| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
5-Propargylamino-3'-azidomethyl-dCTP TEA has no biological target. It is a synthetic substrate for DNA polymerases. The azidomethyl group at the 3' position acts as a reversible terminator, blocking further nucleotide addition after incorporation. This property is essential for next-generation sequencing (SBS). The propargylamino group provides a chemical handle (an alkyne) for attaching fluorophores or biotin via click chemistry after DNA synthesis is complete.
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| 体外研究 (In Vitro) |
该化合物的“活性”是指其作为DNA聚合酶底物并进行点击化学反应的能力。在体外聚合实验中,它能高效地掺入DNA链(与天然dCTP类似)。3'-叠氮甲基在每个循环后均可被化学裂解,从而促进链的延伸。炔丙基胺基团可用于铜(I)催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAC),以连接叠氮标记的分子(例如叠氮-Cy3)。TEA盐可提高溶解度并去除聚合酶抑制剂。
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| 体内研究 (In Vivo) |
具体的体内活性数据不适用。该化合物不用于动物实验。它用于无细胞分子生物学应用。然而,如果能通过细胞膜通透化将此类修饰核苷酸导入细胞,则可用于“Edu”或“BrdU”类型的检测,但这并非标准方法。其主要用途是体外诊断和研究检测。
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| 酶活实验 |
不适用。该化合物是聚合酶的底物,而非抑制剂。它不用于标准的酶抑制或受体结合实验。其掺入可通过引物延伸实验进行测定。实验步骤:设计合成DNA模板。配制反应体系,包含50 mM Tris-Cl(pH 8.0)、10 mM MgCl2、1 mM DTT、0.5 uM DNA模板、0.5 uM引物、100 uM dATP、dGTP和dTTP。向反应混合物中加入100 uM修饰的dCTP(5-丙炔基氨基-3'-叠氮甲基-dCTP)。加入DNA聚合酶(例如,9degN exo-)。进行15个循环的PCR反应。通过PAGE分析。在正确长度处出现可见条带表明成功掺入。
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| 细胞实验 |
不适用。该化合物本身不能直接应用于活细胞,因为它是一种高极性三磷酸盐,无法穿过细胞膜。但是,它可以用于标记固定细胞中的DNA。操作步骤:制备Jurkat细胞的细胞涂片。用4%多聚甲醛(PFA)固定细胞,用0.2% Triton X-100透化。将细胞与TdT酶(末端脱氧核苷酸转移酶)和5-丙炔基氨基-3'-叠氮甲基-dCTP TEA(50 uM)孵育,以标记DNA片段(TUNEL)。进行点击化学反应:将细胞与10 uM硫酸铜(CuSO4)、50 uM AF488-叠氮化物和10 mM抗坏血酸钠孵育30分钟。洗涤。绿色荧光的出现表明DNA链断裂(细胞凋亡)。
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| 动物实验 |
不适用。该化合物不用于活体动物。但是,它可用于检测组织切片中的细胞凋亡。操作步骤:制备5 μm厚的石蜡包埋小鼠肝组织切片(例如,来自药物诱导肝损伤模型)。脱蜡、复水和透化处理。用含有5-丙炔氨基-3'-叠氮甲基-dCTP TEA和TdT的TUNEL反应混合物处理切片。与炔烃荧光染料进行点击反应。用DAPI复染。组织切片中TUNEL阳性(绿色)细胞的数量与药物处理诱导的细胞凋亡水平成正比。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
药代动力学数据不适用。该化合物是一种三磷酸核苷酸,不能穿过细胞膜。它不是一种全身性药物。体外实验中,该化合物以水溶液形式提供,以避免冻融降解,因为三磷酸对核酸酶和磷酸酶敏感。三乙胺盐(TEA)优于钠盐,因为在DNA合成过程中TEA更容易去除,从而获得更纯净的产品。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
未提供具体的毒性数据。该化合物不适用于体内实验。请遵循分子生物学试剂的标准安全操作规程。避免接触皮肤和眼睛。为保持稳定性,应储存于-20℃或-80℃。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
5-丙炔氨基-3'-叠氮甲基-dCTP TEA 是一种用于下一代测序 (NGS) 的可逆终止核苷酸。在 SBS 中,四种核苷酸(dATP、dGTP、dCTP 和 dTTP)均以这种修饰形式存在,每种核苷酸都通过可裂解的连接子连接着不同的荧光染料。这使得“边合成边测序”成为可能。这种特定的类似物(dCTP)能够用于掺入和成像“C”碱基。本产品仅供研究使用。
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| 分子式 |
C13H20N7O13P3.3.3C6H15N
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| 分子量 |
909.19
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| 外观&性状 |
Solid Powder
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: (1). 请将本产品存放在密封保护的环境中,避免受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
H2O : ~125 mg/mL (~137.49 mM; with ultrasonication)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.0999 mL | 5.4994 mL | 10.9988 mL | |
| 5 mM | 0.2200 mL | 1.0999 mL | 2.1998 mL | |
| 10 mM | 0.1100 mL | 0.5499 mL | 1.0999 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。