D-Sedoheptulose-7-phosphate barium

别名: D-Sedoheptulose-7-phosphate barium salt 景天酮糖,
目录号: V89774
D-景天庚酮糖-7-磷酸钡是七肽(如七肽杀菌素和潮霉素 B)的常见前体。
D-Sedoheptulose-7-phosphate barium CAS号: 17187-72-3
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
D-景天庚酮糖-7-磷酸钡是七肽(如七肽素和潮霉素 B)的常见前体。D-景天庚酮糖-7-磷酸钡通过类似的生物合成途径转化为 NDP-庚糖。
D-景天庚酮糖-7-磷酸钡盐(CAS 17187-72-3)是磷酸戊糖途径(PPP)的中间体,该途径是葡萄糖分解代谢的主要途径,可生成NADPH和核糖-5-磷酸。它是一种七碳糖磷酸,分子式为C₇H13O10P·Ba,分子量为425.47。钡盐形式可稳定该化合物,便于分离和储存。它是一种用于研究碳水化合物代谢和抗生素生物合成的生化试剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
Human Endogenous Metabolite
D-Sedoheptulose-7-phosphate functions as a substrate for the enzyme transaldolase in the non-oxidative phase of the pentose phosphate pathway. Transaldolase catalyzes the reversible transfer of a three-carbon dihydroxyacetone moiety from sedoheptulose-7-phosphate to glyceraldehyde-3-phosphate, generating erythrose-4-phosphate and fructose-6-phosphate. This reaction links the PPP to glycolysis and is essential for carbon rearrangement, nucleotide synthesis, and production of aromatic amino acid precursors.
体外研究 (In Vitro)
D-景天庚酮糖-7-磷酸是磷酸戊糖途径的中间体,其中转醛醇酶催化景天庚酮糖-7-磷酸上的三碳二羟基丙酮基团转移至甘油醛-3-磷酸,生成D-果糖-6-磷酸。它也是七肽(如七肽素和潮霉素B)生物合成的常见前体,并通过类似的生物合成途径转化为NDP-庚糖。在无细胞实验中,它可作为转醛醇酶的底物,用于研究酶动力学和磷酸戊糖途径的通量。
体内研究 (In Vivo)
D-景天庚酮糖-7-磷酸不作为药物用于动物,而是作为代谢中间体用于离体研究磷酸戊糖途径的活性。组织匀浆(例如肝脏或脑组织)可添加景天庚酮糖-7-磷酸(0.1-1 mM)以测定转醛醇酶活性。在代谢紊乱的动物模型中,景天庚酮糖-7-磷酸水平的变化可作为磷酸戊糖途径失调的生物标志物。它主要是一种研究工具,而非治疗药物。
酶活实验
转醛醇酶活性可通过偶联酶法测定。反应混合物(1 mL)包含 50 mM 三乙醇胺缓冲液(pH 7.4)、5 mM 景天庚酮糖-7-磷酸、2 mM 甘油醛-3-磷酸、0.2 mM NADH 和 5 单位甘油醛-3-磷酸脱氢酶/磷酸丙糖异构酶。加入 10-50 ug 组织匀浆或纯化的转醛醇酶启动反应。监测 340 nm 处吸光度的下降 10 分钟,并使用消光系数 6.22 mM-¹cm-¹ 计算活性。
细胞实验
本研究采用纯化的转醛醇酶构建无细胞体系进行动力学研究。将转醛醇酶(0.1-1.0 ug)与不同浓度的D-景天庚酮糖-7-磷酸(0.01-5 mM)和固定浓度的甘油醛-3-磷酸(2 mM)在50 mM三乙醇胺缓冲液(pH 7.4)中于25℃孵育10分钟。产物赤藓糖-4-磷酸通过高效液相色谱-紫外检测或偶联酶法进行定量。动力学参数(Km、Vmax)由米氏方程曲线计算得出。转醛醇酶对景天庚酮糖-7-磷酸的Km值约为0.5-1 mM。
动物实验
在细胞研究中,细胞(例如肝细胞或癌细胞系)培养于含葡萄糖的培养基中。由于D-景天庚酮糖-7-磷酸含有磷酸基团和钡,因此其不具有细胞渗透性,只能用于细胞裂解液或透化细胞中。细胞裂解液的制备方法为:在PBS缓冲液中超声处理细胞,然后向裂解液中加入2 mM景天庚酮糖-7-磷酸,并通过高效液相色谱(HPLC)或酶法定量果糖-6-磷酸的生成量来测定转醛醇酶活性。戊糖磷酸途径对细胞代谢的贡献则通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)测定景天庚酮糖-7-磷酸的水平来评估。
药代性质 (ADME/PK)
由于钡含量较高且具有毒性,D-景天庚酮糖-7-磷酸钡盐不直接用于动物。该化合物用于体外实验:将组织样本(例如肝脏、肾脏、脑组织)在缓冲液中匀浆并离心。将上清液与2 mM D-景天庚酮糖-7-磷酸在37℃下孵育30-60分钟。通过测定果糖-6-磷酸的生成或甘油醛-3-磷酸的消耗来评估转醛醇酶活性。该活性的变化与影响磷酸戊糖途径的代谢性疾病或药物治疗相关。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
磷酸基团使D-景天庚酮糖-7-磷酸具有高极性和水溶性,但该化合物不易穿过细胞膜。钡离子在分离过程中用于稳定和沉淀,但钡离子可能具有毒性;在进行生物测定前,应使用硫酸钠处理以沉淀硫酸钡,从而去除钡离子,使游离的糖磷酸留在溶液中。游离酸形式更适用于酶活性测定。钡盐在-20℃下可稳定保存长达2年。D-景天庚酮糖-7-磷酸在中性至碱性pH条件下不稳定;溶液应储存在pH 4-6的条件下。
参考文献

[1]. d-Sedoheptulose-7-phosphate is a common precursor for the heptoses of septacidin and hygromycin B.Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Mar 13;115(11):2818-2823.

其他信息
由于钡具有毒性,钡盐需要特殊处理。钡化合物摄入或吸入均有毒,可引起胃肠道紊乱、低钾血症和心律失常。大鼠口服钡盐的LD₅₀约为200-500 mg/kg。处理该化合物时应极其小心:避免产生粉尘,在通风橱内操作,并穿戴适当的个人防护装备(手套、护目镜、实验服)。泄漏物应先用硫酸钠沉淀钡后再进行处置。本品不可用于人体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C7H15BAO10P
分子量
427.49
精确质量
425.929
CAS号
17187-72-3
PubChem CID
132285237
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
183
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
319
定义原子立体中心数目
5
SMILES
C([C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H]([C@](O1)(CO)O)O)O)O)OP(=O)([O-])[O-].[Ba+2]
InChi Key
CXUFELXUIHDDQP-CQJQEINESA-L
InChi Code
InChI=1S/C7H15O10P.Ba/c8-2-7(12)6(11)5(10)4(9)3(17-7)1-16-18(13,14)15;/h3-6,8-12H,1-2H2,(H2,13,14,15);/q;+2/p-2/t3-,4-,5-,6+,7-;/m1./s1
化学名
barium(2+);[(2R,3S,4R,5S,6R)-3,4,5,6-tetrahydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]methyl phosphate
别名
D-Sedoheptulose-7-phosphate barium salt
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3392 mL 11.6962 mL 23.3924 mL
5 mM 0.4678 mL 2.3392 mL 4.6785 mL
10 mM 0.2339 mL 1.1696 mL 2.3392 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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