Glycochenodeoxycholic acid 3-glucuronide

别名: Glycochenodeoxycholic acid 3-glucuronide; 79254-98-1; N-(3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholan-24-oyl)-glycine 3-D-glucuronide; (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[[(3R,5R,7R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-17-[(2R)-5-(carboxymethylamino)-5-oxopentan-2-yl]-7-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid; CHEBI:166729; DTXSID701274667; Glycochenodeoxycholate 3-glucuronide;
目录号: V89005 纯度: ≥98%
甘氨鹅去氧胆酸-3-葡萄糖醛酸苷是一种类固醇葡萄糖醛酸苷和血浆代谢物,可用作糖尿病和肝细胞癌 (HCC) 研究的生物标志物。
Glycochenodeoxycholic acid 3-glucuronide CAS号: 79254-98-1
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
甘氨鹅去氧胆酸-3-葡萄糖醛酸苷是一种类固醇葡萄糖醛酸苷和血浆代谢物,可用作糖尿病和肝细胞癌 (HCC) 研究的生物标志物。
生物活性&实验参考方法
靶点
Glycochenodeoxycholic acid metabolite;
体外研究 (In Vitro)
GCDC3-glucuronide是由肝脏中的UDP-葡萄糖醛酸转移酶合成的,据报道,T2DM患者的GCDC3-glucuronide水平升高。GCDC3-glucuronide水平的升高可能与男性肝脏代谢功能失调有关[1]。
参考文献

[1]. Postprandial Metabolism is Impaired in Overweight Normoglycemic Young Adults without Family History of Diabetes. Sci Rep. 2020;10(1):353. Published 2020 Jan 15.

[2]. Untargeted plasma metabolomics for risk prediction of hepatocellular carcinoma: A prospective study in two Chinese cohorts[J]. International Journal of Cancer, 2022, 151(12): 2144-2154.

其他信息
甘氨胆酸-3-葡萄糖醛酸苷是一种甾体糖苷酸。
虽然2型糖尿病(T2DM)的危险因素已知,但从正常状态过渡到糖尿病前期状态的早期预测标志物尚未确定。我们研究了110名年龄在18至40岁之间的健康受试者(男女比例为1:1)的基础代谢和混合膳食挑战后的代谢反应;受试者分为四组:T2DM患者的一级亲属(n = 30)、体重指数>23 kg/m²但<30 kg/m²者(n = 30)、糖尿病前期患者(n = 20)和正常对照组(n = 30)。我们对血浆进行了非靶向代谢组学分析,并将其与临床和生化参数、炎症标志物和胰岛素敏感性相关联。与糖尿病前期患者类似,超重受试者存在胰岛素抵抗,C肽、脂联素和胰高血糖素水平显著升高,而胃饥饿素水平降低。超重和糖尿病前期受试者体内MG(22:2(13Z, 16Z)/0:0/0:0)和溶血磷脂酰胆碱(15:0)等代谢物水平降低。男性胰岛素敏感性显著低于女性。男性空腹尿酸、黄嘌呤和甘氨胆酸-3-葡萄糖醛酸苷水平升高。然而,女性溶血磷脂和抗氧化防御代谢物水平均高于女性。超重但血糖正常的年轻人餐后代谢受损和胰岛素敏感性降低提示存在发生高血糖的风险。我们的研究结果还表明,年轻男性患糖尿病的风险更高。 [1]
对肝细胞癌 (HCC) 发生前代谢紊乱的表征有助于加深对致病通路的理解,并识别用于早期预防的新型生物标志物。我们开展了两项 1:1 配对嵌套病例对照研究(分别为 108 对和 55 对),以探讨血浆代谢组(采用液相色谱-质谱联用技术 (LC-MS) 进行分析)与中国两项前瞻性队列研究中 HCC 风险的关联。采用配对 t 检验和正交偏最小二乘判别分析 (OPLS-DA) 鉴定差异代谢物。进行加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 将代谢物分类为模块,以识别参与肝癌发生的生物学通路。我们使用多变量逻辑回归模型评估代谢物的风险预测价值。在已命名的612种代谢物中,病例组和对照组之间鉴定出44种差异代谢物,包括12种雄激素/孕激素类固醇激素、8种胆汁酸、10种氨基酸、6种磷脂和8种其他代谢物。多变量logistic回归分析显示,这些代谢物与肝细胞癌(HCC)相关,比值比范围为0.19(95%置信区间[CI]:0.11-0.35)至5.09(95% CI:2.73-9.50)。包含这612种代谢物的加权基因共表达网络分析(WGCNA)显示,存在8个与HCC风险相关的显著模块,包括代表雄激素和孕激素代谢通路、初级和次级胆汁酸以及氨基酸代谢通路的模块。 18种具有独立作用的代谢物组合显示出预测肝细胞癌风险的潜力,在训练集和验证集中的AUC分别为0.87(95% CI:0.82-0.92)和0.86(95% CI:0.80-0.93)。总之,我们鉴定了一组可能与肝细胞癌发生有关并具有预测肝细胞癌风险潜力的血浆代谢物。[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H51NO11
分子量
625.75
精确质量
625.346
CAS号
79254-98-1
PubChem CID
44263370
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
856.1±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
471.6±34.3 °C
蒸汽压
0.0±0.6 mmHg at 25°C
折射率
1.597
LogP
1.51
tPSA
203
氢键供体(HBD)数目
7
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
44
分子复杂度/Complexity
1090
定义原子立体中心数目
15
SMILES
C[C@H](CCC(=O)NCC(=O)O)[C@H]1CC[C@@H]2[C@@]1(CC[C@H]3[C@H]2[C@@H](C[C@H]4[C@@]3(CC[C@H](C4)O[C@H]5[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O5)C(=O)O)O)O)O)C)O)C
InChi Key
ABFZMYIIUREPLL-ASWJIRIHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H51NO11/c1-15(4-7-22(35)33-14-23(36)37)18-5-6-19-24-20(9-11-32(18,19)3)31(2)10-8-17(12-16(31)13-21(24)34)43-30-27(40)25(38)26(39)28(44-30)29(41)42/h15-21,24-28,30,34,38-40H,4-14H2,1-3H3,(H,33,35)(H,36,37)(H,41,42)/t15-,16+,17-,18-,19+,20+,21-,24+,25+,26+,27-,28+,30-,31+,32-/m1/s1
化学名
(2S,3S,4S,5R,6R)-6-[[(3R,5R,7R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-17-[(2R)-5-(carboxymethylamino)-5-oxopentan-2-yl]-7-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid
别名
Glycochenodeoxycholic acid 3-glucuronide; 79254-98-1; N-(3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholan-24-oyl)-glycine 3-D-glucuronide; (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[[(3R,5R,7R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-17-[(2R)-5-(carboxymethylamino)-5-oxopentan-2-yl]-7-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid; CHEBI:166729; DTXSID701274667; Glycochenodeoxycholate 3-glucuronide;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5981 mL 7.9904 mL 15.9808 mL
5 mM 0.3196 mL 1.5981 mL 3.1962 mL
10 mM 0.1598 mL 0.7990 mL 1.5981 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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