.6±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
334.0±34.3 °C
蒸汽压
0.0±1.9 mmHg at 25°C
折射率
1.834
LogP
-0.32
tPSA
119.31
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
338
定义原子立体中心数目
4
SMILES
F[C@@]1([H])[C@@]([H])([C@@]([H])(C([H])([H])O[H])O[C@@]1([H])N1C([H])=NC2=C(N([H])[H])N=C([H])N=C12)O[H]
InChi Key
ZGYYPTJWJBEXBC-GQTRHBFLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H12FN5O3/c11-5-7(18)4(1-17)19-10(5)16-3-15-6-8(12)13-2-14-9(6)16/h2-5,7,10,17-18H,1H2,(H2,12,13,14)/t4-,5+,7-,10-/m1/s1
化学名
(2R,3R,4S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-fluoro-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7143 mL 18.5715 mL 37.1430 mL
5 mM 0.7429 mL 3.7143 mL 7.4286 mL
10 mM 0.3714 mL 1.8571 mL 3.7143 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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