Propargyl-PEG8-acid

别名: Propargyl-PEG8-acid Propyne-PEG7-CH2CH2COOH
目录号: V5789 纯度: ≥98%
Propargyl-PEG8-acid 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC 桥。
Propargyl-PEG8-acid CAS号: 2055014-94-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
100mg
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产品描述
丙炔基-PEG8-酸是一种聚乙二醇(PEG)类PROTAC桥联剂。丙炔基-PEG8-酸可用于制备多种PROTAC蛋白降解剂。丙炔基-PEG8-酸是一种可裂解的ADC桥联剂,用于合成抗体活性分子偶联物(ADC)。这些ADC可用于治疗革兰氏阴性菌引起的细菌感染。丙炔基-PEG8-酸也是一种点击化学试剂。它含有炔基,可与含有叠氮基的化合物发生 CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
丙炔基-PEG8-酸(CAS号:2055014-94-1)是一种单分散的异双功能聚乙二醇(PEG)连接剂,其末端包含一个丙炔基(炔基)和一个羧酸基团,两者之间由一个八单元的PEG间隔基(PEG8)隔开。其分子量为436.49 g/mol,分子式为C20H36O10。丙炔基-PEG8-酸是一种可裂解的ADC连接剂,用于合成抗体药物偶联物(ADC)。它也是一种基于PEG的PROTAC连接剂。较长的PEG8间隔基赋予其更高的柔韧性、亲水性和溶解性,同时减少聚集。
生物活性&实验参考方法
靶点
Propargyl-PEG8-acid does not have a specific biological target, as it is a chemical linker. Its function is to serve as a covalent connector between molecular components. The propargyl group is a target for click chemistry, reacting with azide-containing molecules to form a stable triazole linkage. The carboxylic acid is a target for conjugation with primary amines to form amide bonds. The hydrophilic PEG8 spacer enhances solubility and reduces steric hindrance. The cleavable nature of the linker allows for the controlled release of a payload, for example, in the context of ADCs used against Gram-negative bacteria.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC 中含有两种不同的配体,一种与 E3 泛素连接酶结合,另一种与靶蛋白结合,二者通过连接子连接。PROTAC 通过细胞内泛素-蛋白酶体系统靶向并选择性降解靶蛋白。抗体药物偶联物 (ADC) 细胞毒素通过 ADC 连接子与抗体连接形成 ADC。丙炔基-PEG8-酸作为连接子,本身不具有任何直接的体外生物活性。它的作用是促进生物活性偶联物的合成。该连接子的体外活性是通过对其所合成的最终偶联物的表征来间接评估的。例如,当用于合成 ADC 时,偶联物的活性通过基于细胞的靶点结合、内化和细胞毒性检测来评估。PEG8 连接子通过提高偶联物的溶解度并提供必要的间隔来增强其整体活性。
体内研究 (In Vivo)
丙炔基-PEG8-酸不适用于单独使用。其在体内的应用价值在于作为大型偶联物(例如抗体药物偶联物 (ADC) 或靶向抗体偶联物 (PROTAC))的组成部分。在这些情况下,亲水性的PEG8间隔基通过提高溶解度和减少聚集来改善偶联物的整体药代动力学特性。然而,具体的体内活性取决于偶联物的活性基团和靶向配体,而非连接基本身。连接基的作用是稳定地连接各个功能组分。
酶活实验
由于丙炔基-PEG8-酸是一种化学试剂,因此目前尚无针对该物质的特定体外酶或受体结合试验。其表征主要采用核磁共振(NMR)、高效液相色谱(HPLC)和质谱(MS)等分析化学技术,以验证其结构和纯度。丙炔基的功能性可通过与含叠氮化合物反应并监测三唑键的形成来确认。羧酸的反应活性可通过与模型胺反应进行测试。这些步骤属于质量控制步骤,而非生物学检测。
细胞实验
由于丙炔基-PEG8-酸本身不具有生物活性,因此目前尚无针对该物质的标准体外细胞检测方法。它在细胞生物学中的应用是间接的,主要作为构建生物偶联物的试剂。例如,当用于构建抗体药物偶联物(ADC)时,ADC杀伤癌细胞的能力需要在细胞检测中进行评估。连接子的作用是确保ADC的功能性和稳定性。然而,目前尚无针对该连接子在细胞内活性的直接检测方法。
动物实验
丙炔基-PEG8-酸不作为独立化合物用于体内动物实验。它是合成生物偶联物(例如抗体药物偶联物 (ADC) 或 PROTAC)的构筑单元。动物实验将使用包含该连接子的最终较大偶联物进行。在这些研究中,可以通过将其与使用不同连接子制备的偶联物进行比较,来评估该连接子对偶联物整体药代动力学和药效学特征的影响。然而,目前尚无针对该连接子本身的标准动物实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
丙炔基-PEG8-酸的分子量为436.49 g/mol,分子式为C20H36O10,CAS号为2055014-94-1。它是一种固体化合物,可溶于DMSO等有机溶剂。建议将粉末储存在-20℃。由于该化合物是一种连接剂而非治疗剂,因此无需进行详细的药代动力学研究。作为研究用化学品,其稳定性可通过适当的储存条件来维持。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
丙炔基-PEG8-酸被认为毒性较低,与其他基于PEG的连接剂一致。PEG聚合物被广泛认为具有生物相容性、无毒且无免疫原性。该化合物被归类为研究试剂,操作时应遵循标准的实验室安全预防措施。其毒性特征尚未得到广泛研究,但鉴于其预期用途和化学类别,预计不会产生急性毒性。
参考文献
[1]. Suzanne AKERS-RODRIGUEZ, et al. Compositions and methods for the treatment of bacterial infections. WO2019126353A2.
其他信息
丙炔基-PEG8-酸是一种仅供研究使用的试剂,并非药物,也未获准用于任何临床或治疗用途。它是一种异双功能PEG连接剂,包含一个丙炔基和一个羧酸基团。它是一种可裂解的ADC连接剂,用于合成抗体药物偶联物(ADC),同时也是一种基于PEG的PROTAC连接剂。丙炔基可用于点击化学反应,而羧酸基团可用于形成酰胺键。延长的PEG8间隔基赋予其更高的柔韧性、亲水性和溶解度,同时还能减少聚集。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H36O10
分子量
436.5
精确质量
436.23
CAS号
2055014-94-1
PubChem CID
102514878
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
531.0±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
171.9±23.6 °C
蒸汽压
0.0±3.0 mmHg at 25°C
折射率
1.469
LogP
-2.23
tPSA
111
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
25
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
410
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(CCOCCOCCOCCC(=O)O)CCOCCOCCOCCOCC#C
InChi Key
QZQUQXNQKWZDNM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H36O10/c1-2-4-23-6-8-25-10-12-27-14-16-29-18-19-30-17-15-28-13-11-26-9-7-24-5-3-20(21)22/h1H,3-19H2,(H,21,22)
化学名
3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-prop-2-ynoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoic acid
别名
Propargyl-PEG8-acid Propyne-PEG7-CH2CH2COOH
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2910 mL 11.4548 mL 22.9095 mL
5 mM 0.4582 mL 2.2910 mL 4.5819 mL
10 mM 0.2291 mL 1.1455 mL 2.2910 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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