Pseudothymidine

别名: 5-(2-脱氧-BETA-D-赤式-呋喃戊糖基)-1-甲基-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮;PSEUDOTHYMIDINE
目录号: V29761 纯度: ≥98%
Pseudothymidine 是胸苷的 C-核苷类似物。
Pseudothymidine CAS号: 65358-15-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
100mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
假胸苷是胸苷的C-核苷类似物。
假胸苷(CAS号:65358-15-8)是胸苷的C-核苷类似物,是一种修饰的核酸成分,其胸腺嘧啶核苷结构中的天然2-脱氧核糖被碳环部分取代。这种结构修饰增强了化合物的稳定性和抗酶降解能力,同时保留了其参与核酸合成和调控过程的能力。假胸苷的分子式为C10H14N2O5,分子量为242.23。该化合物也称为5-甲基-2'-脱氧假尿苷。它是一种合成核苷类似物,广泛应用于研究领域,包括病毒DNA复制、核酸代谢和合成生物学的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
Pseudothymidine is a thymidine analog that functions as a modified nucleoside. Its primary mechanism of action involves incorporation into DNA and RNA during replication and transcription, where it mimics thymidine. By substituting for natural thymidine, Pseudothymidine can terminate DNA chain elongation, enabling detailed polymerase inhibition research. The compound's C-nucleoside structure, with a carbon-carbon glycosidic bond instead of the natural nitrogen-carbon bond, provides enhanced stability and resistance to enzymatic degradation. This makes Pseudothymidine a useful tool for studying nucleic acid metabolism, polymerase function, and synthetic biology applications.
体外研究 (In Vitro)
假胸苷是胸苷的C-核苷衍生物[1]。计算得到的ΔΔG°50/mod为-0.5 kcal/mol,而ΔTm/mod为0.82°C。对于含有9个dA-T/ψT碱基对的双链体,ΔTm/mod为-0.9°C,而ΔΔG°50/mod为+1.1 kcal/mol。修饰含有12个连续dA-T/ψT碱基对的双链体后,ΔTm/mod为-0.9°C,ΔΔG°50/mod为+1.2 kcal/mol[2]。
体外研究表明,假胸苷可在DNA和RNA复制和转录过程中掺入其中,因此可用于核酸代谢和合成生物学的研究。该化合物模拟胸苷,能够终止DNA链的延伸,从而可以进行深入的聚合酶抑制研究。假胸苷的计算ΔΔGdeg50/mod值为-0.5 kcal/mol,ΔTm/mod值为0.82°C,表明其对核酸稳定性有影响。该化合物可与聚合酶或解旋酶抑制剂联合使用,以阻断病毒基因组的延伸,并增强研究模型中的抗病毒持久性。然而,目前关于其IC50值和比活性的详细数据仍然有限。
体内研究 (In Vivo)
关于假胸苷的体内研究有限。作为一种合成核苷类似物,该化合物在抗病毒研究领域具有潜在应用价值,尤其是在病毒DNA复制研究中。假胸苷可与聚合酶或解旋酶抑制剂联用,以阻断病毒基因组的延伸,并在研究模型中增强抗病毒药物的持久性。然而,已发表的文献中鲜有关于假胸苷体内疗效的具体数据。需要开展动物实验来评估该化合物的抗病毒活性、药代动力学和安全性。
酶活实验
体外酶/受体结合试验通常研究假胸苷与DNA和RNA聚合酶的相互作用。该化合物可用作聚合酶反应中的底物类似物,以研究核苷酸掺入和链终止的机制。在这些试验中,将假胸苷添加到含有模板DNA、引物和其他核苷酸的聚合酶反应混合物中。使用放射性标记或荧光标记的底物监测假胸苷掺入正在延伸的核酸链的情况。通过分析反应产物的大小分布来评估该化合物终止链延伸的能力。这些试验有助于深入了解聚合酶的特异性和核苷类似物的作用机制。
细胞实验
假胸苷的细胞活性检测通常包括用该化合物处理培养细胞,并评估其掺入核酸的情况。细胞在合适的培养基中培养,并用不同浓度的假胸苷处理特定时间。提取细胞核酸,并使用质谱、高效液相色谱或基于特异性抗体的检测等技术分析假胸苷的掺入情况。该化合物对细胞增殖、核酸合成和基因表达的影响可使用标准细胞生物学技术进行评估。在抗病毒研究中,用假胸苷处理感染病毒的细胞以评估其抗病毒活性。
动物实验
现有文献中关于假胸苷的体内动物研究资料并不丰富。对于类似的核苷类似物,典型的体内研究方案是使用小鼠或大鼠病毒感染模型。该化合物以不同剂量经口服、腹腔注射或静脉注射给药,并通过测量病毒载量、存活率和感染的临床症状来评估其抗病毒疗效。此外,还会评估生物利用度、半衰期和组织分布等药代动力学参数。然而,目前尚未发表针对假胸苷的具体实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
假胸苷的药代动力学数据有限。该化合物的分子量为242.23,分子式为C10H14N2O5。作为一种修饰的核苷类似物,假胸苷与天然胸苷相比,预计具有更高的稳定性和更强的抗酶降解能力。该化合物为浅黄色至黄色固体。目前尚未测定该化合物的详细药代动力学参数,例如口服生物利用度、半衰期、清除率和组织分布。该化合物通常在室温下储存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
已发表的文献中没有关于假胸苷的毒理学数据。作为一种研究化合物,假胸苷尚未在临床前研究中进行系统的毒性评估。需要进行包括急性毒性、重复给药毒性和遗传毒性研究在内的标准毒理学评估,以确定该化合物在任何潜在治疗应用中的安全性。该化合物与天然核苷的结构相似性表明其可能具有合理的安全性,但这仍需通过适当的毒理学研究来证实。
参考文献

[1]. An in vitro screening technique for DNA polymerases that can incorporate modified nucleotides. Pseudo-thymidine as a substrate for thermostable polymerases. Nucleic Acids Res. 1999 Jul 1; 27(13): 2792-2798.

[2]. Incorporation of multiple sequential pseudothymidines by DNA polymerases and their impact on DNA duplex structure. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2008 Mar;27(3):261-78.

其他信息
假胸苷是一种研究级合成核苷类似物,主要用于核酸代谢、病毒DNA复制和合成生物学的研究。它是胸苷的C-核苷类似物,具有更高的稳定性和抗酶降解能力。该化合物的分子式为C10H14N2O5,分子量为242.23。假胸苷可与聚合酶或解旋酶抑制剂联合使用,以阻断研究模型中的病毒基因组延伸。该化合物尚未获准用于临床,仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H14N2O5
分子量
242.228562831879
精确质量
242.09
CAS号
65358-15-8
PubChem CID
445537
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
-1.6
tPSA
115.41
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
381
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CN1C=C(C(=O)NC1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)CO)O
InChi Key
AMDJRICBYOAHBZ-XLPZGREQSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H14N2O5/c1-12-3-5(9(15)11-10(12)16)7-2-6(14)8(4-13)17-7/h3,6-8,13-14H,2,4H2,1H3,(H,11,15,16)/t6-,7+,8+/m0/s1
化学名
5-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1-methylpyrimidine-2,4-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~61.17 mg/mL (~252.53 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.1283 mL 20.6415 mL 41.2831 mL
5 mM 0.8257 mL 4.1283 mL 8.2566 mL
10 mM 0.4128 mL 2.0642 mL 4.1283 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们