Propargyl-PEG3-acid

别名: Propyne-PEG2-CH2CH2COOH; Propargyl-PEG3-acid 丙炔基-二聚乙二醇-羧酸;丙炔基-二聚乙二醇-乙酸
目录号: V13212 纯度: ≥98%
Propargyl-PEG3-acid 是一种不可裂解(不可降解)的 ADC 连接体,含有 3 个聚乙二醇 (PEG) 单元。
Propargyl-PEG3-acid CAS号: 1347760-82-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
丙炔基-PEG3-酸是一种不可裂解(不可降解)的抗体药物偶联物(ADC)连接子,含有3个聚乙二醇(PEG)单元。它也是一种基于PEG的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接子,可用于制备6-OHDA-PEG3-炔。6-OHDA-PEG3-炔由6-OHDA和丙炔基-PEG3-酸组成。丙炔基-PEG3-酸是一种点击化学试剂。它含有炔基,可以与含有叠氮基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
丙炔基-PEG3-酸(CAS号:1347760-82-0)是一种单分散的异双功能PEG连接子,其末端炔基和羧酸基团通过三乙二醇间隔基连接。其分子式为C10H16O5,分子量为216.23。它广泛应用于化学生物学中的生物正交偶联(点击化学)和药物递送研究。炔烃可与叠氮化物发生CuAAC反应,而酸在活化后可与胺形成酰胺。PEG3间隔基可提高溶解度并降低空间位阻,使其成为合成抗体药物偶联物(ADC)、PROTAC和荧光探针的理想选择。该化合物储存于-20℃,纯度≥95%。
生物活性&实验参考方法
靶点
Propargyl-PEG3-acid is a linker molecule and does not possess a specific biological target or receptor. Its "target" is the functional groups it reacts with: primary amines (via the carboxylic acid group after activation with EDC or HATU) and organic azides (via the alkyne group in a copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition). In the context of drug conjugate synthesis, it serves as a non-cleavable bridge connecting a targeting moiety (e.g., antibody) to a payload (e.g., cytotoxin) or an E3 ligase ligand. Its role is purely chemical, providing the required spatial arrangement and stability without interfering with biological recognition.
体外研究 (In Vitro)
抗体药物偶联物(ADC)通过ADC连接子与抗体连接形成ADC。PROTAC包含两个不同的配体,一个与E3泛素连接酶结合,另一个与靶蛋白结合,这两个配体通过连接子连接。PROTAC通过细胞内泛素-蛋白酶体系统靶向并选择性降解靶蛋白。
丙炔基-PEG3-酸在体外不具有内在药理活性;其活性取决于其化学反应性和作为构建单元的用途。它可用于合成神经毒素偶联物6-OHDA-PEG3-炔,展现了其多功能性。其高纯度和确定的PEG链长确保了生化分析中可重复的偶联效率。PEG3间隔基增强了偶联分子的水溶性,这对于维持其在水性生物缓冲液中的活性至关重要。它还用于制备多功能纳米颗粒和生物传感器的表面涂层。
体内研究 (In Vivo)
由于丙炔基-PEG3-酸本身并非治疗药物,因此无法直接获取其体内活性数据。然而,使用该连接子合成的缀合物,例如PROTAC或ADC候选药物,其设计目标是提高体内疗效。连接子的稳定性、溶解度和清除特性直接影响最终构建体的药代动力学。例如,PEG3连接子通常能够延长循环时间并降低免疫原性。在动物模型中,通过与其他连接子化学方法的比较研究,评估缀合药物的疗效,并评价连接子对整体治疗指数的贡献。
酶活实验
在无细胞化学偶联实验中评估了丙炔基-PEG3-酸的反应活性。对于羧酸,通过使其与模型伯胺(例如苄胺)在偶联剂(如EDC或HATU)存在下反应,测试其形成酰胺键的能力。反应产率通过薄层色谱(TLC)、高效液相色谱(HPLC)或液相色谱-质谱联用(LC-MS)进行监测。对于炔烃,通过在CuAAC条件下与模型叠氮化物(例如苄基叠氮化物)反应来评估其点击反应活性。三唑产物的生成通过质谱和核磁共振(NMR)进行确认。这些实验确保了连接基团在用于复杂生物偶联之前的功能完整性。
细胞实验
