Cyanine 5 NHS ester tetrafluoroborate

别名: 花菁染料CY5标记活性酯
目录号: V91343 纯度: ≥98%
Cyanine 5 NHS ester tetrafluoroborate(Compound Cy5)是一种菁染料,可用于大分子的荧光检测。
Cyanine 5 NHS ester tetrafluoroborate CAS号: 1263093-76-0
产品类别: Fluorescent Dye
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
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产品描述
花菁5 NHS酯四氟硼酸盐(化合物Cy5)是一种花菁染料,可用于大分子的荧光检测。花菁5 NHS酯四氟硼酸盐的激发波长为638 nm。
花菁5 NHS酯四氟硼酸盐(CAS:1263093-76-0)是一种远红/近红外荧光花菁染料,广泛用作生物分子的标记物。该化合物具有胺反应性的N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯基团,可与蛋白质、抗体、肽和其他含胺生物分子上的伯胺(例如赖氨酸残基)共价结合。其分子式为C3₆H42BF4N3O4,分子量为667.54,可溶于二氯甲烷(DCM)、二甲基甲酰胺(DMF)和二甲基亚砜(DMSO)等有机溶剂。花菁5 NHS酯的激发波长最大值约为638-648 nm,发射波长约为670 nm,使其适用于流式细胞术、荧光显微镜和活体成像等应用。本产品仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
Not applicable; this is a fluorescent labeling reagent, not a biologically active drug with a specific molecular target.
体外研究 (In Vitro)
花菁5 NHS酯本身不具有直接的生物活性,因为它是一种惰性荧光染料。在体外,它可用作荧光标记物,通过共价偶联来可视化蛋白质和抗体等大分子。例如,用这种染料标记的抗体可用于通过免疫荧光法检测细胞或组织切片中的特定抗原。该染料的荧光可使用标准的Cy5滤光片组(激发波长638 nm,发射波长670 nm)进行检测。该化合物本身在细胞内没有药理活性,除非与靶向基团偶联,否则不会与受体或酶相互作用。
体内研究 (In Vivo)
该染料本身不具有体内生物活性。花菁5 NHS酯在动物研究中用作荧光探针,与抗体、肽或纳米颗粒等靶向载体偶联后用于体内成像。标记的偶联物可通过静脉注射给药于小鼠或大鼠,进行近红外 (NIR) 成像,以追踪肿瘤的积累、生物分布和药代动力学。该染料的近红外特性使其能够更深地穿透组织并降低背景自发荧光。染料本身不具有活性;其活性完全取决于偶联的生物分子。本产品并非治疗药物,也不具有内在的药效学作用。
酶活实验
由于该NHS酯染料的作用机制纯粹是化学偶联而非靶标结合,因此不适用于酶/受体结合试验。为进行NHS酯的质量控制,可将其与模型胺化合物(例如丁胺)在有机溶剂(例如DMF或DMSO)中于室温下反应1-2小时,以评估其化学反应活性。反应进程和酰胺键合产物的生成可通过薄层色谱(TLC)或高效液相色谱(HPLC)进行监测。或者,也可将该染料与标准蛋白(例如牛血清白蛋白,BSA)偶联,并使用分光光度计在280 nm和648 nm处测量吸光度来确定标记效率(染料与蛋白质的比例)。
细胞实验
蛋白质或抗体的染料标记可在细胞培养基或PBS缓冲液中进行。典型的操作步骤是将NHS酯染料溶解于无水DMSO中,配制成10 mM的浓度。将待标记的蛋白质(例如,1 mg/mL,溶于0.1 M碳酸氢钠缓冲液,pH 8.5)与10-20倍摩尔过量的染料溶液混合。混合物在室温下轻柔摇晃孵育1小时。未反应的染料可通过透析、尺寸排阻色谱或离心过滤去除。然后将标记的蛋白质以所需浓度(例如,1-10 ug/mL)加入培养细胞中,并在37℃下孵育30-60分钟。洗去未结合的染料后,使用荧光显微镜对细胞进行成像或通过流式细胞仪进行分析。
动物实验
根据偶联物的重量,将标记的抗体或纳米颗粒以 1-10 mg/kg 的剂量通过静脉注射(例如,经尾静脉)给药给小鼠。在注射后的不同时间点(例如,1、6、24、48 小时),对动物进行麻醉,并使用配备 Cy5 滤光片组(激发波长 640-660 nm,发射波长 670-720 nm)的活体成像系统采集全身荧光图像。采集血液和主要器官(肝脏、肾脏、脾脏、肺、心脏、肿瘤)用于离体成像。对于被动靶向研究,注射未偶联的染料作为对照。所有动物实验程序均需获得 IACUC 批准。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无 NHS 酯本身的药代动力学 (PK) 数据;其药代动力学取决于偶联分子。NHS 酯基团在水性介质中水解不稳定;其在 25℃、pH 7.4 的 PBS 缓冲液中的半衰期约为 1 小时。对于偶联产物(染料-蛋白质),其血浆半衰期取决于蛋白质载体。溶解性:可溶于二氯甲烷 (DCM)、二甲基甲酰胺 (DMF) 和二甲基亚砜 (DMSO)(10 mM 储备液)。粉末应储存于 -20℃,干燥避光。DMSO 储备液可在 -80℃ 下保存长达 6 个月。用于体内成像时,标记的偶联物通常配制于 PBS 缓冲液或无菌生理盐水中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无该NHS酯染料单独使用的毒性数据;其毒性取决于结合的分子。作为一种化学试剂,该NHS酯具有水解反应活性,可能引起皮肤和眼睛刺激。该化合物被归类为刺激性物质,吸入后可能引起呼吸道刺激。必须遵守标准的实验室安全预防措施:在通风橱内操作,佩戴耐化学腐蚀手套、实验服和护目镜。该化合物未获准用于人类或兽医用途,仅限科研用途。该染料的未结合形式不可口服或注射。
参考文献

