PROTAC CYP1B1 degrader-1

目录号: V44795 纯度: ≥98%
PROTAC CYP1B1 degrader-1(化合物 6C)是一种 α-萘黄酮嵌合类似物,可以通过靶向 CYP1B1 降解来消除细胞色素 P450 (CYP)1B1 介导的耐药性。
PROTAC CYP1B1 degrader-1 CAS号: 2411389-67-6
产品类别: New3
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产品描述
PROTAC CYP1B1降解剂-1(化合物6C)是一种α-萘黄酮嵌合类似物,可通过靶向CYP1B1降解来消除细胞色素P450 (CYP)1B1介导的耐药性。其对CYP1B1和CYP1A2的IC50值分别为95.1 nM和9838.6 nM。PROTAC CYP1B1降解剂-1可用于研究CYP1B1过表达的前列腺癌。
PROTAC CYP1B1 降解剂-1(化合物 6C,CAS 2411389-67-6)是一种基于 alpha-萘黄酮的嵌合 PROTAC,可诱导细胞色素 P450 1B1 (CYP1B1) 的降解,CYP1B1 是一种与耐药性和肿瘤进展有关的酶。
生物活性&实验参考方法
靶点
PROTAC CYP1B1 degrader-1 targets CYP1B1 for ubiquitination and proteasomal degradation. It shows potent inhibitory activity against CYP1B1 (IC50 = 95.1 nM) with high selectivity over CYP1A2 (IC50 = 9838.6 nM), minimizing off-target effects on other CYP isoforms. It is designed to eliminate CYP1B1-mediated drug resistance.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞CYP抑制试验中,PROTAC CYP1B1降解剂-1对CYP1B1的抑制IC50值为95.1 nM。在细胞内,它作为PROTAC发挥作用,通过cereblon配体泊马度胺募集E3泛素连接酶至CYP1B1,导致CYP1B1泛素化并随后被26S蛋白酶体降解。这恢复了细胞对被CYP1B1灭活药物的化疗敏感性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,PROTAC CYP1B1降解剂-1已在以CYP1B1过表达为特征的前列腺癌模型中进行了研究。该化合物通过诱导CYP1B1的持续降解,有望逆转CYP1B1介导的化疗耐药性,从而增强抗肿瘤疗效。详细的剂量信息需要进一步的文献查阅。
酶活实验
无细胞CYP抑制试验采用重组人CYP1B1酶、荧光底物和NADPH再生系统。加入不同浓度的PROTAC CYP1B1降解剂-1(0.1 nM-100 uM)。在37℃孵育30-60分钟后,测量代谢物(例如试卤灵)的荧光强度。对于三元复合物的形成,可将化合物与纯化的CYP1B1和cereblon孵育,并通过SPR或AlphaScreen技术评估复合物的形成。
细胞实验
将过表达CYP1B1的前列腺癌细胞接种于96孔板中。用PROTAC CYP1B1降解剂-1(0.1-10 uM)处理细胞6-48小时。通过Western blot法定量CYP1B1蛋白水平。随后,用化疗药物(例如多西他赛)处理细胞72-96小时,并通过MTT或CellTiter-Glo法检测细胞活力以评估其再敏化情况。通过caspase-3/7激活或Annexin V染色检测细胞凋亡。
动物实验
在CYP1B1过表达前列腺癌的小鼠异种移植模型中,PROTAC CYP1B1降解剂-1可能通过腹腔或静脉注射给药,剂量范围为10-50 mg/kg,每日或隔日一次,持续2-4周。使用游标卡尺测量肿瘤体积。治疗后,收集肿瘤组织进行CYP1B1蛋白分析(Western blot)和细胞凋亡标志物检测。
药代性质 (ADME/PK)
药代动力学数据有限。分子量:785.80;分子式:C43H39N5O10。溶解度:DMF(10 mg/mL)。储存:粉末在-20℃避光保存3年;溶剂在-80℃保存6个月。该化合物包含一个cereblon配体(泊马度胺)、一个连接基团和一个CYP1B1结合部分(α-萘黄酮)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PROTAC 分子的标准安全预防措施适用。PROTAC CYP1B1 降解剂-1 仅供研究使用,不可用于人体治疗。避免吸入和接触。使用个人防护装备并在通风良好的区域工作。
其他信息
本品为研究级PROTAC,并非已获批准的药物。它用于研究CYP1B1在耐药性和癌症中的作用。它是一种用于选择性降解CYP1B1的有效化学探针。纯度:≥98%。也称为基于α-萘黄酮的CYP1B1降解剂。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C43H39N5O10
分子量
785.79727101326
精确质量
785.269
CAS号
2411389-67-6
PubChem CID
162657232
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
5
tPSA
178
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
14
重原子数目
58
分子复杂度/Complexity
1570
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1(=O)C2=C(C(OCCCCCCN3C=C(C4=CC=C(C5OC6=C7C(C(OC)=CC=C7OC)=C(OC)C=C6C(=O)C=5)C=C4)N=N3)=CC=C2)C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O
InChi Key
MRMQVUIZIOZVSD-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C43H39N5O10/c1-54-31-16-17-32(55-2)39-38(31)35(56-3)21-27-30(49)22-34(58-40(27)39)25-13-11-24(12-14-25)28-23-47(46-45-28)19-6-4-5-7-20-57-33-10-8-9-26-37(33)43(53)48(42(26)52)29-15-18-36(50)44-41(29)51/h8-14,16-17,21-23,29H,4-7,15,18-20H2,1-3H3,(H,44,50,51)
化学名
2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-4-[6-[4-[4-(6,7,10-trimethoxy-4-oxobenzo[h]chromen-2-yl)phenyl]triazol-1-yl]hexoxy]isoindole-1,3-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMF : 10 mg/mL (~12.73 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2726 mL 6.3629 mL 12.7259 mL
5 mM 0.2545 mL 1.2726 mL 2.5452 mL
10 mM 0.1273 mL 0.6363 mL 1.2726 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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