在细胞实验中,丙炔基-PEG3-酸并非直接用作调节剂,而是作为合成细胞渗透性探针或药物偶联物的组分。例如,可通过该连接子将荧光叠氮化物点击到炔烃标记的细胞表面糖蛋白上,从而实现活细胞成像。此外,它还可用于合成PROTAC,并在癌细胞系中测试其对靶蛋白的降解作用。通过比较不同PEG链长或不同连接子类型的偶联物的活性,可以评估该连接子对细胞摄取和细胞内稳定性的影响。
动物实验
在动物研究中,丙炔基-PEG3-酸不作为独立化合物使用。它是药物偶联物合成的关键组成部分,这些偶联物随后会在体内进行测试。例如,使用该连接子合成的抗体药物偶联物(ADC)会在异种移植小鼠模型中进行给药,以评估其对肿瘤生长的抑制作用。通过药代动力学和毒代动力学分析,评估该连接子对酶切的敏感性、其对血浆半衰期的影响以及其对脱靶毒性的影响。在这些研究中,会将该连接子的性能与可裂解或亲水性更强的连接子进行比较,以优化治疗窗口。
药代性质 (ADME/PK)
丙炔基-PEG3-酸是一种小分子亲水性化合物,其计算的LogP值为-0.72,表明其具有良好的水溶性。它通常以固体形式储存在-20°C,可稳定保存长达2年。当溶于DMSO或水时,应立即使用,以避免酸基水解。其药代动力学性质尚未直接测定,但PEG3连接基团通常能提高溶解度并减少聚集,从而改善大分子生物分子偶联物的整体药代动力学特征。酸基便于进行放射性标记或荧光标记,用于追踪目的。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
丙炔基-PEG3-酸作为一种化学试剂,毒性较低。然而,仍应遵守标准的实验室安全预防措施,包括佩戴手套和护目镜。目前尚未发现其具有致突变性或致癌性。在药物偶联物中,安全性取决于有效载荷和靶向部分,而非连接子本身。基于PEG的连接子通常被认为安全且具有生物相容性,免疫原性有限。由于它并非药物活性成分,因此没有详细的毒理学数据;其用途仅限于研发。
参考文献
[1]. Farzam A, et al. A functionalized hydroxydopamine quinone links thiol modification to neuronal cell death. Redox Biol. 2020 Jan;28:101377.
[2]. Albone, Earl F, et al. ERIBULIN-BASED ANTIBODY-DRUG CONJUGATES AND METHODS OF USE. Patent. 20170252458.
其他信息
丙炔基-PEG3-酸是一种市售的研究级连接剂,广泛应用于学术界和工业界,用于合成生物偶联物、药物递送系统和诊断探针。其明确的PEG3结构确保了批次间的一致性,这对于可重复的生物学研究至关重要。它并非FDA批准的药物,也不适用于人体。它是开发下一代靶向疗法(包括抗体药物偶联物和蛋白水解靶向嵌合体)的关键试剂。随着点击化学和精准医疗方法的兴起,其应用也日益广泛。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H16O5
分子量
216.233
精确质量
216.099
CAS号
1347760-82-0
PubChem CID
60146217
外观&性状
Colorless to light yellow liquid(Density:1.131±0.06 g/cm3)
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
348.0±32.0 °C at 760 mmHg
闪点
131.8±18.6 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.467
LogP
-0.44
tPSA
65
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
15
分子复杂度/Complexity
205
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(CCOCC#C)CCOCCC(=O)O
InChi Key
CJNSWLAJTZVSRB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H16O5/c1-2-4-13-6-8-15-9-7-14-5-3-10(11)12/h1H,3-9H2,(H,11,12)
化学名
3-[2-(2-prop-2-ynoxyethoxy)ethoxy]propanoic acid
别名
Propyne-PEG2-CH2CH2COOH; Propargyl-PEG3-acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.6247 mL 23.1235 mL 46.2471 mL
5 mM 0.9249 mL 4.6247 mL 9.2494 mL
10 mM 0.4625 mL 2.3124 mL 4.6247 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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