[1]. Prevention of H‐aggregates formation in Cy5 labeled macromolecules[J]. International Journal of Polymer Science, 2010, 2010(1): 264781.

其他信息
花菁5 NHS酯四氟硼酸盐是一种研究级荧光染料,广泛用于生物分子标记,尤其是在流式细胞术、免疫荧光和活体成像领域。它是一种胺反应性N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯,专门设计用于与伯胺基团偶联。其激发/发射波长最大值分别为648/670 nm,与标准Cy5滤光片组兼容。常见应用包括抗体标记、蛋白质印迹检测、核酸探针和细胞示踪。本产品并非药品,也未经过临床试验或获得任何治疗或诊断适应症的监管批准。本产品仅供合格研究人员在实验室中使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C36H42BF4N3O4
分子量
667.54
精确质量
667.32
CAS号
1263093-76-0
PubChem CID
164777226
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
69.9
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
48
分子复杂度/Complexity
1210
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FB(F)F.[F-].O(C(CCCCCN1C2C=CC=CC=2C(C)(C)C1=CC=CC=CC1C(C)(C)C2C=CC=CC=2[N+]=1C)=O)N1C(CCC1=O)=O
InChi Key
LWGOCTDPEVJNTC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C36H42N3O4.BF4/c1-35(2)26-16-11-13-18-28(26)37(5)30(35)20-8-6-9-21-31-36(3,4)27-17-12-14-19-29(27)38(31)25-15-7-10-22-34(42)43-39-32(40)23-24-33(39)41;2-1(3,4)5/h6,8-9,11-14,16-21H,7,10,15,22-25H2,1-5H3;/q+1;-1
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2Z)-3,3-dimethyl-2-[(2E,4E)-5-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dienylidene]indol-1-yl]hexanoate;tetrafluoroborate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4980 mL 7.4902 mL 14.9804 mL
5 mM 0.2996 mL 1.4980 mL 2.9961 mL
10 mM 0.1498 mL 0.7490 mL 1.4980 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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